More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2783 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2783  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 393 aa  796    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0822  efflux transporter, RND family, MFP subunit  58.27 
 
 		 390 aa  447  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191782  normal  0.633382 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2173  efflux transporter, RND family, MFP subunit  61.48 
 
 		 393 aa  440  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3575  efflux transporter, RND family, MFP subunit  54.47 
 
 		 379 aa  402  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0183852  normal  0.158176 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4299  RND family efflux transporter MFP subunit  54.64 
 
 		 405 aa  404  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2259  efflux transporter, RND family, MFP subunit  56.92 
 
 		 397 aa  387  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.141283  normal  0.411522 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1564  RND family efflux transporter MFP subunit  51.64 
 
 		 369 aa  370  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000112948  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6106  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.59 
 
 		 378 aa  359  4e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1433  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.51 
 
 		 373 aa  358  7e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.195416  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1117  efflux transporter, RND family, MFP subunit  53.87 
 
 		 376 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0140148  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.92 
 
 		 391 aa  345  8e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000252486  hitchhiker  0.000793327 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1400  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.8 
 
 		 399 aa  318  7.999999999999999e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000127527  normal  0.840586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3019  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.47 
 
 		 378 aa  313  4.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.809394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1204  secretion protein HlyD  45.99 
 
 		 395 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.377097  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4802  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.9 
 
 		 398 aa  290  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000012488 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4132  RND family efflux transporter MFP subunit  40.27 
 
 		 384 aa  287  2.9999999999999996e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1188  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.76 
 
 		 389 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3340  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.67 
 
 		 371 aa  281  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0315517 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3228  RND family efflux transporter MFP subunit  41.99 
 
 		 378 aa  279  5e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0806  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.79 
 
 		 380 aa  279  5e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4642  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.55 
 
 		 383 aa  279  5e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.195012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0806  secretion protein HlyD  45.35 
 
 		 371 aa  278  2e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6592  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.8 
 
 		 378 aa  275  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.3 
 
 		 389 aa  270  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.374762  normal  0.534332 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0292  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.9 
 
 		 366 aa  270  2.9999999999999997e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.390239  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.96 
 
 		 375 aa  268  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.728308  normal  0.481729 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10068  Secretion protein HlyD  38.67 
 
 		 367 aa  256  6e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.305445  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0537  HlyD family multidrug resistance protein  35.86 
 
 		 381 aa  247  2e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.996753  normal  0.690705 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4863  RND family efflux transporter MFP subunit  35.71 
 
 		 360 aa  219  6e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.176323  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2953  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.55 
 
 		 360 aa  219  6e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3238  RND family efflux transporter MFP subunit  34.17 
 
 		 368 aa  213  7e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2230  RND family efflux transporter MFP subunit  33.15 
 
 		 362 aa  203  5e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5359  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.62 
 
 		 360 aa  202  9e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.954819  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1458  RND family efflux transporter MFP subunit  36.61 
 
 		 422 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.235103  hitchhiker  0.000537348 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0374  secretion protein HlyD  32.87 
 
 		 368 aa  193  4e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0795061 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5179  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.96 
 
 		 361 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472624 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2947  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.02 
 
 		 363 aa  186  9e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2066  secretion protein HlyD  33.52 
 
 		 428 aa  184  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.567226  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1728  secretion protein HlyD  32.61 
 
 		 363 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0143164  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2035  secretion protein HlyD  32.81 
 
 		 430 aa  180  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.789986  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0501  RND family efflux transporter MFP subunit  34.66 
 
 		 430 aa  179  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.76 
 
 		 395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1701  secretion protein HlyD  32.99 
 
 		 412 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.17328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4407  RND family efflux transporter MFP subunit  31.66 
 
 		 360 aa  173  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4070  secretion protein HlyD  32.4 
 
 		 405 aa  173  5e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.409958  normal  0.154431 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3440  secretion protein HlyD  33.92 
 
 		 415 aa  172  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44050  multidrug efflux pump membrane fusion protein  32 
 
 		 427 aa  172  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0389  RND family efflux transporter MFP subunit  34.45 
 
 		 434 aa  170  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2859  acridine efflux pump  33.05 
 
 		 373 aa  169  5e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.768203  normal  0.0209077 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1593  secretion protein HlyD  33.6 
 
 		 400 aa  169  6e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000034507  unclonable  0.000000261884 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2192  RND family efflux transporter MFP subunit  29.87 
 
 		 408 aa  169  6e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2181  RND family efflux transporter MFP subunit  33.85 
 
 		 412 aa  169  7e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.179253  normal  0.0467643 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0982  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.24 
 
 		 363 aa  169  8e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1074  RND family efflux transporter MFP subunit  31.18 
 
 		 405 aa  167  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.151684  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  33.65 
 
 		 405 aa  167  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2901  RND family efflux transporter MFP subunit  31.91 
 
 		 394 aa  167  4e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  30.89 
 
 		 392 aa  166  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4699  RND family efflux transporter MFP subunit  33.42 
 
 		 405 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  31.67 
 
 		 405 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2285  RND family efflux transporter MFP subunit  30.29 
 
 		 428 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134622 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  32.79 
 
 		 381 aa  166  9e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5230  RND family efflux transporter MFP subunit  33.16 
 
 		 405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0639393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3579  putative transmembrane multidrug efflux system transmembrane protein  30.55 
 
 		 414 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4918  RND family efflux transporter MFP subunit  33.42 
 
 		 405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.890764  normal  0.731397 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3014  secretion protein HlyD  33.42 
 
 		 405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5352  RND family efflux transporter MFP subunit  33.42 
 
 		 405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3714  RND family efflux transporter MFP subunit  31.76 
 
 		 408 aa  164  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132208 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2644  RND family efflux transporter MFP subunit  31.21 
 
 		 385 aa  164  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0295  HlyD family secretion protein  33.42 
 
 		 405 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0910  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.33 
 
 		 393 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0323  RND family efflux transporter MFP subunit  31.46 
 
 		 433 aa  163  6e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4867  cation/multidrug efflux system membrane protein  32.72 
 
 		 411 aa  162  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00045993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.65 
 
 		 424 aa  162  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.630346  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.66 
 
 		 422 aa  162  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3588  secretion protein HlyD  35.53 
 
 		 415 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4335  secretion protein HlyD  32.65 
 
 		 410 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.387273  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  30.65 
 
 		 425 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2562  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31 
 
 		 416 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0757424  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.34 
 
 		 393 aa  161  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2106  RND family efflux transporter MFP subunit  31.9 
 
 		 408 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553946  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5137  RND family efflux transporter MFP subunit  30.36 
 
 		 427 aa  160  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259338 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  31.48 
 
 		 400 aa  159  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1562  RND family efflux transporter MFP subunit  30.06 
 
 		 371 aa  159  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2893  secretion protein HlyD  30.35 
 
 		 385 aa  159  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127871  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0841  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.27 
 
 		 393 aa  159  8e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.85215 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3096  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.54 
 
 		 396 aa  159  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3238  secretion protein HlyD  27.99 
 
 		 393 aa  159  9e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  30.11 
 
 		 398 aa  159  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  32.31 
 
 		 394 aa  158  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4148  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32 
 
 		 560 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2967  secretion protein HlyD  30.73 
 
 		 413 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  33.53 
 
 		 400 aa  157  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4534  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.14 
 
 		 424 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0715  RND family efflux transporter MFP subunit  29.05 
 
 		 404 aa  158  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2140  RND family efflux transporter MFP subunit  29.61 
 
 		 393 aa  157  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1466  RND family efflux transporter MFP subunit  32.39 
 
 		 409 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3063  secretion protein HlyD  32.11 
 
 		 412 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000572272  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1840  RND family efflux transporter MFP subunit  32.39 
 
 		 409 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3353  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.3 
 
 		 396 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462389  normal  0.0123154 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.22 
 
 		 433 aa  157  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>