More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4132 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4132  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 384 aa  767    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1188  efflux transporter, RND family, MFP subunit  55.5 
 
 		 389 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.37 
 
 		 389 aa  400  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.374762  normal  0.534332 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.67 
 
 		 375 aa  379  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.728308  normal  0.481729 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4802  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.14 
 
 		 398 aa  355  6.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000012488 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3575  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.63 
 
 		 379 aa  295  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0183852  normal  0.158176 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4299  RND family efflux transporter MFP subunit  42.25 
 
 		 405 aa  294  2e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1564  RND family efflux transporter MFP subunit  40.92 
 
 		 369 aa  289  4e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000112948  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2259  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.15 
 
 		 397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.141283  normal  0.411522 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2173  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.92 
 
 		 393 aa  279  8e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1433  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.05 
 
 		 373 aa  273  5.000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.195416  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0822  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.01 
 
 		 390 aa  273  5.000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191782  normal  0.633382 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1117  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.43 
 
 		 376 aa  272  9e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0140148  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2783  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.27 
 
 		 393 aa  263  6e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987855 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1204  secretion protein HlyD  39.73 
 
 		 395 aa  260  3e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.377097  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3019  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.5 
 
 		 378 aa  258  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.809394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0806  secretion protein HlyD  42.69 
 
 		 371 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10068  Secretion protein HlyD  40.5 
 
 		 367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.305445  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6106  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.71 
 
 		 378 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4642  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.79 
 
 		 383 aa  249  4e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.195012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.62 
 
 		 391 aa  246  6e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000252486  hitchhiker  0.000793327 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6592  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.74 
 
 		 378 aa  246  6.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0292  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.63 
 
 		 366 aa  238  2e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.390239  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1400  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.01 
 
 		 399 aa  230  2e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000127527  normal  0.840586 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0537  HlyD family multidrug resistance protein  36.89 
 
 		 381 aa  231  2e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.996753  normal  0.690705 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3228  RND family efflux transporter MFP subunit  38.42 
 
 		 378 aa  229  6e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0806  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.58 
 
 		 380 aa  228  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3340  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.36 
 
 		 371 aa  222  7e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0315517 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3238  RND family efflux transporter MFP subunit  33.87 
 
 		 368 aa  220  3e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2953  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.07 
 
 		 360 aa  211  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4863  RND family efflux transporter MFP subunit  35.61 
 
 		 360 aa  208  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.176323  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2947  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.13 
 
 		 363 aa  189  5.999999999999999e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2230  RND family efflux transporter MFP subunit  29.81 
 
 		 362 aa  189  9e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3063  secretion protein HlyD  34.85 
 
 		 412 aa  189  9e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000572272  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1728  secretion protein HlyD  29.14 
 
 		 363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0143164  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5359  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.77 
 
 		 360 aa  184  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.954819  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0374  secretion protein HlyD  29.71 
 
 		 368 aa  182  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0795061 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1701  secretion protein HlyD  31.12 
 
 		 412 aa  180  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.17328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4407  RND family efflux transporter MFP subunit  30.06 
 
 		 360 aa  180  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0982  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.54 
 
 		 363 aa  179  5.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5179  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.83 
 
 		 361 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472624 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1458  RND family efflux transporter MFP subunit  30.99 
 
 		 422 aa  176  8e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.235103  hitchhiker  0.000537348 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  31.69 
 
 		 392 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  30.83 
 
 		 381 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  31.05 
 
 		 395 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  28.8 
 
 		 405 aa  171  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3586  RND family efflux transporter MFP subunit  29.57 
 
 		 386 aa  171  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4070  secretion protein HlyD  32.32 
 
 		 405 aa  171  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.409958  normal  0.154431 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44050  multidrug efflux pump membrane fusion protein  31.31 
 
 		 427 aa  170  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4006  RND family efflux transporter MFP subunit  29.57 
 
 		 386 aa  170  5e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  30.95 
 
 		 391 aa  169  7e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.45 
 
 		 433 aa  168  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.58 
 
 		 395 aa  167  4e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  32.11 
 
 		 395 aa  167  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  32.11 
 
 		 395 aa  167  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3715  RND family efflux transporter MFP subunit  32.61 
 
 		 382 aa  166  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.970475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  32.11 
 
 		 388 aa  166  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3800  RND family efflux transporter MFP subunit  29.95 
 
 		 404 aa  164  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00481  multidrug resistance protein  30.5 
 
 		 434 aa  164  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  30.81 
 
 		 400 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3440  secretion protein HlyD  31.94 
 
 		 415 aa  163  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0996  RND family efflux transporter MFP subunit  31.03 
 
 		 397 aa  163  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.91 
 
 		 422 aa  162  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  30.81 
 
 		 381 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3719  RND family efflux transporter MFP subunit  30.63 
 
 		 353 aa  162  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.81 
 
 		 381 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4251  RND family efflux transporter MFP subunit  30.81 
 
 		 381 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.397426  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  33.15 
 
 		 412 aa  162  9e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.58 
 
 		 411 aa  162  9e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  31.75 
 
 		 405 aa  162  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0647  RND family efflux transporter MFP subunit  30.54 
 
 		 425 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5503  RND family efflux transporter MFP subunit  30.54 
 
 		 445 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00522591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3923  multidrug efflux system protein  31.97 
 
 		 387 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0688  RND family efflux transporter MFP subunit  30.89 
 
 		 431 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.921638  normal  0.624256 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5599  secretion protein HlyD  29.92 
 
 		 418 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5963  RND family efflux transporter MFP subunit  29.92 
 
 		 418 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0363452 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2859  acridine efflux pump  30.71 
 
 		 373 aa  159  5e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.768203  normal  0.0209077 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.3 
 
 		 410 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  30.27 
 
 		 425 aa  159  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1990  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.96 
 
 		 392 aa  159  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759025  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4007  secretion protein HlyD  30.98 
 
 		 386 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430649  normal  0.0665893 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1218  secretion protein HlyD  32.22 
 
 		 402 aa  158  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.902251  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.75 
 
 		 393 aa  158  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6463  RND family efflux transporter MFP subunit  29.66 
 
 		 418 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984064  normal  0.35165 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  29.87 
 
 		 398 aa  157  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.35 
 
 		 386 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003895  membrane fusion protein of RND family multidrug efflux pump  28.72 
 
 		 379 aa  157  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1074  RND family efflux transporter MFP subunit  30.53 
 
 		 405 aa  157  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.151684  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1836  multidrug efflux transport protein EefA  29.89 
 
 		 373 aa  156  6e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000609578 
 
 
-
 
NC_003296  RS01888  drug efflux lipoprotein  32.34 
 
 		 409 aa  156  7e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.524066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3241  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.35 
 
 		 398 aa  156  7e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01880  Secretion protein HlyD  30.99 
 
 		 383 aa  155  8e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1018  RND family efflux transporter MFP subunit  29.35 
 
 		 420 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0501  RND family efflux transporter MFP subunit  30.41 
 
 		 430 aa  155  8e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.23 
 
 		 383 aa  155  8e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000507809  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  30.48 
 
 		 400 aa  155  9e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2050  secretion protein HlyD  27.89 
 
 		 426 aa  155  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0828  RND family efflux transporter MFP subunit  27.39 
 
 		 396 aa  155  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0680  RND family efflux transporter MFP subunit  30.16 
 
 		 420 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.557778  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.64 
 
 		 403 aa  155  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>