More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1564 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1564  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 369 aa  744    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000112948  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1433  efflux transporter, RND family, MFP subunit  63.23 
 
 		 373 aa  421  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.195416  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1117  efflux transporter, RND family, MFP subunit  62.83 
 
 		 376 aa  420  1e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0140148  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2259  efflux transporter, RND family, MFP subunit  53.46 
 
 		 397 aa  390  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.141283  normal  0.411522 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4299  RND family efflux transporter MFP subunit  52.34 
 
 		 405 aa  386  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  54.46 
 
 		 391 aa  375  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000252486  hitchhiker  0.000793327 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1204  secretion protein HlyD  50.94 
 
 		 395 aa  370  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.377097  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3575  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.41 
 
 		 379 aa  368  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0183852  normal  0.158176 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1400  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.05 
 
 		 399 aa  342  5e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000127527  normal  0.840586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2783  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.64 
 
 		 393 aa  339  4e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0822  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.68 
 
 		 390 aa  332  7.000000000000001e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191782  normal  0.633382 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2173  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.84 
 
 		 393 aa  323  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6106  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.34 
 
 		 378 aa  322  9.000000000000001e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0806  secretion protein HlyD  52.73 
 
 		 371 aa  318  7e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3019  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.38 
 
 		 378 aa  305  7e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.809394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4132  RND family efflux transporter MFP subunit  40.92 
 
 		 384 aa  289  4e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3228  RND family efflux transporter MFP subunit  43.82 
 
 		 378 aa  266  2.9999999999999995e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1188  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.44 
 
 		 389 aa  259  4e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.22 
 
 		 375 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.728308  normal  0.481729 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0806  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.6 
 
 		 380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0292  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.33 
 
 		 366 aa  247  2e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.390239  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4802  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.36 
 
 		 398 aa  247  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000012488 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10068  Secretion protein HlyD  35.66 
 
 		 367 aa  243  5e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.305445  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.89 
 
 		 389 aa  242  7e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.374762  normal  0.534332 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6592  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.7 
 
 		 378 aa  219  7.999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3340  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.19 
 
 		 371 aa  218  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0315517 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4642  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.36 
 
 		 383 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.195012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0537  HlyD family multidrug resistance protein  37.04 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.996753  normal  0.690705 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4863  RND family efflux transporter MFP subunit  34.97 
 
 		 360 aa  191  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.176323  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2953  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.12 
 
 		 360 aa  189  8e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  32.96 
 
 		 386 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5359  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.12 
 
 		 360 aa  178  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.954819  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3238  RND family efflux transporter MFP subunit  31.28 
 
 		 368 aa  176  7e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.34 
 
 		 395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5179  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.96 
 
 		 361 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472624 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6463  RND family efflux transporter MFP subunit  33.86 
 
 		 418 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984064  normal  0.35165 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5599  secretion protein HlyD  33.86 
 
 		 418 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5963  RND family efflux transporter MFP subunit  33.86 
 
 		 418 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0363452 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1458  RND family efflux transporter MFP subunit  34.56 
 
 		 422 aa  172  9e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.235103  hitchhiker  0.000537348 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0374  secretion protein HlyD  31.32 
 
 		 368 aa  171  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0795061 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2050  secretion protein HlyD  31.06 
 
 		 426 aa  169  5e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4070  secretion protein HlyD  33.54 
 
 		 405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.409958  normal  0.154431 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6992  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.39 
 
 		 415 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  31.87 
 
 		 392 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3800  RND family efflux transporter MFP subunit  29.44 
 
 		 404 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.08 
 
 		 383 aa  161  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000507809  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  32.49 
 
 		 381 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.11 
 
 		 393 aa  160  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  34.81 
 
 		 394 aa  159  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109026  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0497  RND family efflux transporter MFP subunit  33.61 
 
 		 423 aa  159  8e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479969  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  31.08 
 
 		 405 aa  158  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.06 
 
 		 405 aa  158  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2947  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.08 
 
 		 363 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.89 
 
 		 422 aa  156  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0906  RND family efflux transporter MFP subunit  31.58 
 
 		 391 aa  156  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1728  secretion protein HlyD  29.36 
 
 		 363 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0143164  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.75 
 
 		 433 aa  156  7e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1593  secretion protein HlyD  32.24 
 
 		 400 aa  155  9e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000034507  unclonable  0.000000261884 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44050  multidrug efflux pump membrane fusion protein  31.9 
 
 		 427 aa  155  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  33.12 
 
 		 395 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  33.12 
 
 		 395 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2361  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.02 
 
 		 372 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.320362 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  33.12 
 
 		 388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3499  RND family efflux transporter MFP subunit  32.49 
 
 		 395 aa  153  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0344164  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5483  HlyD family secretion protein  34.82 
 
 		 396 aa  152  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0155996  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1836  multidrug efflux transport protein EefA  29.67 
 
 		 373 aa  152  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000609578 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  30.73 
 
 		 400 aa  151  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4407  RND family efflux transporter MFP subunit  31.31 
 
 		 360 aa  152  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3560  acriflavine resistance protein E  31.06 
 
 		 385 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0550362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0932  precursor of drug resistance protein  30.52 
 
 		 396 aa  150  3e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3699  RND family efflux transporter MFP subunit  31.27 
 
 		 390 aa  150  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4007  secretion protein HlyD  29.51 
 
 		 386 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430649  normal  0.0665893 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  31.09 
 
 		 394 aa  150  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0828  RND family efflux transporter MFP subunit  30.52 
 
 		 396 aa  150  4e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3648  acriflavine resistance protein E  31.06 
 
 		 385 aa  150  4e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.444601  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0441  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.06 
 
 		 385 aa  150  5e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4582  acriflavine resistance protein E  31.06 
 
 		 385 aa  149  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  0.314671 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0441  RND family efflux transporter MFP subunit  31.06 
 
 		 385 aa  150  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4873  multidrug efflux system protein MdtE  29.83 
 
 		 385 aa  150  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1701  secretion protein HlyD  31.37 
 
 		 412 aa  149  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.17328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3458  acriflavine resistance protein E  31.06 
 
 		 385 aa  150  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000310651  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4061  RND family efflux transporter MFP subunit  30.87 
 
 		 383 aa  150  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000265031  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3750  acriflavine resistance protein E  31.06 
 
 		 385 aa  150  5e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00329123  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3911  multidrug efflux system protein MdtE  29.83 
 
 		 385 aa  150  5e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03361  multidrug resistance efflux transporter  29.83 
 
 		 385 aa  149  6e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0200  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.83 
 
 		 385 aa  149  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3999  multidrug efflux system protein MdtE  29.83 
 
 		 385 aa  149  6e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3063  secretion protein HlyD  31.69 
 
 		 412 aa  149  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000572272  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3816  multidrug efflux system protein MdtE  29.83 
 
 		 385 aa  149  6e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0409403 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3715  multidrug efflux system protein MdtE  29.83 
 
 		 385 aa  149  6e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00203932  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0204  multidrug efflux system protein MdtE  29.83 
 
 		 385 aa  149  6e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0378135 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03314  hypothetical protein  29.83 
 
 		 385 aa  149  6e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3863  RND family efflux transporter MFP subunit  30.08 
 
 		 382 aa  149  8e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0982  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.54 
 
 		 363 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3241  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.32 
 
 		 398 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1218  secretion protein HlyD  33.81 
 
 		 402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.902251  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03123  cytoplasmic membrane lipoprotein  30.79 
 
 		 385 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0647  RND family efflux transporter MFP subunit  30.94 
 
 		 425 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03074  hypothetical protein  30.79 
 
 		 385 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0692  secretion protein HlyD  31.22 
 
 		 412 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000417324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>