More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0822 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0822  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 390 aa  787    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191782  normal  0.633382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2783  efflux transporter, RND family, MFP subunit  58.27 
 
 		 393 aa  426  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2173  efflux transporter, RND family, MFP subunit  55.62 
 
 		 393 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4299  RND family efflux transporter MFP subunit  52.73 
 
 		 405 aa  381  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2259  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.89 
 
 		 397 aa  365  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.141283  normal  0.411522 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3575  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.32 
 
 		 379 aa  363  3e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0183852  normal  0.158176 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1564  RND family efflux transporter MFP subunit  47.68 
 
 		 369 aa  346  5e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000112948  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1117  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.36 
 
 		 376 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0140148  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.37 
 
 		 391 aa  325  7e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000252486  hitchhiker  0.000793327 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1433  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.86 
 
 		 373 aa  324  1e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.195416  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6106  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.99 
 
 		 378 aa  315  7e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1400  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.76 
 
 		 399 aa  299  5e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000127527  normal  0.840586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3019  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.6 
 
 		 378 aa  296  4e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.809394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1188  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.62 
 
 		 389 aa  286  4e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1204  secretion protein HlyD  43.68 
 
 		 395 aa  285  9e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.377097  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4132  RND family efflux transporter MFP subunit  42.07 
 
 		 384 aa  283  3.0000000000000004e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.91 
 
 		 375 aa  280  4e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.728308  normal  0.481729 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4642  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.91 
 
 		 383 aa  277  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.195012  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10068  Secretion protein HlyD  39.61 
 
 		 367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.305445  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0806  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.28 
 
 		 380 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.44 
 
 		 389 aa  273  3e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.374762  normal  0.534332 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4802  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.92 
 
 		 398 aa  271  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000012488 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0292  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.26 
 
 		 366 aa  265  1e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.390239  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0806  secretion protein HlyD  42.42 
 
 		 371 aa  257  3e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3340  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.5 
 
 		 371 aa  255  8e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0315517 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3228  RND family efflux transporter MFP subunit  39.01 
 
 		 378 aa  249  6e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6592  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.37 
 
 		 378 aa  239  5.999999999999999e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0537  HlyD family multidrug resistance protein  34.68 
 
 		 381 aa  227  3e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.996753  normal  0.690705 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1458  RND family efflux transporter MFP subunit  37.75 
 
 		 422 aa  212  9e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.235103  hitchhiker  0.000537348 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4863  RND family efflux transporter MFP subunit  36.68 
 
 		 360 aa  197  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.176323  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2953  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.62 
 
 		 360 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3238  RND family efflux transporter MFP subunit  32.53 
 
 		 368 aa  196  5.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2230  RND family efflux transporter MFP subunit  31.27 
 
 		 362 aa  193  4e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5359  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.86 
 
 		 360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.954819  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1728  secretion protein HlyD  33.33 
 
 		 363 aa  182  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0143164  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0374  secretion protein HlyD  33.03 
 
 		 368 aa  178  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0795061 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4070  secretion protein HlyD  34.25 
 
 		 405 aa  177  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.409958  normal  0.154431 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3829  secretion protein HlyD  32.35 
 
 		 387 aa  176  8e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.192626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4407  RND family efflux transporter MFP subunit  31.55 
 
 		 360 aa  175  9e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5179  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.06 
 
 		 361 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472624 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2106  RND family efflux transporter MFP subunit  32.56 
 
 		 408 aa  169  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553946  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1792  secretion protein HlyD  33.43 
 
 		 412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.567297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2947  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.89 
 
 		 363 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4699  RND family efflux transporter MFP subunit  32.47 
 
 		 405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1112  transmembrane multidrug efflux system transmembrane protein  32.06 
 
 		 438 aa  164  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.794261  normal  0.680549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0982  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.7 
 
 		 363 aa  164  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5230  RND family efflux transporter MFP subunit  32.22 
 
 		 405 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0639393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3014  secretion protein HlyD  32.47 
 
 		 405 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5352  RND family efflux transporter MFP subunit  32.47 
 
 		 405 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4918  RND family efflux transporter MFP subunit  32.47 
 
 		 405 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.890764  normal  0.731397 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0295  HlyD family secretion protein  31.96 
 
 		 405 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2066  secretion protein HlyD  30.36 
 
 		 428 aa  160  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.567226  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2144  multidrug efflux pump BpeE  33.82 
 
 		 406 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0827  multidrug efflux pump BpeE  33.82 
 
 		 406 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.747872  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4225  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.03 
 
 		 436 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1466  RND family efflux transporter MFP subunit  33.82 
 
 		 409 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4335  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.03 
 
 		 436 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.514202  normal  0.256174 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1840  RND family efflux transporter MFP subunit  33.82 
 
 		 409 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0849  RND efflux system membrane fusion protein  33.04 
 
 		 418 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.8894  decreased coverage  0.000437743 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0416  multidrug efflux pump BpeE  33.82 
 
 		 406 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0041  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.83 
 
 		 378 aa  158  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89791  normal  0.261432 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1088  RND family efflux transporter MFP subunit  29.63 
 
 		 392 aa  158  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1593  secretion protein HlyD  32.8 
 
 		 400 aa  157  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000034507  unclonable  0.000000261884 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4335  secretion protein HlyD  31.77 
 
 		 410 aa  157  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.387273  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0513  multidrug efflux pump BpeE  33.82 
 
 		 409 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  31.69 
 
 		 391 aa  156  6e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4534  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.3 
 
 		 424 aa  156  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1836  multidrug efflux transport protein EefA  30.08 
 
 		 373 aa  155  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000609578 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1701  secretion protein HlyD  31.62 
 
 		 412 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.17328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  30.81 
 
 		 405 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2361  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.7 
 
 		 372 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.320362 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0715  RND family efflux transporter MFP subunit  29.97 
 
 		 404 aa  153  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4867  cation/multidrug efflux system membrane protein  32.56 
 
 		 411 aa  153  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00045993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2659  secretion protein HlyD  29.85 
 
 		 417 aa  152  8e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5137  RND family efflux transporter MFP subunit  29.68 
 
 		 427 aa  151  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259338 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2293  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.23 
 
 		 430 aa  151  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5483  HlyD family secretion protein  32.65 
 
 		 396 aa  151  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0155996  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2859  acridine efflux pump  29.44 
 
 		 373 aa  151  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.768203  normal  0.0209077 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4634  RND family efflux transporter MFP subunit  30.05 
 
 		 429 aa  150  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.562661  normal  0.24851 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0906  RND family efflux transporter MFP subunit  29.38 
 
 		 391 aa  149  6e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2891  RND efflux system membrane fusion protein  33.05 
 
 		 391 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.81851  normal  0.755183 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.83 
 
 		 422 aa  149  7e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1992  secretion protein HlyD family protein  30.45 
 
 		 418 aa  149  7e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.125579  normal  0.0134883 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.97 
 
 		 395 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3373  RND family efflux transporter MFP subunit  31.09 
 
 		 405 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0035  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29 
 
 		 404 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0142  RND family efflux transporter MFP subunit  29.04 
 
 		 389 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0327  RND family efflux transporter MFP subunit  31.55 
 
 		 376 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.270074 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3579  putative transmembrane multidrug efflux system transmembrane protein  29.43 
 
 		 414 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0501  RND family efflux transporter MFP subunit  30.37 
 
 		 430 aa  149  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1361  HlyD family secretion protein  30.11 
 
 		 387 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.70378  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1891  RND family efflux transporter MFP subunit  28.34 
 
 		 391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.497754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1362  RND family efflux transporter MFP subunit  33.04 
 
 		 418 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.168892  decreased coverage  0.00389749 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2644  RND family efflux transporter MFP subunit  30.79 
 
 		 385 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3096  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.53 
 
 		 396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.56 
 
 		 433 aa  147  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3714  RND family efflux transporter MFP subunit  30.51 
 
 		 408 aa  147  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132208 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.83 
 
 		 381 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4251  RND family efflux transporter MFP subunit  29.83 
 
 		 381 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.397426  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1939  RND family efflux transporter MFP subunit  29.92 
 
 		 418 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0238209  hitchhiker  0.000755342 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>