More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3155 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3445  efflux transporter, RND family, MFP subunit  94.79 
 
 		 403 aa  731    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3155  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 403 aa  813    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6029  acriflavin resistance protein A  53.04 
 
 		 411 aa  421  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1870  secretion protein HlyD  46.41 
 
 		 428 aa  309  5e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2238  secretion protein HlyD  45.69 
 
 		 431 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1886  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.35 
 
 		 379 aa  273  6e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0158662  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4046  RND family efflux transporter MFP subunit  39.89 
 
 		 382 aa  268  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  39.79 
 
 		 392 aa  268  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2614  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.62 
 
 		 405 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.34834  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3837  RND family efflux transporter MFP subunit  40.05 
 
 		 382 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  40.05 
 
 		 382 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.28 
 
 		 395 aa  263  3e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  39.84 
 
 		 425 aa  263  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  39.36 
 
 		 386 aa  263  4e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.24 
 
 		 381 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4251  RND family efflux transporter MFP subunit  38.24 
 
 		 381 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.397426  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2050  secretion protein HlyD  39.9 
 
 		 426 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  37.97 
 
 		 381 aa  260  4e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4693  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  39.79 
 
 		 382 aa  259  6e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3715  RND family efflux transporter MFP subunit  40.1 
 
 		 382 aa  258  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.970475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  41.33 
 
 		 395 aa  257  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3911  multidrug efflux system protein MdtE  38.79 
 
 		 385 aa  256  4e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3553  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  40.37 
 
 		 378 aa  256  7e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03361  multidrug resistance efflux transporter  38.52 
 
 		 385 aa  255  9e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0200  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.52 
 
 		 385 aa  255  9e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3999  multidrug efflux system protein MdtE  38.52 
 
 		 385 aa  255  9e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3816  multidrug efflux system protein MdtE  38.52 
 
 		 385 aa  255  9e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0409403 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03314  hypothetical protein  38.52 
 
 		 385 aa  255  9e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3715  multidrug efflux system protein MdtE  38.52 
 
 		 385 aa  255  9e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00203932  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0204  multidrug efflux system protein MdtE  38.52 
 
 		 385 aa  255  9e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0378135 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  41.84 
 
 		 395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.15 
 
 		 403 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  41.84 
 
 		 388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  41.84 
 
 		 395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4337  RND family efflux transporter MFP subunit  39.62 
 
 		 384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.235617 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4873  multidrug efflux system protein MdtE  38.26 
 
 		 385 aa  253  3e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2638  RND family efflux transporter MFP subunit  39.74 
 
 		 424 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0131  RND family efflux transporter MFP subunit  39.63 
 
 		 383 aa  253  6e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000302028  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1386  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.35 
 
 		 384 aa  252  7e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4061  RND family efflux transporter MFP subunit  38.85 
 
 		 383 aa  252  7e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000265031  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1018  RND family efflux transporter MFP subunit  38.99 
 
 		 420 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  39.13 
 
 		 405 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0090  RND family efflux transporter MFP subunit  37.77 
 
 		 381 aa  251  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4427  RND family efflux transporter MFP subunit  38.81 
 
 		 384 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123796 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0680  RND family efflux transporter MFP subunit  39.26 
 
 		 420 aa  251  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.557778  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6463  RND family efflux transporter MFP subunit  38.58 
 
 		 418 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984064  normal  0.35165 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3800  RND family efflux transporter MFP subunit  38.02 
 
 		 404 aa  251  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0315  RND family efflux transporter MFP subunit  38.73 
 
 		 420 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2445  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  38.73 
 
 		 420 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0058  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  38.73 
 
 		 420 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0523497  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003895  membrane fusion protein of RND family multidrug efflux pump  35.83 
 
 		 379 aa  250  3e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0688  RND family efflux transporter MFP subunit  38.9 
 
 		 431 aa  250  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.921638  normal  0.624256 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0610  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  38.73 
 
 		 420 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0854  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  38.73 
 
 		 420 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719076  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2656  RND family efflux transporter MFP subunit  41.24 
 
 		 432 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444245  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1026  RND family efflux transporter MFP subunit  38.81 
 
 		 384 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4007  secretion protein HlyD  38.77 
 
 		 386 aa  249  4e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430649  normal  0.0665893 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0859  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  38.73 
 
 		 420 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1999  secretion protein HlyD  39.58 
 
 		 424 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.931394  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2609  RND family efflux transporter MFP subunit  39.58 
 
 		 424 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2529  RND family efflux transporter MFP subunit  40.96 
 
 		 432 aa  249  5e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.210606 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  40.32 
 
 		 400 aa  249  6e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5837  secretion protein HlyD  39.41 
 
 		 412 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91911  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0943  RND family efflux transporter MFP subunit  40.64 
 
 		 397 aa  249  6e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.74 
 
 		 422 aa  249  7e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5599  secretion protein HlyD  37.89 
 
 		 418 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5963  RND family efflux transporter MFP subunit  37.89 
 
 		 418 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0363452 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6204  RND family efflux transporter MFP subunit  39.41 
 
 		 412 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103192  hitchhiker  0.00610274 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3586  RND family efflux transporter MFP subunit  40.05 
 
 		 386 aa  246  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  38.65 
 
 		 405 aa  246  4.9999999999999997e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1836  multidrug efflux transport protein EefA  40.32 
 
 		 373 aa  246  6e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000609578 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.68 
 
 		 433 aa  246  6e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4006  RND family efflux transporter MFP subunit  40.05 
 
 		 386 aa  246  6e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  42.24 
 
 		 386 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000318769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0152  RND family efflux transporter MFP subunit  37.27 
 
 		 385 aa  246  8e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3699  RND family efflux transporter MFP subunit  39.58 
 
 		 390 aa  245  8e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  39.36 
 
 		 381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01888  drug efflux lipoprotein  39.71 
 
 		 409 aa  244  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.524066  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.24 
 
 		 386 aa  244  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01880  Secretion protein HlyD  40.75 
 
 		 383 aa  244  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.47 
 
 		 393 aa  243  3e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0506  acriflavine resistance protein A  39.29 
 
 		 409 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.951175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6607  HlyD family secretion protein  39.83 
 
 		 418 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.032922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6680  RND family efflux transporter MFP subunit  39.83 
 
 		 412 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231623  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0395  acriflavine resistance protein A  39.29 
 
 		 409 aa  242  7.999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00414  multidrug efflux system  39.03 
 
 		 397 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3147  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.03 
 
 		 397 aa  241  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.035839  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  40.05 
 
 		 400 aa  241  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3153  RND family efflux transporter MFP subunit  39.03 
 
 		 397 aa  241  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0539  acriflavine resistance protein A  39.03 
 
 		 397 aa  241  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0553  acriflavine resistance protein A  39.03 
 
 		 409 aa  241  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3047  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.95 
 
 		 396 aa  241  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.376069  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  38.76 
 
 		 394 aa  241  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00419  hypothetical protein  39.03 
 
 		 397 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0497  acriflavine resistance protein A  39.03 
 
 		 397 aa  241  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3493  RND family efflux transporter MFP subunit  37.34 
 
 		 381 aa  241  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3863  RND family efflux transporter MFP subunit  37.7 
 
 		 382 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  40.11 
 
 		 394 aa  240  4e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109026  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2721  RND family efflux transporter MFP subunit  41.36 
 
 		 389 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938763  normal  0.792489 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3241  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.13 
 
 		 398 aa  238  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>