More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0171 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0171  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 378 aa  753    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2624  RND family efflux transporter MFP subunit  43.7 
 
 		 357 aa  282  6.000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3333  RND family efflux transporter MFP subunit  36.11 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0988  secretion protein HlyD  35.75 
 
 		 415 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1680  RND family efflux transporter MFP subunit  35.53 
 
 		 360 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.560813 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4621  RND family efflux transporter MFP subunit  31.25 
 
 		 386 aa  211  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2743  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.51 
 
 		 358 aa  210  4e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.125422  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0618  RND family efflux transporter MFP subunit  32.18 
 
 		 387 aa  202  6e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1163  efflux transporter  37.8 
 
 		 383 aa  196  6e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.707562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0520  secretion protein HlyD  32.28 
 
 		 356 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0868  RND family efflux transporter MFP subunit  30.82 
 
 		 358 aa  186  7e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.231559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03415  hypothetical protein  31.56 
 
 		 371 aa  186  8e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0157  hypothetical protein  32.02 
 
 		 366 aa  181  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0345  RND family efflux transporter MFP subunit  29.41 
 
 		 360 aa  180  2.9999999999999997e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0426386  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2511  RND family efflux transporter MFP subunit  32.57 
 
 		 354 aa  180  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0216385  normal  0.245234 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2197  secretion protein HlyD  33.33 
 
 		 446 aa  179  7e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.378347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2570  hypothetical protein  29.84 
 
 		 370 aa  177  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.295981  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0510  RND family efflux transporter MFP subunit  31.56 
 
 		 358 aa  176  7e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0586812  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002593  membrane-fusion protein  32.17 
 
 		 372 aa  176  8e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00429247  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2051  RND family efflux transporter MFP subunit  30.56 
 
 		 364 aa  163  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0552963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2113  RND family efflux transporter MFP subunit  31.66 
 
 		 360 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01965  Secretion protein HlyD  24.4 
 
 		 401 aa  94.7  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.303602  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2224  multidrug efflux pump, membrane fusion protein  32.38 
 
 		 388 aa  94  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  31.82 
 
 		 376 aa  93.2  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0453  secretion protein HlyD family protein  25.96 
 
 		 287 aa  93.2  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0900  RND family efflux transporter MFP subunit  31.9 
 
 		 388 aa  91.3  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2243  RND family efflux transporter MFP subunit  28.22 
 
 		 376 aa  90.9  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1048  secretion protein HlyD  28.45 
 
 		 286 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233683  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1220  fusaric acid resistance protein, putative  28.03 
 
 		 286 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2557  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 356 aa  87.4  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000027885  normal  0.211023 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2607  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.19 
 
 		 422 aa  87  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.113369  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3445  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.38 
 
 		 403 aa  87  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4297  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.83 
 
 		 397 aa  86.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.430357  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  26.11 
 
 		 373 aa  86.3  8e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3155  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.48 
 
 		 403 aa  86.3  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.18 
 
 		 380 aa  85.5  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3297  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.81 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000138483  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3362  RND family efflux transporter MFP subunit  28.16 
 
 		 358 aa  84.7  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  29.68 
 
 		 381 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  27.91 
 
 		 381 aa  84  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  31 
 
 		 380 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0151  RND family efflux transporter MFP subunit  27.6 
 
 		 348 aa  83.2  0.000000000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.961169  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1650  secretion protein HlyD  26.81 
 
 		 397 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0374  secretion protein HlyD  28.4 
 
 		 368 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0795061 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.8 
 
 		 351 aa  82  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2284  secretion protein HlyD  27.95 
 
 		 403 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.831641  normal  0.154042 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2584  CzcB subfamily membrane fusion protein  24.8 
 
 		 409 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  29.18 
 
 		 365 aa  82  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0703  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.55 
 
 		 355 aa  81.3  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4407  RND family efflux transporter MFP subunit  26.23 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.15 
 
 		 380 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0787  hypothetical protein  28.79 
 
 		 420 aa  80.1  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  25.23 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0758  hypothetical protein  28.79 
 
 		 420 aa  79.7  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.89 
 
 		 362 aa  79  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1201  RND family efflux transporter MFP subunit  25.85 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0015  secretion protein, HlyD family  28.66 
 
 		 372 aa  78.2  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1044  RND family efflux transporter MFP subunit  25.85 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0078  RND family efflux transporter MFP subunit  25.85 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  25.85 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0383  RND family efflux transporter MFP subunit  25.85 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1580  RND family efflux transporter MFP subunit  25.85 
 
 		 365 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610408  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3650  secretion protein HlyD  27.44 
 
 		 397 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1496  RND family efflux transporter MFP subunit  25.85 
 
 		 365 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  26.71 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2644  RND family efflux transporter MFP subunit  28.62 
 
 		 385 aa  77.8  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5875  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.32 
 
 		 407 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  25.71 
 
 		 410 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  24.01 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1828  secretion protein HlyD  28.97 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1989  RND family efflux transporter MFP subunit  26.14 
 
 		 379 aa  77.4  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0706  secretion protein HlyD  25.17 
 
 		 366 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000331728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1177  RND family efflux transporter MFP subunit  25.17 
 
 		 417 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2034  RND family efflux transporter MFP subunit  28.64 
 
 		 403 aa  75.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4492  secretion protein HlyD  29.28 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226833 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2269  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0264196  normal  0.209917 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.94 
 
 		 372 aa  75.5  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1728  secretion protein HlyD  25.66 
 
 		 363 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0143164  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1288  RND family efflux transporter MFP subunit  25.51 
 
 		 365 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1809  secretion protein HlyD  26.18 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5179  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.03 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472624 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2808  membrane fusion protein; cation efflux system protein  28.49 
 
 		 353 aa  75.1  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3808  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.53 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0283024  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2781  RND family efflux transporter MFP subunit  26.91 
 
 		 372 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00032103  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.14 
 
 		 368 aa  74.7  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2532  secretion protein HlyD  30.95 
 
 		 363 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2071  RND efflux system membrane fusion protein  24.53 
 
 		 407 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2700  secretion protein HlyD  27.1 
 
 		 403 aa  74.7  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1216  RND family efflux transporter MFP subunit  29.05 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.152303  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  25.3 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.49 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1965  secretion protein HlyD  27.18 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.455875 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3513  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.11 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13560  hypothetical protein  27.92 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.49 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03980  HlyD family secretion protein  26.79 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79966  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0614  membrane fusion protein  25.55 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1554  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.01 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0484603  hitchhiker  0.00000015248 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1440  secretion protein HlyD  26.58 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.01 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>