More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0787 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0787  hypothetical protein  100 
 
 
420 aa  854    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0758  hypothetical protein  99.05 
 
 
420 aa  846    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1194  acriflavin resistance periplasmic protein  40.95 
 
 
380 aa  289  5.0000000000000004e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2410  RND family efflux transporter MFP subunit  36.39 
 
 
383 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5959  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.38 
 
 
383 aa  248  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.42426  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2738  putative RND efflux membrane fusion protein  35.71 
 
 
371 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254191  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7712  RND family efflux transporter MFP subunit  36.12 
 
 
383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1057  RND family efflux transporter MFP subunit  34.86 
 
 
373 aa  241  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  32.69 
 
 
376 aa  239  9e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0527  RND family efflux transporter MFP subunit  33.25 
 
 
376 aa  237  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  34.74 
 
 
365 aa  237  3e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4943  RND efflux membrane fusion protein precursor  34.47 
 
 
375 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  33.42 
 
 
381 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  37.2 
 
 
381 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4492  secretion protein HlyD  33.49 
 
 
382 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0226833 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 
372 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.77 
 
 
380 aa  231  2e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56880  putative membrane fusion protein  33.83 
 
 
376 aa  229  6e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0944  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.73 
 
 
387 aa  227  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00241764 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1650  secretion protein HlyD  33.83 
 
 
397 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1989  RND family efflux transporter MFP subunit  34.14 
 
 
379 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0091  RND family efflux transporter MFP subunit  32.37 
 
 
394 aa  225  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.666427  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.77 
 
 
363 aa  222  9e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1554  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.77 
 
 
363 aa  222  9e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0484603  hitchhiker  0.00000015248 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2243  RND family efflux transporter MFP subunit  32.68 
 
 
376 aa  222  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2781  RND family efflux transporter MFP subunit  34.61 
 
 
372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00032103  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0946  RND family efflux transporter MFP subunit  34.29 
 
 
382 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2700  secretion protein HlyD  35.25 
 
 
403 aa  219  7.999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1119  RND family efflux transporter MFP subunit  34.22 
 
 
369 aa  219  8.999999999999998e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000371819  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0907  RND efflux membrane fusion protein-related protein  34.05 
 
 
406 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2553  hypothetical protein  33.25 
 
 
368 aa  218  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2237  secretion protein HlyD  34.41 
 
 
377 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3475  secretion protein HlyD-like protein  32.02 
 
 
373 aa  216  5.9999999999999996e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.555415 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0930  RND family efflux transporter MFP subunit  32.05 
 
 
366 aa  215  9e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3650  secretion protein HlyD  33.76 
 
 
397 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3371  secretion protein HlyD  34.99 
 
 
370 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.165029  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1023  RND family efflux transporter MFP subunit  34.68 
 
 
378 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.866452  normal  0.121232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2846  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  33.92 
 
 
396 aa  213  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0090  putative multidrug transporter, HlyD family  31.77 
 
 
368 aa  213  7e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  35.66 
 
 
365 aa  211  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0975  RND family efflux transporter MFP subunit  32.7 
 
 
382 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0109715 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2284  secretion protein HlyD  34.11 
 
 
403 aa  210  4e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.831641  normal  0.154042 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1809  secretion protein HlyD  34.2 
 
 
397 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4297  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 
397 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.430357  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1497  RND family efflux transporter MFP subunit  36.36 
 
 
391 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0655249  normal  0.432966 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2802  multidrug/cation efflux pump, membrane fusion protein subunit  36.36 
 
 
391 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1089  hypothetical protein  33.65 
 
 
382 aa  205  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0767  RND family efflux transporter MFP subunit  32.3 
 
 
372 aa  204  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00075698  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  32.67 
 
 
367 aa  204  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2174  RND family efflux transporter MFP subunit  33.18 
 
 
394 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.290725  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00481  hypothetical protein  33 
 
 
368 aa  204  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.73 
 
 
370 aa  203  5e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1637  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.09 
 
 
377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1710  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.84 
 
 
377 aa  200  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0372  RND family efflux transporter MFP subunit  29.57 
 
 
372 aa  196  9e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0466  RND family efflux transporter MFP subunit  31.34 
 
 
372 aa  195  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.808341  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1154  RND family efflux transporter MFP subunit  34.8 
 
 
375 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2619  RND family efflux transporter MFP subunit  30.29 
 
 
405 aa  194  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4327  HlyD family secretion protein  29.33 
 
 
372 aa  194  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4149  RND family efflux transporter MFP subunit  31.59 
 
 
372 aa  194  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.815582  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2952  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.61 
 
 
374 aa  193  4e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0358  RND family efflux transporter MFP subunit  31.34 
 
 
372 aa  191  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3268  HlyD family secretion protein  29.81 
 
 
372 aa  191  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0109  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.54 
 
 
360 aa  172  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0110  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.54 
 
 
360 aa  172  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0706  secretion protein HlyD  28.54 
 
 
366 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000331728  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3140  secretion protein HlyD  28.64 
 
 
360 aa  155  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1288  RND family efflux transporter MFP subunit  27.3 
 
 
365 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2064  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.59 
 
 
365 aa  153  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.27 
 
 
362 aa  152  8e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1580  RND family efflux transporter MFP subunit  27.3 
 
 
365 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610408  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3679  RND family efflux transporter MFP subunit  32.59 
 
 
365 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1496  RND family efflux transporter MFP subunit  27.3 
 
 
365 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1044  RND family efflux transporter MFP subunit  27.3 
 
 
365 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1201  RND family efflux transporter MFP subunit  27.3 
 
 
365 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  27.3 
 
 
365 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0078  RND family efflux transporter MFP subunit  27.3 
 
 
365 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0383  RND family efflux transporter MFP subunit  27.3 
 
 
365 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0892  RND efflux membrane fusion protein precursor  30.97 
 
 
370 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0944  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.35 
 
 
356 aa  147  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0623416  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1580  RND family efflux transporter MFP subunit  31.79 
 
 
365 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186167  normal  0.460313 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09530  RND efflux membrane fusion protein precursor  32.02 
 
 
370 aa  143  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0614  membrane fusion protein  27.21 
 
 
404 aa  139  1e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.32 
 
 
368 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0266  RND family efflux transporter MFP subunit  24.75 
 
 
375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  26.43 
 
 
374 aa  135  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8250  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.51 
 
 
368 aa  133  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.673804  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.86 
 
 
351 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  27.93 
 
 
390 aa  132  9e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.91 
 
 
388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1050  hypothetical protein  30.59 
 
 
328 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1440  secretion protein HlyD  22.92 
 
 
376 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2132  HlyD family secretion protein  26.36 
 
 
360 aa  125  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.732379  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  23.8 
 
 
340 aa  125  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0779  RND family efflux transporter MFP subunit  26.81 
 
 
415 aa  124  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.521132  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2001  secretion protein HlyD  26.15 
 
 
375 aa  123  5e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.167131  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0364  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.76 
 
 
362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.405995  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0176  RND family efflux transporter MFP subunit  24.47 
 
 
353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.371241 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01922  RND efflux membrane fusion protein  26.65 
 
 
318 aa  120  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1681  RND family efflux transporter MFP subunit  27.96 
 
 
434 aa  119  7.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0776882  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>