287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3507 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3507  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 421 aa  843    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568774  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4702  RND family efflux transporter MFP subunit  40.48 
 
 		 431 aa  332  6e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0328  ABC transporter permease  41.73 
 
 		 434 aa  329  7e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.33045 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0954  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.2 
 
 		 415 aa  278  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0680  RND family efflux transporter MFP subunit  33.18 
 
 		 417 aa  268  1e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0364598 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4588  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.57 
 
 		 415 aa  253  3e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00044707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4837  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.11 
 
 		 415 aa  251  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1331  RND family efflux transporter MFP subunit  32.7 
 
 		 412 aa  240  2.9999999999999997e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100786  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2601  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.02 
 
 		 440 aa  209  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2477  RND family efflux transporter MFP subunit  26.7 
 
 		 420 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2575  RND family efflux transporter MFP subunit  26.98 
 
 		 420 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3005  RND family efflux transporter MFP subunit  26.43 
 
 		 420 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000258393  hitchhiker  0.0000478824 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1901  RND family efflux transporter MFP subunit  25.57 
 
 		 417 aa  89.4  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637484 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.46 
 
 		 397 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0774  RND family efflux transporter MFP subunit  21.96 
 
 		 418 aa  79.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.479896  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0366  secretion protein HlyD  24.46 
 
 		 437 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.93288  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2352  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.36 
 
 		 419 aa  77.8  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0918313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4176  hypothetical protein  23.63 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2118  RND family efflux transporter MFP subunit  22.44 
 
 		 418 aa  76.6  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5609  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.71 
 
 		 414 aa  73.2  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.53 
 
 		 375 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.37122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03125  ABC transporter permease  23.88 
 
 		 392 aa  72  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5576  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.23 
 
 		 353 aa  71.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1693  RND family efflux transporter MFP subunit  24.26 
 
 		 421 aa  71.2  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000207824  decreased coverage  0.00534917 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3430  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.6 
 
 		 376 aa  69.7  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.516107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  23.91 
 
 		 360 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.45 
 
 		 407 aa  68.6  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  21.8 
 
 		 421 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.8 
 
 		 362 aa  67  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0558  secretion protein HlyD  23.31 
 
 		 360 aa  67  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177986  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01965  Secretion protein HlyD  25.33 
 
 		 401 aa  66.6  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.303602  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0721  RND family efflux transporter MFP subunit  26.01 
 
 		 420 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.8 
 
 		 462 aa  66.2  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.87 
 
 		 476 aa  65.1  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.292175  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3365  RND family efflux transporter MFP subunit  22.79 
 
 		 420 aa  64.7  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0861  RND family efflux transporter MFP subunit  27.03 
 
 		 420 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3500  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.53 
 
 		 425 aa  64.3  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.226045 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3262  RND family efflux transporter MFP subunit  26.32 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.933024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3161  RND family efflux transporter MFP subunit  26.32 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0309  HlyD family secretion protein  21.01 
 
 		 416 aa  63.5  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0376524 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4074  RND family efflux transporter MFP subunit  24.11 
 
 		 420 aa  63.2  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  25.42 
 
 		 335 aa  62.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2238  RND family efflux transporter MFP subunit  25.15 
 
 		 421 aa  62.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.811605  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0572  RND family efflux transporter MFP subunit  25.44 
 
 		 423 aa  62.4  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2405  RND family efflux transporter MFP subunit  29.13 
 
 		 443 aa  62  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.27 
 
 		 453 aa  60.8  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0539  RND family efflux transporter MFP subunit  22.54 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  23.41 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02540  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.51 
 
 		 481 aa  60.1  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0229793  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1569  RND family efflux transporter MFP subunit  26.05 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3724  RND family efflux transporter MFP subunit  24.05 
 
 		 420 aa  59.7  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.376754 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3927  RND family efflux transporter MFP subunit  25.24 
 
 		 392 aa  59.7  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0962  secretion protein HlyD  22.31 
 
 		 405 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.255558  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1029  RND family efflux transporter MFP subunit  23.82 
 
 		 435 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.981321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.12 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.53 
 
 		 350 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000250075  normal  0.807389 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0176  RND family efflux transporter MFP subunit  24.22 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371241 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5197  hypothetical protein  24.92 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0742487 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1713  multidrug resistance efflux pump-like protein  25.28 
 
 		 392 aa  58.9  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.254154  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0916  efflux transporter  23.33 
 
 		 396 aa  58.2  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0996  RND family efflux transporter MFP subunit  24.08 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0283  RND family efflux transporter MFP subunit  23.02 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3561  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.33 
 
 		 420 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.306068  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  22.19 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0980  RND family efflux transporter MFP subunit  24.68 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  24.48 
 
 		 365 aa  57.4  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.21 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.152554 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.94 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1839  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.42 
 
 		 420 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1515  RND family efflux transporter MFP subunit  26.09 
 
 		 405 aa  57  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3412  secretion protein HlyD  21.33 
 
 		 443 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0866166  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2514  acriflavin resistance protein B  23.43 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.825279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.14 
 
 		 372 aa  56.2  0.0000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0273609  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1017  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.75 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.64 
 
 		 435 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3749  RND family efflux transporter MFP subunit  24.44 
 
 		 340 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  25.33 
 
 		 349 aa  55.8  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4563  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.42 
 
 		 426 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3343  RND family efflux transporter MFP subunit  23.75 
 
 		 435 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  20.66 
 
 		 376 aa  55.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  22.05 
 
 		 421 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8250  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.14 
 
 		 368 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.673804  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3476  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.63 
 
 		 382 aa  55.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0307  RND family efflux transporter MFP subunit  24.16 
 
 		 413 aa  55.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.240103  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01120  membrane fusion efflux protein  24.52 
 
 		 373 aa  55.1  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2229  RND family efflux transporter MFP subunit  19.28 
 
 		 405 aa  54.7  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1234  RND family efflux transporter MFP subunit  24.16 
 
 		 359 aa  54.3  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.580475  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0266  RND family efflux transporter MFP subunit  23.41 
 
 		 375 aa  54.3  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2865  HlyD family secretion protein  21.57 
 
 		 418 aa  54.3  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01077  HlyD family secretion protein  21.39 
 
 		 376 aa  53.9  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2993  RND family efflux transporter MFP subunit  23.83 
 
 		 435 aa  53.9  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3461  secretion protein HlyD  25 
 
 		 384 aa  53.5  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.84 
 
 		 388 aa  53.5  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2322  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.68 
 
 		 371 aa  53.5  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0437768 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  22.13 
 
 		 429 aa  53.5  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1497  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.07 
 
 		 407 aa  53.1  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.30393  hitchhiker  0.00778895 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1163  secretion protein HlyD family protein  22.55 
 
 		 379 aa  52.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  24.87 
 
 		 390 aa  53.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.19 
 
 		 376 aa  52.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3883  secretion protein HlyD  21.01 
 
 		 424 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>