More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01120 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_01120  membrane fusion efflux protein  100 
 
 		 373 aa  740    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1670  RND family efflux transporter MFP subunit  66.02 
 
 		 371 aa  479  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3518  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.04 
 
 		 379 aa  334  2e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224234  normal  0.212959 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2283  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.74 
 
 		 361 aa  317  2e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00902179 
 
 
-
 
NC_002950  PG1666  RND family efflux transporter MFP subunit  40.44 
 
 		 368 aa  273  4.0000000000000004e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1440  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.19 
 
 		 374 aa  172  9e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02838  hypothetical protein  30.81 
 
 		 378 aa  157  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003046  membrane-fusion protein  30.23 
 
 		 377 aa  157  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1169  membrane-fusion protein  27.85 
 
 		 377 aa  136  8e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0146013  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0635  macrolide-specific efflux protein macA  28.53 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0167041  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  28.9 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.99 
 
 		 416 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0709  macrolide-specific efflux protein macA  27.3 
 
 		 390 aa  105  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  29.01 
 
 		 429 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.25 
 
 		 414 aa  104  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1064  macrolide-specific efflux protein macA  27.32 
 
 		 390 aa  99.4  8e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0267322  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1532  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.78 
 
 		 415 aa  98.2  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0919  AcrA/AcrE family efflux protein  26.51 
 
 		 377 aa  98.6  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0635  RND family efflux transporter MFP subunit  27.53 
 
 		 406 aa  96.3  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.320707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  27.83 
 
 		 399 aa  96.3  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0607  RND family efflux transporter MFP subunit  27.53 
 
 		 406 aa  96.3  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1007  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.05 
 
 		 398 aa  95.5  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0770  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.56 
 
 		 399 aa  95.9  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0433625  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.41 
 
 		 419 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321445  normal  0.921537 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1634  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.26 
 
 		 417 aa  94  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1080  MacA  26.39 
 
 		 394 aa  93.2  7e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0987  secretion protein HlyD  26.82 
 
 		 419 aa  93.2  7e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  25.5 
 
 		 408 aa  91.3  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  25.57 
 
 		 408 aa  90.1  6e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.53 
 
 		 409 aa  89.7  7e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12131  membrane fusion protein  27.22 
 
 		 356 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.502636 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1666  RND family efflux transporter MFP subunit  24.29 
 
 		 418 aa  88.2  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0800  RND family efflux transporter MFP subunit  27.54 
 
 		 416 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000642362  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0832  RND family efflux transporter MFP subunit  26.84 
 
 		 416 aa  87  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000487508  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1637  RND family efflux transporter MFP subunit  28.66 
 
 		 465 aa  86.7  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.84 
 
 		 410 aa  86.7  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000019827  hitchhiker  0.00000000236896 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0747  secretion protein HlyD  25.81 
 
 		 357 aa  86.3  7e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.554021  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3536  RND family efflux transporter MFP subunit  26.84 
 
 		 416 aa  86.3  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.89 
 
 		 453 aa  85.5  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1483  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.93 
 
 		 419 aa  85.5  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.377405 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  24.85 
 
 		 390 aa  85.9  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  24.38 
 
 		 489 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.68 
 
 		 432 aa  84.7  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4850  RND family efflux transporter MFP subunit  24.4 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15871  membrane fusion protein  25.16 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3197  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.4 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.822347  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.27 
 
 		 453 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2553  hypothetical protein  25 
 
 		 368 aa  84.7  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3559  RND family efflux transporter MFP subunit  24.94 
 
 		 396 aa  84.3  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0492868  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2938  RND family efflux transporter MFP subunit  24.62 
 
 		 444 aa  84.3  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0820  HlyD family secretion protein  27.03 
 
 		 405 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1001  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.09 
 
 		 424 aa  82.8  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336631 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1256  membrane fusion protein (MFP) family auxiliary transport protein  24.32 
 
 		 397 aa  82.8  0.000000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1334  secretion protein HlyD  25.77 
 
 		 410 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3643  RND family efflux transporter MFP subunit  25.89 
 
 		 455 aa  82.4  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.384349  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1084  MacA  23.99 
 
 		 402 aa  82.4  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3445  RND family efflux transporter MFP subunit  24.3 
 
 		 401 aa  82.4  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.655677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3171  RND family efflux transporter MFP subunit  27.34 
 
 		 416 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000224755  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.27 
 
 		 428 aa  80.9  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0963  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.43 
 
 		 451 aa  80.5  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0174638  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0549  secretion protein HlyD  24.33 
 
 		 407 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.78 
 
 		 500 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1161  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 404 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0203325  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.06 
 
 		 462 aa  79  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1101  RND family efflux transporter MFP subunit  22.31 
 
 		 414 aa  79  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  26.29 
 
 		 409 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000285815  normal  0.0164702 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.88 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01965  Secretion protein HlyD  27.01 
 
 		 401 aa  78.2  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.303602  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.12 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.61066  normal  0.83964 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31990  cobalt/zinc/cadmium efflux RND transporter, membrane fusion protein, CzcB famil  27.03 
 
 		 484 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2716  RND divalent metal cation efflux membrane fusion protein CzcB precursor  27.59 
 
 		 484 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0715  RND family efflux transporter MFP subunit  23.26 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.28 
 
 		 448 aa  77.4  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.98 
 
 		 350 aa  77  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000250075  normal  0.807389 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4082  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.12 
 
 		 457 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.279374 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1863  RND family efflux transporter MFP subunit  23.71 
 
 		 393 aa  75.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00481  hypothetical protein  24.8 
 
 		 368 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2151  RND family efflux transporter MFP subunit  26.25 
 
 		 471 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.563694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2360  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.81 
 
 		 380 aa  75.1  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.347608  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1259  RND family efflux transporter MFP subunit  25.21 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1840  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.74 
 
 		 365 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.772932 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2520  RND family efflux transporter MFP subunit  21.45 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  22.44 
 
 		 411 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  22.72 
 
 		 607 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1965  secretion protein HlyD  22.35 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.455875 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3595  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.74 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0852698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.93 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000305818 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2865  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.94 
 
 		 478 aa  73.9  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0716848 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2359  RND family efflux transporter MFP subunit  25.29 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.26 
 
 		 419 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  24.61 
 
 		 367 aa  73.6  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4123  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.42 
 
 		 454 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.860452 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1071  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.72 
 
 		 454 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1423  RND family efflux transporter MFP subunit  25.58 
 
 		 401 aa  72.8  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1312  RND efflux transporter  25.58 
 
 		 401 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000130358  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2754  RND efflux transporter  25.58 
 
 		 401 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000226253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1814  RND family efflux transporter MFP subunit  22.62 
 
 		 432 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0322  RND family efflux transporter MFP subunit  23.42 
 
 		 353 aa  71.6  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619651 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.36 
 
 		 372 aa  70.9  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0273609  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2567  secretion protein HlyD  26.64 
 
 		 401 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.484116 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>