More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2567 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2567  secretion protein HlyD  100 
 
 
401 aa  802    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.484116 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1715  RND family efflux transporter MFP subunit  57.26 
 
 
456 aa  412  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1763  Membrane Fusion Protein cluster 2 protein  59.3 
 
 
520 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.305253 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5981  cation proton antiporter efflux protein CzcB  59.3 
 
 
520 aa  414  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000176523  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1088  RND family efflux transporter MFP subunit  60.46 
 
 
459 aa  407  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3969  secretion protein HlyD  54.96 
 
 
407 aa  403  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0953607  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3556  efflux transporter, RND family, MFP subunit  53.5 
 
 
433 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1328  secretion protein HlyD  54.12 
 
 
503 aa  395  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.918511  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2505  RND family efflux transporter MFP subunit  57.23 
 
 
416 aa  397  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0949204  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1848  RND family efflux transporter MFP subunit  57.97 
 
 
538 aa  391  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485461  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1374  heavy metal resistance protein CzcB  58.53 
 
 
484 aa  388  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6171  RND family efflux transporter MFP subunit  57.48 
 
 
491 aa  386  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.442702 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4685  secretion protein HlyD  57.48 
 
 
489 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160978  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3844  RND family efflux transporter MFP subunit  57.48 
 
 
489 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.957975 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3678  RND family efflux transporter MFP subunit  57.48 
 
 
489 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.235354  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1441  heavy metal resistance protein CzcB  59.53 
 
 
489 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.165558  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1030  heavy metal resistance protein CzcB  59.53 
 
 
489 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0701844  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1182  heavy metal resistance protein CzcB  59.53 
 
 
489 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125569  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0032  heavy metal resistance protein CzcB  59.82 
 
 
516 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.751867  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1526  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB  59.53 
 
 
489 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2432  HlyD family secretion protein  57.18 
 
 
488 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0400  heavy metal resistance protein CzcB  59.53 
 
 
489 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0829315  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0012  heavy metal resistance protein CzcB  59.53 
 
 
489 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3286  RND family efflux transporter MFP subunit  55.11 
 
 
404 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0376  cation efflux family protein  49.06 
 
 
422 aa  378  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2409  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB, putative  56.77 
 
 
404 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228901  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4802  secretion protein HlyD  56.05 
 
 
424 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838463  decreased coverage  0.00074061 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0706  heavy metal efflux system membrane fusion protein  59.23 
 
 
491 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0868485  normal  0.396702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2043  RND family efflux transporter MFP subunit  56.64 
 
 
404 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148074  normal  0.931139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0044  CzcB family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter membrane fusion protein  55.79 
 
 
416 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597635  hitchhiker  0.00000490268 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  55.79 
 
 
416 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.712877  hitchhiker  0.00429069 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0061  RND family efflux transporter MFP subunit  55.79 
 
 
416 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204779 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  55.79 
 
 
416 aa  356  5e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2716  RND divalent metal cation efflux membrane fusion protein CzcB precursor  52.39 
 
 
484 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0492  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  55.46 
 
 
404 aa  352  7e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31990  cobalt/zinc/cadmium efflux RND transporter, membrane fusion protein, CzcB famil  51.55 
 
 
484 aa  348  8e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2552  secretion protein HlyD  49.16 
 
 
410 aa  339  4e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3622  secretion protein HlyD  54.89 
 
 
397 aa  331  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106281  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1339  secretion protein HlyD  46.34 
 
 
502 aa  328  9e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2107  secretion protein HlyD  48.4 
 
 
509 aa  324  2e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.207972  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1176  RND family efflux transporter MFP subunit  50.14 
 
 
421 aa  323  4e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2210  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.85 
 
 
531 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1419  secretion protein HlyD  41.87 
 
 
400 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  37.21 
 
 
459 aa  235  1.0000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205065  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1071  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.48 
 
 
454 aa  223  4e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2139  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.95 
 
 
457 aa  216  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4082  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.2 
 
 
457 aa  209  5e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.279374 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0829  CzcB family heavy metal efflux protein  36.82 
 
 
423 aa  209  8e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3508  secretion protein HlyD  36.52 
 
 
424 aa  202  9e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  33.82 
 
 
410 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4123  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.71 
 
 
454 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.860452 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  35.78 
 
 
398 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  34.84 
 
 
399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 
400 aa  194  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.09 
 
 
428 aa  193  6e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1403  RND family efflux transporter MFP subunit  35.62 
 
 
459 aa  192  7e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023338 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.87 
 
 
427 aa  191  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.178981 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2136  CzcB family heavy metal efflux protein  33.18 
 
 
418 aa  189  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.15 
 
 
459 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.465461  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1019  secretion protein HlyD  34.7 
 
 
456 aa  166  9e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.194662  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1888  secretion protein HlyD  32.05 
 
 
399 aa  158  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.440468  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2320  RND family efflux transporter MFP subunit  33.8 
 
 
399 aa  158  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1045  HelB protein  41.24 
 
 
417 aa  152  8.999999999999999e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2448  secretion protein HlyD  35.14 
 
 
382 aa  152  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2842  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.93 
 
 
587 aa  151  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.609412  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  37.82 
 
 
308 aa  151  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.419499  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3518  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.73 
 
 
376 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2568  secretion protein HlyD  36.93 
 
 
389 aa  147  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363903  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2345  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.69 
 
 
331 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2372  HelB protein  39.18 
 
 
418 aa  144  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0448  secretion protein HlyD  29.07 
 
 
388 aa  144  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1849  secretion protein HlyD  38.97 
 
 
327 aa  143  7e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.134036  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2608  RND family efflux transporter MFP subunit  35.82 
 
 
387 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0604654  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2299  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.63 
 
 
330 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2143  secretion protein HlyD  36.6 
 
 
328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.139753 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1456  secretion protein HlyD  36.92 
 
 
330 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.134538  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7182  putative cation efflux system protein czcB  39.38 
 
 
330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.454767  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.77 
 
 
424 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0616  RND family efflux transporter MFP subunit  39.69 
 
 
329 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3647  secretion protein HlyD  37.63 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.547068 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3982  RND family efflux transporter MFP subunit  39.18 
 
 
329 aa  134  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.500568  normal  0.355177 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1549  RND family efflux transporter MFP subunit  34.95 
 
 
402 aa  132  9e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3342  secretion protein HlyD  35.57 
 
 
331 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2383  RND family efflux transporter MFP subunit  35.21 
 
 
530 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182874  normal  0.0987183 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7265  putative cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcB (cation efflux system protein czcB)  35.57 
 
 
315 aa  129  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0692053  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4531  secretion protein HlyD  34.43 
 
 
316 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3727  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.09 
 
 
359 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00335506  normal  0.0890337 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3837  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmvB  29.25 
 
 
405 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1640  secretion protein HlyD  28.71 
 
 
384 aa  123  5e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0791  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.93 
 
 
373 aa  122  8e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4155  RND family efflux transporter MFP subunit  35.83 
 
 
313 aa  122  8e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.259995 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3370  RND family efflux transporter MFP subunit  28.24 
 
 
368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.948815  normal  0.259543 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1876  secretion protein HlyD  31.8 
 
 
375 aa  120  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.748539  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0152  secretion protein HlyD  28.19 
 
 
382 aa  120  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0295  secretion protein HlyD  33.96 
 
 
379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.438063  normal  0.535582 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1956  hypothetical protein  34.5 
 
 
358 aa  116  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0111518  normal  0.309858 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4857  cation efflux system protein CusB  29.62 
 
 
529 aa  116  6.9999999999999995e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1969  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  34.02 
 
 
339 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.166615  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2746  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.76 
 
 
366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00408  putative cation efflux protein  32.14 
 
 
344 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000967818  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>