91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4176 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_4176  hypothetical protein  100 
 
 		 423 aa  863    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2118  RND family efflux transporter MFP subunit  26.91 
 
 		 418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0309  HlyD family secretion protein  24.36 
 
 		 416 aa  125  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0376524 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0774  RND family efflux transporter MFP subunit  24.5 
 
 		 418 aa  124  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.479896  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1901  RND family efflux transporter MFP subunit  26.44 
 
 		 417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637484 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4415  RND family efflux transporter MFP subunit  25.7 
 
 		 412 aa  109  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0366  secretion protein HlyD  25.44 
 
 		 437 aa  99  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.93288  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4588  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.15 
 
 		 415 aa  87  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00044707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1029  RND family efflux transporter MFP subunit  24.09 
 
 		 435 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.981321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2352  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.65 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0918313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0954  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.51 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1331  RND family efflux transporter MFP subunit  22.63 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100786  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0996  RND family efflux transporter MFP subunit  23.52 
 
 		 435 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4074  RND family efflux transporter MFP subunit  24.32 
 
 		 420 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0680  RND family efflux transporter MFP subunit  24.81 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0364598 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4837  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.01 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3694  hypothetical protein  23.34 
 
 		 419 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1017  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.52 
 
 		 420 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3343  RND family efflux transporter MFP subunit  23.52 
 
 		 435 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2993  RND family efflux transporter MFP subunit  22.65 
 
 		 435 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3507  RND family efflux transporter MFP subunit  23.63 
 
 		 421 aa  70.9  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568774  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3724  RND family efflux transporter MFP subunit  27.01 
 
 		 420 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.376754 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2575  RND family efflux transporter MFP subunit  26.8 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3161  RND family efflux transporter MFP subunit  23.91 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0861  RND family efflux transporter MFP subunit  23.44 
 
 		 420 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3005  RND family efflux transporter MFP subunit  26.8 
 
 		 420 aa  67.4  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000258393  hitchhiker  0.0000478824 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4702  RND family efflux transporter MFP subunit  21.98 
 
 		 431 aa  66.2  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2477  RND family efflux transporter MFP subunit  26.4 
 
 		 420 aa  65.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3365  RND family efflux transporter MFP subunit  22.53 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0328  ABC transporter permease  23.51 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.33045 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2405  RND family efflux transporter MFP subunit  25.9 
 
 		 443 aa  64.3  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3262  RND family efflux transporter MFP subunit  23.21 
 
 		 420 aa  63.5  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.933024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5609  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.36 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03125  ABC transporter permease  24.45 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2865  HlyD family secretion protein  24.12 
 
 		 418 aa  62  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2213  secretion protein HlyD  22.92 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0721  RND family efflux transporter MFP subunit  21.05 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2601  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.5 
 
 		 440 aa  58.2  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.9 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  22.44 
 
 		 380 aa  55.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0897  RND family efflux transporter MFP subunit  22.14 
 
 		 419 aa  53.5  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1497  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.17 
 
 		 407 aa  53.5  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.30393  hitchhiker  0.00778895 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1693  RND family efflux transporter MFP subunit  20.44 
 
 		 421 aa  53.5  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000207824  decreased coverage  0.00534917 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.64 
 
 		 380 aa  53.5  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0283  RND family efflux transporter MFP subunit  22.47 
 
 		 416 aa  53.1  0.000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1328  secretion protein HlyD  24.07 
 
 		 503 aa  53.1  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.918511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1675  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.8 
 
 		 608 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.93 
 
 		 350 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000250075  normal  0.807389 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2238  RND family efflux transporter MFP subunit  21 
 
 		 421 aa  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.811605  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08530  efflux system component, RND family  25.58 
 
 		 419 aa  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104956  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3500  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.38 
 
 		 425 aa  51.2  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.226045 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0572  RND family efflux transporter MFP subunit  22.5 
 
 		 423 aa  51.2  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0644  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.21 
 
 		 425 aa  50.4  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0200148  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0448  secretion protein HlyD  21.92 
 
 		 388 aa  50.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5356  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.49 
 
 		 510 aa  50.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0088  RND family efflux transporter MFP subunit  26.22 
 
 		 468 aa  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1362  secretion protein HlyD  22.36 
 
 		 381 aa  49.7  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.27807  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  27.69 
 
 		 517 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0318  RND family efflux transporter MFP subunit  26.46 
 
 		 523 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  26.46 
 
 		 523 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.957664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0513  RND family efflux transporter MFP subunit  26.46 
 
 		 523 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  23.32 
 
 		 449 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2237  RND family efflux transporter MFP subunit  26.13 
 
 		 521 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  23.32 
 
 		 421 aa  47.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3045  RND family efflux transporter MFP subunit  26.13 
 
 		 521 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3375  RND family efflux transporter MFP subunit  26.13 
 
 		 521 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2047  RND family efflux transporter MFP subunit  26.13 
 
 		 521 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1544  secretion protein HlyD family protein  24.83 
 
 		 504 aa  47.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0609  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.37 
 
 		 353 aa  47.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.593708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2505  RND family efflux transporter MFP subunit  25.24 
 
 		 416 aa  47  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0949204  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11703  putative cation efflux system transmembrane protein  22.75 
 
 		 578 aa  46.6  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.728459  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0769  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.12 
 
 		 322 aa  45.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.100875  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2165  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.07 
 
 		 456 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0618  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  20.38 
 
 		 268 aa  45.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7637  efflux pump protein  27.14 
 
 		 385 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.969695 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.24 
 
 		 465 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000291349 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  25.41 
 
 		 455 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0567  RND family efflux transporter MFP subunit  22.94 
 
 		 335 aa  44.7  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1239  RND family efflux transporter MFP subunit  22.55 
 
 		 451 aa  45.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0091  RND family efflux transporter MFP subunit  20.15 
 
 		 394 aa  44.3  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.666427  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0582  RND family efflux transporter MFP subunit  22.94 
 
 		 335 aa  44.3  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2852  secretion protein HlyD  20.49 
 
 		 419 aa  44.3  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1808  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.56 
 
 		 510 aa  44.3  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.034543  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2383  RND family efflux transporter MFP subunit  27.27 
 
 		 530 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182874  normal  0.0987183 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6250  RND family efflux transporter MFP subunit  25.89 
 
 		 388 aa  43.9  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2117  secretion protein HlyD  22.32 
 
 		 428 aa  43.5  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.893928 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  21.82 
 
 		 389 aa  43.5  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3260  HlyD family secretion protein  27.27 
 
 		 460 aa  43.5  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0764  RND family efflux transporter MFP subunit  21.39 
 
 		 385 aa  43.5  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2818  secretion protein HlyD  21.97 
 
 		 376 aa  43.1  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.25 
 
 		 430 aa  43.1  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>