284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2352 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2352  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 419 aa  847    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0918313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5609  efflux transporter, RND family, MFP subunit  67.95 
 
 		 414 aa  591  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0283  RND family efflux transporter MFP subunit  31.97 
 
 		 416 aa  207  2e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3161  RND family efflux transporter MFP subunit  22.04 
 
 		 420 aa  107  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3262  RND family efflux transporter MFP subunit  21.56 
 
 		 420 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.933024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0861  RND family efflux transporter MFP subunit  21.8 
 
 		 420 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4588  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.43 
 
 		 415 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00044707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0721  RND family efflux transporter MFP subunit  21.83 
 
 		 420 aa  104  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1331  RND family efflux transporter MFP subunit  23.19 
 
 		 412 aa  96.7  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100786  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2993  RND family efflux transporter MFP subunit  20.88 
 
 		 435 aa  93.2  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3365  RND family efflux transporter MFP subunit  20.39 
 
 		 420 aa  92  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4415  RND family efflux transporter MFP subunit  25.3 
 
 		 412 aa  91.3  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4702  RND family efflux transporter MFP subunit  23.23 
 
 		 431 aa  90.9  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0897  RND family efflux transporter MFP subunit  23.58 
 
 		 419 aa  89.7  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3694  hypothetical protein  20.62 
 
 		 419 aa  89  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2118  RND family efflux transporter MFP subunit  22.27 
 
 		 418 aa  88.6  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03125  ABC transporter permease  22.42 
 
 		 392 aa  89  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0954  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.38 
 
 		 415 aa  88.2  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0572  RND family efflux transporter MFP subunit  23.59 
 
 		 423 aa  87.8  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0774  RND family efflux transporter MFP subunit  23.75 
 
 		 418 aa  87  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.479896  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0366  secretion protein HlyD  22.91 
 
 		 437 aa  86.7  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.93288  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0996  RND family efflux transporter MFP subunit  20.65 
 
 		 435 aa  86.7  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1017  efflux transporter, RND family, MFP subunit  19.91 
 
 		 420 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0680  RND family efflux transporter MFP subunit  22.09 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0364598 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3500  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.76 
 
 		 425 aa  85.9  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.226045 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1901  RND family efflux transporter MFP subunit  23.51 
 
 		 417 aa  84.3  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637484 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3343  RND family efflux transporter MFP subunit  20.15 
 
 		 435 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4074  RND family efflux transporter MFP subunit  19.62 
 
 		 420 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1029  RND family efflux transporter MFP subunit  20.4 
 
 		 435 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.981321 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2852  secretion protein HlyD  22.64 
 
 		 419 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2238  RND family efflux transporter MFP subunit  20.57 
 
 		 421 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.811605  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4837  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.49 
 
 		 415 aa  79.7  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2405  RND family efflux transporter MFP subunit  20.14 
 
 		 443 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4176  hypothetical protein  24.65 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3507  RND family efflux transporter MFP subunit  21.6 
 
 		 421 aa  77  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568774  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  24.47 
 
 		 431 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.63 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.035635  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0328  ABC transporter permease  20.44 
 
 		 434 aa  73.6  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.33045 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3724  RND family efflux transporter MFP subunit  18.85 
 
 		 420 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.376754 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.41 
 
 		 448 aa  72  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2865  HlyD family secretion protein  20.28 
 
 		 418 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  24.08 
 
 		 384 aa  70.5  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  25.19 
 
 		 399 aa  68.6  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0309  HlyD family secretion protein  21.86 
 
 		 416 aa  68.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0376524 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02540  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.86 
 
 		 481 aa  67.8  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0229793  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0695  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.75 
 
 		 353 aa  65.5  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  24.48 
 
 		 379 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  22.17 
 
 		 607 aa  65.1  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  24.85 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  23.97 
 
 		 449 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  24.46 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.1 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.37122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  26.96 
 
 		 426 aa  62.4  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2601  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.83 
 
 		 440 aa  60.8  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1177  RND family efflux transporter MFP subunit  25.3 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.06 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1675  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.75 
 
 		 608 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1992  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.73 
 
 		 580 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.491967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3430  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.02 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.516107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1144  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000422764  normal  0.160912 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3973  RND family efflux transporter MFP subunit  25.51 
 
 		 473 aa  57.8  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181102 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.2 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2903  RND family efflux transporter MFP subunit  26.85 
 
 		 383 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  20.29 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1036  RND family efflux transporter MFP subunit  23.37 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2586  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.06 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  23.35 
 
 		 421 aa  57  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3483  HlyD family secretion protein  25.78 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2477  RND family efflux transporter MFP subunit  19.8 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0549  secretion protein HlyD  22.98 
 
 		 407 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2744  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.43 
 
 		 475 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1161  RND family efflux transporter MFP subunit  23.8 
 
 		 404 aa  55.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0203325  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1436  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.12 
 
 		 393 aa  55.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  24.75 
 
 		 374 aa  55.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  29.12 
 
 		 390 aa  54.3  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 407 aa  54.3  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  26.37 
 
 		 370 aa  54.3  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1150  RND family efflux transporter MFP subunit  26.37 
 
 		 373 aa  54.3  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  26.92 
 
 		 370 aa  54.3  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2564  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.54 
 
 		 509 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.430144 
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  21.84 
 
 		 408 aa  53.9  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1901  secretion protein HlyD family protein  22.82 
 
 		 403 aa  53.9  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.164629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  21.59 
 
 		 408 aa  53.9  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.68 
 
 		 377 aa  53.9  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3005  RND family efflux transporter MFP subunit  20.8 
 
 		 420 aa  53.9  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000258393  hitchhiker  0.0000478824 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1071  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.99 
 
 		 454 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1700  secretion protein HlyD  20.72 
 
 		 417 aa  53.1  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.696744  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5576  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.31 
 
 		 353 aa  53.1  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2872  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.31 
 
 		 387 aa  53.1  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.98 
 
 		 377 aa  53.1  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.158537  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2470  secretion protein HlyD family protein  22.04 
 
 		 421 aa  53.1  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1839  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.96 
 
 		 420 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  29.52 
 
 		 349 aa  52.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1156  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 		 370 aa  53.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000311518  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3130  secretion protein HlyD  25.88 
 
 		 473 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.308652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2559  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.73 
 
 		 349 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.99545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1501  component of copper transport system  27.75 
 
 		 404 aa  52.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000252405  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2786  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 372 aa  52.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000125206  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  25.07 
 
 		 411 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4563  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.06 
 
 		 426 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>