More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0695 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0695  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 
353 aa  683    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2072  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.17 
 
 
379 aa  177  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.33 
 
 
391 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.035635  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.64 
 
 
377 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1762  RND family efflux transporter MFP subunit  26.65 
 
 
421 aa  88.2  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0464275  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0431  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.43 
 
 
368 aa  85.1  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  24.76 
 
 
410 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3225  RND family efflux transporter MFP subunit  23.89 
 
 
392 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376119  normal  0.122741 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1036  RND family efflux transporter MFP subunit  25.92 
 
 
354 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4292  RND family efflux transporter MFP subunit  23.89 
 
 
392 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0539  RND family efflux transporter MFP subunit  27.93 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4074  secretion protein HlyD  23.89 
 
 
392 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.119469  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  21.53 
 
 
340 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4188  RND family efflux transporter MFP subunit  23.57 
 
 
410 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0941549  normal  0.890181 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.03 
 
 
380 aa  79.3  0.00000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3710  RND family efflux transporter MFP subunit  23.25 
 
 
410 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4313  RND family efflux transporter MFP subunit  22.04 
 
 
409 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.583259 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0801  efflux transporter, RND family, MFP subunit  19.13 
 
 
403 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  23.71 
 
 
376 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1727  HlyD family secretion protein  23.61 
 
 
409 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0767982  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2584  CzcB subfamily membrane fusion protein  25.46 
 
 
409 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  22.22 
 
 
366 aa  77  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1906  HlyD family-like protein  22.16 
 
 
361 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000977353  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0110  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.89 
 
 
360 aa  76.3  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0109  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.89 
 
 
360 aa  76.3  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.23 
 
 
413 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2095  secretion protein HlyD  21.72 
 
 
354 aa  75.5  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.53 
 
 
445 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  24.93 
 
 
364 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2786  RND family efflux transporter MFP subunit  23.62 
 
 
372 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000125206  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2381  RND family efflux transporter MFP subunit  23.88 
 
 
357 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.74 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  22.6 
 
 
374 aa  74.3  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0609  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.64 
 
 
353 aa  73.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.593708  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0177  hypothetical protein  20.98 
 
 
406 aa  73.6  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.61 
 
 
409 aa  73.2  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.25 
 
 
388 aa  73.2  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3483  HlyD family secretion protein  23.55 
 
 
369 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3170  RND family efflux transporter MFP subunit  25.29 
 
 
369 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0706  secretion protein HlyD  23.48 
 
 
366 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000331728  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1818  RND family efflux transporter MFP subunit  21.96 
 
 
352 aa  72.8  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000224471  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5875  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.39 
 
 
407 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955286  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1256  membrane fusion protein (MFP) family auxiliary transport protein  23.63 
 
 
397 aa  72  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2071  RND efflux system membrane fusion protein  25.69 
 
 
407 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226746  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1640  CmeA  23.95 
 
 
386 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  20 
 
 
391 aa  71.6  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1101  RND family efflux transporter MFP subunit  21.47 
 
 
414 aa  72  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402678  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3169  RND family efflux transporter MFP subunit  26.12 
 
 
369 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000222351  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1670  RND family efflux transporter MFP subunit  24.26 
 
 
371 aa  70.5  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1672  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.82 
 
 
359 aa  70.9  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0739  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.75 
 
 
362 aa  70.5  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.941037  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 
369 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000118856  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01965  Secretion protein HlyD  24.6 
 
 
401 aa  70.1  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.303602  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2082  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.41 
 
 
416 aa  70.1  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2316  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.79 
 
 
379 aa  70.1  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.144925 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.57 
 
 
349 aa  70.1  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3313  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 
369 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000984298  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0480  RND family efflux transporter MFP subunit  23.47 
 
 
363 aa  69.7  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3309  RND family efflux transporter MFP subunit  23.62 
 
 
430 aa  68.9  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.33 
 
 
414 aa  69.3  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0123  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.74 
 
 
384 aa  69.3  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2283  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25 
 
 
361 aa  68.9  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00902179 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.57 
 
 
383 aa  68.9  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0764  RND family efflux transporter MFP subunit  22.63 
 
 
385 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2666  RND family efflux transporter MFP subunit  22.58 
 
 
387 aa  68.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1988  RND family efflux transporter MFP subunit  21.64 
 
 
362 aa  68.6  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  23.01 
 
 
399 aa  68.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5660  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 
371 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.852771  normal  0.84907 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  24.39 
 
 
370 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120074  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1150  RND family efflux transporter MFP subunit  24.39 
 
 
373 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1147  RND family efflux transporter MFP subunit  21.9 
 
 
395 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004022  membrane-fusion protein  21.34 
 
 
369 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000160707  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2352  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.33 
 
 
419 aa  67.4  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0918313  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1124  RND family efflux transporter MFP subunit  21.09 
 
 
408 aa  67  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.360909 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13031  membrane fusion protein  24.11 
 
 
353 aa  67  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1356  RND family efflux transporter MFP subunit  23.4 
 
 
387 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00018874 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1044  RND family efflux transporter MFP subunit  22.87 
 
 
361 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0011899  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000105  membrane-fusion protein  22.74 
 
 
351 aa  67.4  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.860226  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3518  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.87 
 
 
379 aa  67.4  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224234  normal  0.212959 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  24.73 
 
 
607 aa  67  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0558  secretion protein HlyD  20.17 
 
 
360 aa  67  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177986  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  23.69 
 
 
370 aa  67  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1985  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.88 
 
 
429 aa  66.6  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2557  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.11 
 
 
356 aa  66.6  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000027885  normal  0.211023 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0768  acriflavin resistance periplasmic protein  25.46 
 
 
348 aa  66.2  0.0000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.69171  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  24.23 
 
 
354 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3604  secretion protein HlyD  23.45 
 
 
422 aa  66.2  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105186  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.2 
 
 
421 aa  66.2  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325844 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1267  RND family efflux transporter MFP subunit  25.78 
 
 
355 aa  66.2  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0438  hypothetical protein  22.81 
 
 
352 aa  66.2  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466929  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5614  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.16 
 
 
357 aa  66.2  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1084  MacA  24.93 
 
 
402 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0703  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.52 
 
 
355 aa  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.14 
 
 
351 aa  65.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0777  RND family efflux transporter MFP subunit  23.16 
 
 
384 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2499  RND family efflux transporter MFP subunit  22.71 
 
 
416 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  18.94 
 
 
360 aa  64.7  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0365  membrane-fusion protein  21.98 
 
 
394 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2149  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.55 
 
 
409 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.111795  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.1 
 
 
413 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>