More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1988 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1988  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 362 aa  694    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0212  secretion protein HlyD  35.2 
 
 		 364 aa  189  4e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.59943 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.84 
 
 		 362 aa  126  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2939  RND family efflux transporter MFP subunit  29.7 
 
 		 352 aa  116  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0067677  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0948  secretion protein HlyD  29.32 
 
 		 413 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.297274  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2104  RND family efflux transporter MFP subunit  28.27 
 
 		 450 aa  109  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.58 
 
 		 380 aa  108  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  28.49 
 
 		 381 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0930  RND family efflux transporter MFP subunit  29.94 
 
 		 366 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1771  RND family efflux transporter MFP subunit  27.66 
 
 		 469 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.75905 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1080  RND family efflux transporter MFP subunit  26.75 
 
 		 463 aa  107  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0090  putative multidrug transporter, HlyD family  26.55 
 
 		 368 aa  106  7e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1749  secretion protein HlyD  28.19 
 
 		 398 aa  105  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3689  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.13 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00481  hypothetical protein  25.91 
 
 		 368 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1080  RND family efflux transporter MFP subunit  26.75 
 
 		 457 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1629  RND family efflux transporter MFP subunit  25.57 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4306  HlyD family secretion protein  27.05 
 
 		 456 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0237047  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  25.57 
 
 		 358 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  31.5 
 
 		 374 aa  104  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0719  secretion protein HlyD  26.75 
 
 		 457 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1172  RND family efflux transporter MFP subunit  26.75 
 
 		 454 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  26.52 
 
 		 354 aa  103  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1421  HlyD family secretion protein  26.09 
 
 		 354 aa  103  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  25.71 
 
 		 354 aa  103  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1577  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.97 
 
 		 434 aa  103  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1198  RND family efflux transporter MFP subunit  26.75 
 
 		 457 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495254  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  29.5 
 
 		 381 aa  102  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1206  multidrug efflux system subunit MdtA  27.35 
 
 		 419 aa  102  9e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0570202  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2368  secretion protein HlyD  25.77 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.108323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2907  RND efflux system membrane fusion protein  26.59 
 
 		 433 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484522  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  26.28 
 
 		 367 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0041  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.41 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89791  normal  0.261432 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0358  RND family efflux transporter MFP subunit  24.78 
 
 		 372 aa  102  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  31.11 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4296  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.54 
 
 		 462 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  25.99 
 
 		 373 aa  101  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1783  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.25 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  26.54 
 
 		 351 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.54 
 
 		 462 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1146  RND family efflux transporter MFP subunit  26.54 
 
 		 351 aa  100  3e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0907  RND efflux membrane fusion protein-related protein  27.11 
 
 		 406 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0946  RND family efflux transporter MFP subunit  27.11 
 
 		 382 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2071  RND efflux system membrane fusion protein  25.51 
 
 		 407 aa  99.8  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1649  RND family efflux transporter MFP subunit  26.48 
 
 		 354 aa  99.8  7e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.499517  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3927  RND family efflux transporter MFP subunit  25.07 
 
 		 392 aa  99  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1369  membrane fusion protein MdtA  28.79 
 
 		 445 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1501  HlyD family secretion protein  28.79 
 
 		 445 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310778  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  26.37 
 
 		 410 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2553  hypothetical protein  25.99 
 
 		 368 aa  99  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03141  putative resistance transmembrane protein  27.19 
 
 		 449 aa  98.2  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003895  membrane fusion protein of RND family multidrug efflux pump  28.12 
 
 		 379 aa  98.2  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2866  HlyD family secretion protein  27.96 
 
 		 576 aa  98.2  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2238  secretion protein HlyD  26.12 
 
 		 431 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0975  RND family efflux transporter MFP subunit  27.53 
 
 		 382 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0109715 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3604  secretion protein HlyD  25.62 
 
 		 422 aa  98.6  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105186  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2454  RND family efflux transporter MFP subunit  30.72 
 
 		 393 aa  98.6  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2132  HlyD family secretion protein  29.57 
 
 		 360 aa  97.4  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.732379  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1364  membrane fusion protein MdtA  28.48 
 
 		 442 aa  97.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.284522  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2360  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.65 
 
 		 380 aa  97.1  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.347608  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0944  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.71 
 
 		 356 aa  97.1  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0623416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1334  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  27.87 
 
 		 393 aa  97.1  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0169276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  25.31 
 
 		 365 aa  97.1  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2514  RND family efflux transporter MFP subunit  25.65 
 
 		 354 aa  97.1  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000208657  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4327  HlyD family secretion protein  23.94 
 
 		 372 aa  96.3  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2521  RND family efflux transporter MFP subunit  25.65 
 
 		 354 aa  96.3  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.199325  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5875  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.83 
 
 		 407 aa  96.3  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.65 
 
 		 354 aa  96.3  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000238284  normal  0.23398 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.7 
 
 		 388 aa  95.9  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2524  RND family efflux transporter MFP subunit  28.41 
 
 		 424 aa  95.9  9e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.283395  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.75 
 
 		 372 aa  95.9  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1549  membrane fusion protein precursor  26.56 
 
 		 411 aa  95.5  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1021  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.52 
 
 		 390 aa  95.5  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0159772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2634  RND family efflux transporter MFP subunit  25.65 
 
 		 354 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1488  RND family efflux transporter MFP subunit  26.04 
 
 		 411 aa  95.9  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1194  acriflavin resistance periplasmic protein  25.6 
 
 		 380 aa  95.5  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1936  transporter, putative  26.61 
 
 		 349 aa  94.7  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3889  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 		 364 aa  94.7  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4415  RND family efflux transporter MFP subunit  27.81 
 
 		 458 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.553493  normal  0.934455 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2192  secretion protein HlyD  26.05 
 
 		 352 aa  94.7  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  26.51 
 
 		 390 aa  95.1  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03982  membrane fusion protein  26.74 
 
 		 414 aa  95.1  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4070  secretion protein HlyD  27.33 
 
 		 405 aa  94.7  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.409958  normal  0.154431 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0942  acriflavine resistance protein E  26.58 
 
 		 374 aa  94.7  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2381  RND family efflux transporter MFP subunit  23.94 
 
 		 357 aa  95.1  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  27.42 
 
 		 405 aa  94.7  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0372  RND family efflux transporter MFP subunit  23.88 
 
 		 372 aa  95.1  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0152  RND family efflux transporter MFP subunit  27.89 
 
 		 385 aa  94  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1817  secretion protein HlyD  30 
 
 		 405 aa  94.4  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00656691  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4363  RND efflux system membrane fusion protein  26.3 
 
 		 467 aa  94.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2426  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.99 
 
 		 365 aa  94.4  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.54628  hitchhiker  0.0000000883837 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001385  probable RND efflux membrane fusion protein  27.87 
 
 		 380 aa  94  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3797  RND family efflux transporter MFP subunit  27.75 
 
 		 376 aa  94  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.46 
 
 		 358 aa  94  4e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0123174  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0892  RND efflux membrane fusion protein precursor  30.14 
 
 		 370 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1580  RND family efflux transporter MFP subunit  28.17 
 
 		 365 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186167  normal  0.460313 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3585  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.21 
 
 		 435 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2702  multidrug efflux system subunit MdtA  26.3 
 
 		 411 aa  93.2  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0647  RND family efflux transporter MFP subunit  28.04 
 
 		 425 aa  93.2  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0986  multidrug efflux system subunit MdtA  26.53 
 
 		 415 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.607592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>