261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0774 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0774  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 418 aa  843    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.479896  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2118  RND family efflux transporter MFP subunit  39.71 
 
 		 418 aa  320  3.9999999999999996e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0309  HlyD family secretion protein  40.19 
 
 		 416 aa  298  1e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0376524 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1901  RND family efflux transporter MFP subunit  34.13 
 
 		 417 aa  234  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637484 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0366  secretion protein HlyD  30.75 
 
 		 437 aa  205  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.93288  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4415  RND family efflux transporter MFP subunit  26.38 
 
 		 412 aa  136  6.0000000000000005e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4176  hypothetical protein  24.5 
 
 		 423 aa  124  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3343  RND family efflux transporter MFP subunit  23.33 
 
 		 435 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1017  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.08 
 
 		 420 aa  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0996  RND family efflux transporter MFP subunit  23.08 
 
 		 435 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1029  RND family efflux transporter MFP subunit  23.71 
 
 		 435 aa  88.2  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.981321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2352  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.75 
 
 		 419 aa  87  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0918313  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4702  RND family efflux transporter MFP subunit  20.81 
 
 		 431 aa  85.9  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2865  HlyD family secretion protein  24.1 
 
 		 418 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0861  RND family efflux transporter MFP subunit  23.26 
 
 		 420 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2993  RND family efflux transporter MFP subunit  22.92 
 
 		 435 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4074  RND family efflux transporter MFP subunit  24.27 
 
 		 420 aa  82  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3161  RND family efflux transporter MFP subunit  23 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.68 
 
 		 448 aa  80.1  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3724  RND family efflux transporter MFP subunit  23.96 
 
 		 420 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.376754 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3262  RND family efflux transporter MFP subunit  22.31 
 
 		 420 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.933024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0721  RND family efflux transporter MFP subunit  23.12 
 
 		 420 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5609  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.19 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0680  RND family efflux transporter MFP subunit  20.97 
 
 		 417 aa  75.1  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0364598 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0572  RND family efflux transporter MFP subunit  22.07 
 
 		 423 aa  73.6  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  28.05 
 
 		 421 aa  73.6  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3507  RND family efflux transporter MFP subunit  21.31 
 
 		 421 aa  72.4  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568774  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.23 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3694  hypothetical protein  22.65 
 
 		 419 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0954  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.32 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4588  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.54 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00044707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2601  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.27 
 
 		 440 aa  70.5  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1331  RND family efflux transporter MFP subunit  20.74 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100786  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  23.52 
 
 		 351 aa  69.3  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4837  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.05 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1146  RND family efflux transporter MFP subunit  23.64 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03125  ABC transporter permease  23.83 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0328  ABC transporter permease  20.42 
 
 		 434 aa  66.6  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.33045 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0567  RND family efflux transporter MFP subunit  27.5 
 
 		 335 aa  65.9  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.85 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.56 
 
 		 381 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.85 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3500  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.02 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.226045 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.93 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1839  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.82 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0573  macrolide secretion protein MacA  25.33 
 
 		 455 aa  63.2  0.000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.00000000000123833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02540  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.02 
 
 		 481 aa  63.2  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0229793  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0582  RND family efflux transporter MFP subunit  27 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1840  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.77 
 
 		 365 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.772932 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1943  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.87 
 
 		 450 aa  62.4  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1469  secretion protein HlyD  25.26 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.910926 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  23.91 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7080  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.73 
 
 		 416 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3365  RND family efflux transporter MFP subunit  22.16 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  21.41 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1047  RND family efflux transporter subunit MFP  24.32 
 
 		 461 aa  57.8  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0423833  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  23.56 
 
 		 607 aa  57.4  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  22.91 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0563  secretion protein HlyD  28.19 
 
 		 456 aa  57  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  24.16 
 
 		 471 aa  57  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3883  secretion protein HlyD  25.92 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1833  RND family efflux transporter MFP subunit  26.4 
 
 		 464 aa  55.8  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.36059  unclonable  0.000000000906287 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1256  membrane fusion protein (MFP) family auxiliary transport protein  22.76 
 
 		 397 aa  55.8  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0897  RND family efflux transporter MFP subunit  22.42 
 
 		 419 aa  55.8  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4089  HlyD family secretion protein  30.7 
 
 		 324 aa  55.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1693  RND family efflux transporter MFP subunit  23.55 
 
 		 421 aa  55.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000207824  decreased coverage  0.00534917 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0567  secretion protein HlyD family protein  28.81 
 
 		 323 aa  54.7  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.142155 
 
 
-
 
NC_002950  PG0283  RND family efflux transporter MFP subunit  21.68 
 
 		 416 aa  54.3  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1868  secretion protein HlyD  30.15 
 
 		 405 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0506  secretion protein HlyD family protein  27.87 
 
 		 324 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0527  secretion protein HlyD family protein  27.87 
 
 		 324 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0568004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0531  secretion protein HlyD family protein  27.87 
 
 		 324 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1675  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.05 
 
 		 608 aa  53.1  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  24.15 
 
 		 431 aa  53.1  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.39 
 
 		 432 aa  53.1  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4563  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.06 
 
 		 426 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0758  macrolide-specific efflux protein MacA  24.74 
 
 		 394 aa  52.8  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0225012  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0478  HlyD family secretion protein  25.91 
 
 		 322 aa  52.8  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.161841 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  26.25 
 
 		 384 aa  52.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1080  MacA  22.75 
 
 		 394 aa  51.6  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2438  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.04 
 
 		 586 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0017106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0942  macrolide transporter subunit MacA  23.63 
 
 		 372 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1059  macrolide transporter subunit MacA  23.56 
 
 		 372 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.75011  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3463  secretion protein HlyD family protein  26.92 
 
 		 324 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0488  secretion protein HlyD family protein  26.92 
 
 		 324 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3639  secretion protein HlyD family protein  27.78 
 
 		 324 aa  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1039  macrolide transporter subunit MacA  23.63 
 
 		 372 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1084  MacA  22.31 
 
 		 402 aa  52  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  23.08 
 
 		 349 aa  51.2  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0583  secretion protein HlyD family protein  25.76 
 
 		 324 aa  51.2  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3939  RND family efflux transporter MFP subunit  21.56 
 
 		 367 aa  51.2  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.407918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3729  secretion protein HlyD family protein  29.87 
 
 		 329 aa  51.2  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3559  RND family efflux transporter MFP subunit  25.34 
 
 		 396 aa  51.6  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0492868  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3813  secretion protein HlyD family protein  27.95 
 
 		 324 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.103325  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0412  secretion protein HlyD family protein  27.15 
 
 		 323 aa  50.8  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.604128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.75 
 
 		 505 aa  50.8  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2831  syringolide efflux protein SyfC  24.48 
 
 		 383 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.580145  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1713  multidrug resistance efflux pump-like protein  20.7 
 
 		 392 aa  50.8  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.254154  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  23.21 
 
 		 426 aa  50.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  24.23 
 
 		 347 aa  50.8  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>