More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2438 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2438  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 
586 aa  1125    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0017106  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0267  RND family efflux transporter MFP subunit  54.27 
 
 
586 aa  419  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117926 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0268  RND family efflux transporter MFP subunit  52.31 
 
 
587 aa  396  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0795166 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1203  RND family efflux transporter MFP subunit  41.26 
 
 
621 aa  282  1e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1675  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.03 
 
 
608 aa  265  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4067  RND family efflux transporter MFP subunit  41.48 
 
 
621 aa  254  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1602  RND family efflux transporter MFP subunit  33.39 
 
 
641 aa  248  3e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3213  multidrug resistance efflux pump-like protein  40.3 
 
 
502 aa  213  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0355  secretion protein HlyD family protein  41.04 
 
 
520 aa  205  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  hitchhiker  0.000000558214 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2709  multidrug resistance efflux pump-like protein  39.44 
 
 
501 aa  197  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64951  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1544  secretion protein HlyD family protein  35.84 
 
 
504 aa  197  6e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0500  secretion protein HlyD family protein  36.28 
 
 
502 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3638  secretion protein HlyD family protein  35.22 
 
 
503 aa  148  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266214  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2731  secretion protein HlyD family protein  39.8 
 
 
497 aa  134  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3151  secretion protein HlyD family protein  27.23 
 
 
533 aa  127  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.82 
 
 
432 aa  124  6e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2316  secretion protein HlyD family protein  26.98 
 
 
533 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4169  secretion protein HlyD family protein  34.06 
 
 
477 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00575947  hitchhiker  0.00428587 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.24 
 
 
509 aa  117  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.46 
 
 
448 aa  111  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  34.1 
 
 
411 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1450  RND family efflux transporter MFP subunit  34.76 
 
 
622 aa  108  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.125039  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.66 
 
 
663 aa  106  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4302  secretion protein HlyD family protein  34.1 
 
 
477 aa  103  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.358477  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2956  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.4 
 
 
430 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.232515 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1340  secretion protein HlyD  32.91 
 
 
424 aa  100  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  24.93 
 
 
417 aa  100  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0460  hypothetical protein  29.78 
 
 
513 aa  99.8  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0198  RND family efflux transporter MFP subunit  28.03 
 
 
521 aa  98.6  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  30.89 
 
 
489 aa  98.6  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1441  RND family efflux transporter MFP subunit  26.84 
 
 
634 aa  98.6  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0790  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.92 
 
 
521 aa  98.2  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  32.91 
 
 
400 aa  97.4  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2104  secretion protein HlyD family protein  31.29 
 
 
541 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4357  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  29.28 
 
 
514 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155847  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02540  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.02 
 
 
481 aa  94.7  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0229793  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  31.25 
 
 
408 aa  94  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  32.69 
 
 
370 aa  94  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  31.14 
 
 
417 aa  93.6  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0177  secretion protein HlyD family protein  29.58 
 
 
514 aa  93.2  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.624945  normal  0.250507 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  31.49 
 
 
408 aa  92.4  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.98 
 
 
377 aa  92.4  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  27.97 
 
 
367 aa  92.4  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3864  ABC transporter related  32.34 
 
 
418 aa  92  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.606554  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2610  RND family efflux transporter MFP subunit  37.04 
 
 
493 aa  92.4  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.787622 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.67 
 
 
428 aa  92  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  32.62 
 
 
329 aa  90.9  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0322  RND family efflux transporter MFP subunit  35.57 
 
 
353 aa  90.5  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0619651 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00481  hypothetical protein  28.57 
 
 
368 aa  89  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3038  secretion protein HlyD  30.31 
 
 
403 aa  89.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167095  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1814  RND family efflux transporter MFP subunit  27.27 
 
 
432 aa  89  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  26.58 
 
 
376 aa  89.4  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.33 
 
 
419 aa  87.4  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.9 
 
 
419 aa  87.4  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000305818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1593  RND family efflux transporter MFP subunit  25.6 
 
 
631 aa  87.4  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.351482  normal  0.814117 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.67 
 
 
504 aa  87  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  31.53 
 
 
379 aa  87  9e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3918  secretion protein HlyD  35.67 
 
 
433 aa  86.7  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.47 
 
 
360 aa  86.3  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0175  hypothetical protein  29.26 
 
 
380 aa  86.7  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.109936  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  31.27 
 
 
371 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.27 
 
 
371 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  31.27 
 
 
371 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  31.27 
 
 
371 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  31.27 
 
 
371 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  31.27 
 
 
371 aa  85.5  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1414  secretion protein HlyD  32.37 
 
 
430 aa  85.9  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4297  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.33 
 
 
397 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.430357  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3475  secretion protein HlyD-like protein  30.23 
 
 
373 aa  85.5  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.555415 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  31.27 
 
 
371 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3605  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.71 
 
 
429 aa  85.1  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3271  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.09 
 
 
380 aa  85.1  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.525557  normal  0.197401 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  30.27 
 
 
380 aa  85.5  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3021  RND family efflux transporter MFP subunit  31.84 
 
 
418 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0354964  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  31.54 
 
 
371 aa  84.7  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3375  HlyD family membrane fusion protein  31.84 
 
 
425 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3323  secretion protein HlyD  28.99 
 
 
459 aa  85.1  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.665109  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2282  macrolide transporter subunit MacA  31.27 
 
 
371 aa  84.7  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000339116  normal  0.0134871 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0739  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.6 
 
 
362 aa  84.3  0.000000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.941037  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.95 
 
 
381 aa  84.3  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3650  secretion protein HlyD  29.58 
 
 
397 aa  84  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1759  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.68 
 
 
457 aa  84  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0090  putative multidrug transporter, HlyD family  26.05 
 
 
368 aa  83.2  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  28.9 
 
 
384 aa  82.8  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1129  RND family efflux transporter MFP subunit  31.94 
 
 
407 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2617  secretion protein HlyD  30.22 
 
 
385 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000106145  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1765  secretion protein HlyD family protein  31.27 
 
 
541 aa  82.8  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.186436  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  29.01 
 
 
517 aa  82  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0221  RND family efflux transporter MFP subunit  29.07 
 
 
386 aa  81.6  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  29.85 
 
 
399 aa  81.6  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3168  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.03 
 
 
430 aa  81.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479459  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2611  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.89 
 
 
549 aa  81.3  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3622  secretion protein HlyD  37.71 
 
 
397 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106281  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1259  RND family efflux transporter MFP subunit  30.14 
 
 
415 aa  80.5  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3274  putative multidrug efflux system transmembrane protein  32.67 
 
 
225 aa  80.5  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.668414  normal  0.104011 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  31 
 
 
429 aa  80.1  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2553  hypothetical protein  29.15 
 
 
368 aa  80.1  0.00000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1809  secretion protein HlyD  29.23 
 
 
397 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1580  RND family efflux transporter MFP subunit  34.54 
 
 
365 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186167  normal  0.460313 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3362  RND family efflux transporter MFP subunit  31.37 
 
 
358 aa  79.7  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>