More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1163 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1163  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 379 aa  756    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1094  secretion protein HlyD family protein  42.25 
 
 		 359 aa  269  7e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3346  secretion protein HlyD family protein  36.46 
 
 		 390 aa  225  8e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  0.0983986 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4909  secretion protein HlyD family protein  32.98 
 
 		 404 aa  216  5e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.070438 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0983  secretion protein HlyD family protein  23.67 
 
 		 439 aa  89.7  7e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.213399  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5105  secretion protein HlyD family protein  25.84 
 
 		 498 aa  82.8  0.000000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2557  secretion protein HlyD  24.08 
 
 		 498 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1658  secretion protein HlyD family protein  23.63 
 
 		 330 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1842  secretion protein HlyD family protein  24.23 
 
 		 330 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0372122  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1500  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.98 
 
 		 473 aa  78.2  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  24.63 
 
 		 434 aa  77.8  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2430  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  22.4 
 
 		 379 aa  76.6  0.0000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000533378  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1567  hemolysin secretion protein D  25.98 
 
 		 473 aa  75.9  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.496852  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0636  secretion protein HlyD family protein  21.71 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0903899  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4148  HlyD family secretion protein  25.57 
 
 		 441 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  21.5 
 
 		 467 aa  72  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5422  HlyD family secretion protein  24.85 
 
 		 473 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970488  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2429  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.78 
 
 		 441 aa  70.9  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2093  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.75 
 
 		 468 aa  70.1  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0511  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.78 
 
 		 441 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1292  HlyD family secretion protein  25.18 
 
 		 461 aa  68.9  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.969928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14321  hypothetical protein  24.07 
 
 		 387 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.471821  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0709  secretion protein HlyD family protein  23.81 
 
 		 442 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000370496  normal  0.219221 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0426  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  21.73 
 
 		 383 aa  67.8  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0720  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  23.17 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000365102  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0004  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.22 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.197437  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6669  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.7 
 
 		 466 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00836718  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4382  secretion protein HlyD  25.96 
 
 		 515 aa  67.4  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  24.76 
 
 		 508 aa  67.4  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0954  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.41 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0382  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.65 
 
 		 460 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3819  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.68 
 
 		 514 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1183  leukotoxin secretion protein-like  23.31 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4600  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.59 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  22.63 
 
 		 372 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4511  secretion protein HlyD  19.14 
 
 		 449 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal  0.0817386 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1101  secretion protein, HlyD family  22.9 
 
 		 463 aa  65.1  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2137  type I secretion adaptor protein (HlyD family)  24.88 
 
 		 442 aa  65.1  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.83885  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8164  secretion protein HlyD family protein  22.58 
 
 		 443 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0162  HlyD family secretion protein  23.93 
 
 		 481 aa  64.7  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0042  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.88 
 
 		 442 aa  64.3  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1419  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  21.86 
 
 		 446 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.81 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3436  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.62 
 
 		 471 aa  64.3  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360287  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  28.06 
 
 		 429 aa  64.3  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.3 
 
 		 439 aa  63.9  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0623  secretion protein HlyD  24.05 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2276  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.64 
 
 		 389 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0253  secretion protein HlyD family protein  24.65 
 
 		 368 aa  63.5  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.195856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2437  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  18.73 
 
 		 428 aa  63.2  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  22.03 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.58 
 
 		 468 aa  62.8  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.93 
 
 		 511 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2575  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.43 
 
 		 480 aa  62.8  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303774 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0827  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.31 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.72853  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1216  secretion protein HlyD family protein  23.71 
 
 		 383 aa  62.8  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0651482  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0803  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.26 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0020  leukotoxin secretion protein D  28.67 
 
 		 479 aa  62  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0565  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.34 
 
 		 447 aa  62  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.84 
 
 		 471 aa  62  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0794  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.35 
 
 		 440 aa  61.2  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00028021  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0656  bacteriocin ABC transporter, putative  22.99 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.2243  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2178  secretion protein HlyD family protein  23.64 
 
 		 413 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3587  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.22 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50636  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1159  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.26 
 
 		 466 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.126981 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1836  secretion protein HlyD family protein  27.59 
 
 		 522 aa  61.6  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.161085  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1836  multidrug resistance efflux pump-like  24.77 
 
 		 431 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0902612  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6771  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.83 
 
 		 475 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0476  secretion protein HlyD  28.95 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0276  HlyD family secretion protein  23.72 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0227266  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1562  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.07 
 
 		 440 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3328  multidrug resistance efflux pump-like protein  24.77 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4177  multidrug resistance efflux pump-like  24.77 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216608  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4189  multidrug resistance efflux pump-like protein  24.77 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.378723 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4383  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.53 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.915143  normal  0.374406 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0842  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.57 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3260  HlyD family secretion protein  21.37 
 
 		 460 aa  60.1  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2368  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  19.52 
 
 		 447 aa  60.1  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1189  secretion protein HlyD  25.9 
 
 		 523 aa  59.7  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.981456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2986  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.74 
 
 		 443 aa  60.1  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1598  hlyD family secretion protein  19.47 
 
 		 389 aa  59.7  0.00000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0549137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  23.33 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2078  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.6 
 
 		 458 aa  58.9  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732091 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2059  HlyD family secretion protein  19.01 
 
 		 469 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3201  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.12 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.195077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6344  secretion protein HlyD family protein  22.56 
 
 		 387 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  19.94 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540903  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01311  hypothetical protein  22.28 
 
 		 347 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.420588 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1976  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.05 
 
 		 448 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3593  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.84 
 
 		 460 aa  58.2  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2195  HlyD family secretion protein  19.01 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  18.15 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3808  secretion protein HlyD family protein  27.52 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0541127 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00851  transporter component  20.85 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2661  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.54 
 
 		 473 aa  58.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7361  membrane-fusion protein  22.45 
 
 		 432 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661389  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1969  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.94 
 
 		 468 aa  58.9  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.786777  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0380  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.84 
 
 		 460 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1882  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.79 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0585  membrane spanning export protein  22.09 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.836061  normal  0.914553 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>