More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0720 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0720  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  100 
 
 		 380 aa  753    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000365102  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0426  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  31.39 
 
 		 383 aa  163  6e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2430  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  27.09 
 
 		 379 aa  134  3.9999999999999996e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000533378  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2264  hypothetical protein  34.27 
 
 		 627 aa  113  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0528  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.51 
 
 		 390 aa  99.4  9e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.178429 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.78 
 
 		 430 aa  98.2  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3260  HlyD family secretion protein  21.8 
 
 		 460 aa  92  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  21.32 
 
 		 441 aa  90.1  5e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  23.46 
 
 		 508 aa  89.7  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.58 
 
 		 439 aa  89.7  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3984  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.36 
 
 		 460 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3907  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.36 
 
 		 460 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4100  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.36 
 
 		 460 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.36 
 
 		 460 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0052  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.75 
 
 		 395 aa  87.8  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4141  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.44 
 
 		 460 aa  87  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.504346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0311  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.85 
 
 		 460 aa  87  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4909  secretion protein HlyD family protein  24.36 
 
 		 404 aa  86.7  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.070438 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2759  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.25 
 
 		 421 aa  86.3  8e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246245  normal  0.864922 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0276  HlyD family secretion protein  18.85 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0227266  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1747  secretion protein HlyD family protein  21.98 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.570517  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1500  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.9 
 
 		 473 aa  84.3  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1101  secretion protein, HlyD family  22.79 
 
 		 463 aa  84.3  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1842  secretion protein HlyD family protein  22.64 
 
 		 330 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0372122  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1163  secretion protein HlyD family protein  23.66 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3819  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  19.96 
 
 		 514 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3346  secretion protein HlyD family protein  23.28 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  0.0983986 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0382  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.43 
 
 		 460 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3644  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.43 
 
 		 460 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02941  HlyD family secretion protein  21.68 
 
 		 455 aa  82.8  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107369  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0623  secretion protein HlyD  22.54 
 
 		 360 aa  82.8  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4319  HlyD family secretion protein  22.66 
 
 		 484 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3593  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.66 
 
 		 460 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  20.92 
 
 		 468 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1882  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.78 
 
 		 430 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2661  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.5 
 
 		 473 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0164  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.18 
 
 		 487 aa  80.9  0.00000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.846875  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2429  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.3 
 
 		 441 aa  80.1  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0475  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.63 
 
 		 460 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.205035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2178  secretion protein HlyD family protein  25.45 
 
 		 413 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0892  acriflavine resistance protein  25.42 
 
 		 488 aa  79.7  0.00000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00239109  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1567  hemolysin secretion protein D  21 
 
 		 473 aa  79.7  0.00000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.496852  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.93 
 
 		 474 aa  79  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  18.81 
 
 		 511 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0366  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.52 
 
 		 460 aa  79  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0380  secretion protein HlyD family protein  20.57 
 
 		 393 aa  79.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000127057  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.41 
 
 		 439 aa  77.8  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1759  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.93 
 
 		 518 aa  77.4  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0119826 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0380  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.35 
 
 		 460 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0162  HlyD family secretion protein  20.09 
 
 		 481 aa  77  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0743  metalloprotease secretion protein  23.38 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.554659  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5422  HlyD family secretion protein  21.9 
 
 		 473 aa  77.4  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970488  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0434  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  31.14 
 
 		 460 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0636  secretion protein HlyD family protein  22 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0903899  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4345  secretion protein HlyD family protein  21.3 
 
 		 432 aa  76.6  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0751758  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2016  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.19 
 
 		 480 aa  75.5  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1825  secretion protein HlyD family protein  21.34 
 
 		 457 aa  75.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0793741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.17 
 
 		 472 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3121  secretion protein HlyD family protein  23.83 
 
 		 498 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0382  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.95 
 
 		 460 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2166  toxin secretion protein, HlyD family  21.34 
 
 		 445 aa  75.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1598  hlyD family secretion protein  24.33 
 
 		 389 aa  75.1  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0549137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1658  secretion protein HlyD family protein  21.71 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40230  putative secretion protein  22.96 
 
 		 395 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.975175  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1474  secretion system protein D  24.47 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  20.6 
 
 		 451 aa  74.3  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  22.86 
 
 		 434 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1969  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21 
 
 		 468 aa  74.3  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.786777  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3063  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.12 
 
 		 453 aa  73.9  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2843  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  20.11 
 
 		 404 aa  73.9  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6771  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.62 
 
 		 475 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3409  putative secretion protein  22.69 
 
 		 395 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202661  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1132  hypothetical protein  21.88 
 
 		 567 aa  73.2  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.107849  normal  0.642224 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0476  secretion protein HlyD  23.85 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1083  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  31.53 
 
 		 500 aa  73.2  0.000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.102695  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3025  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  20.71 
 
 		 437 aa  72.8  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1509  secretion system protein D  23.16 
 
 		 378 aa  72  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1419  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.55 
 
 		 446 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1292  HlyD family secretion protein  28.99 
 
 		 461 aa  72.4  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.969928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0794  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.98 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00028021  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  18.97 
 
 		 447 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540903  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0934  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  20.6 
 
 		 440 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0970473  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0621  secretion protein HlyD  27.62 
 
 		 710 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.749458  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0991  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  19.05 
 
 		 389 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0567  secretion protein HlyD family  25.13 
 
 		 491 aa  72  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  21.99 
 
 		 467 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00851  transporter component  22.34 
 
 		 391 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2399  secretion protein HlyD  26.67 
 
 		 467 aa  71.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105564  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0118  hemolysin secretion protein-like  22.22 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00640851  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5063  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.55 
 
 		 458 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14321  hypothetical protein  24.43 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.471821  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4324  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.64 
 
 		 403 aa  70.5  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.415601  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0786  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.13 
 
 		 472 aa  70.5  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.378265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5004  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  19.23 
 
 		 447 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_003296  RS03671  hemolysin secretion-like transmembrane protein  22.83 
 
 		 447 aa  70.1  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0656  bacteriocin ABC transporter, putative  22.19 
 
 		 370 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.2243  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0076  secretion protein HlyD family protein  24.19 
 
 		 506 aa  70.1  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1183  leukotoxin secretion protein-like  22.38 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07089  hypothetical protein  27.53 
 
 		 486 aa  69.7  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1640  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  21.98 
 
 		 445 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.893315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>