More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3819 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3819  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  100 
 
 
514 aa  1018    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891918  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  85.02 
 
 
511 aa  869    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3697  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  42.27 
 
 
481 aa  351  2e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.108936 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6495  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.34 
 
 
479 aa  335  1e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0883  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  41.68 
 
 
491 aa  330  4e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2575  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.36 
 
 
480 aa  273  4.0000000000000004e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00303774 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0567  secretion protein HlyD family  33.55 
 
 
491 aa  261  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3075  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  35.54 
 
 
473 aa  253  9.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.775261  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5422  HlyD family secretion protein  36.84 
 
 
473 aa  251  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970488  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  36 
 
 
467 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1969  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.42 
 
 
468 aa  244  3e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.786777  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2368  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.62 
 
 
447 aa  241  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  33.12 
 
 
457 aa  238  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.85 
 
 
447 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540903  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5004  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.17 
 
 
447 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4164  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.35 
 
 
469 aa  229  7e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.833076  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1567  hemolysin secretion protein D  34.98 
 
 
473 aa  228  2e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.496852  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.47 
 
 
456 aa  226  8e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.295152  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1890  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  33.47 
 
 
456 aa  226  8e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1500  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.69 
 
 
473 aa  224  3e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6669  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.19 
 
 
466 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00836718  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_003296  RS03671  hemolysin secretion-like transmembrane protein  35.87 
 
 
447 aa  213  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6771  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.31 
 
 
475 aa  209  8e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0020  leukotoxin secretion protein D  31.32 
 
 
479 aa  209  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1021  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  33.76 
 
 
444 aa  203  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.11 
 
 
465 aa  196  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.11 
 
 
465 aa  196  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.13 
 
 
472 aa  189  9e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4926  HlyD family secretion protein  32.85 
 
 
472 aa  188  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.39 
 
 
451 aa  172  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0983  secretion protein HlyD family protein  26.78 
 
 
439 aa  172  2e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.213399  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0004  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.38 
 
 
442 aa  158  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.197437  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  22.8 
 
 
434 aa  158  3e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6210  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.79 
 
 
480 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.596847  normal  0.481561 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0366  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.52 
 
 
460 aa  151  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2016  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.49 
 
 
480 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6406  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.17 
 
 
480 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1515  HlyD family secretion protein  35.86 
 
 
227 aa  148  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.619726 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1292  HlyD family secretion protein  29.84 
 
 
461 aa  148  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.969928  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1439  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.39 
 
 
488 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal  0.179501 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.06 
 
 
439 aa  147  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0162  HlyD family secretion protein  25.85 
 
 
481 aa  148  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1976  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.42 
 
 
448 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0311  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.05 
 
 
460 aa  145  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001011  ABC-type protease exporter membrane fusion protein (MFP) family component PrtE/AprE  24.79 
 
 
463 aa  145  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3260  HlyD family secretion protein  25.11 
 
 
460 aa  144  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1419  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.42 
 
 
446 aa  144  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4141  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.95 
 
 
460 aa  144  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.504346  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2301  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.61 
 
 
468 aa  143  6e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.98 
 
 
439 aa  143  6e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1159  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.73 
 
 
466 aa  143  8e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.126981 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0565  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.39 
 
 
447 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07089  hypothetical protein  24.79 
 
 
486 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1474  secretion system protein D  25.73 
 
 
378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3047  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.36 
 
 
477 aa  141  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.666099  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0475  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.1 
 
 
460 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.205035  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0636  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.27 
 
 
674 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.63 
 
 
468 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2243  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.39 
 
 
444 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3566  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.07 
 
 
463 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2823  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25 
 
 
443 aa  137  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.51941 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0382  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  21.67 
 
 
460 aa  137  5e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1802  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.27 
 
 
452 aa  137  7.000000000000001e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.520041 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0052  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.63 
 
 
395 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2661  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.85 
 
 
473 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3063  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.95 
 
 
453 aa  134  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2759  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.52 
 
 
421 aa  134  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246245  normal  0.864922 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0136  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.57 
 
 
455 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1212  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.32 
 
 
453 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02941  HlyD family secretion protein  26.24 
 
 
455 aa  134  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107369  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1663  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.94 
 
 
472 aa  134  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.131459 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0794  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.68 
 
 
440 aa  133  6e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00028021  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0786  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.17 
 
 
472 aa  133  7.999999999999999e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.378265  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2502  secretion protein  29.76 
 
 
439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.867679 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4319  HlyD family secretion protein  24.95 
 
 
484 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4600  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.67 
 
 
410 aa  132  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1882  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.51 
 
 
430 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3593  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.51 
 
 
460 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2078  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.3 
 
 
458 aa  132  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.732091 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3020  HlyD family secretion protein  36.82 
 
 
179 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.133267 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1101  secretion protein, HlyD family  22.86 
 
 
463 aa  130  7.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3148  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.23 
 
 
416 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0585  membrane spanning export protein  27.17 
 
 
391 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.836061  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0382  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.3 
 
 
460 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3644  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.3 
 
 
460 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5972  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.03 
 
 
433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.802564  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0434  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  22.2 
 
 
460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3984  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.66 
 
 
460 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4100  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.66 
 
 
460 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3907  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.66 
 
 
460 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4511  secretion protein HlyD  27.55 
 
 
449 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal  0.0817386 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.66 
 
 
460 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0380  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.95 
 
 
460 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1759  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.17 
 
 
518 aa  128  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0119826 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.39 
 
 
427 aa  128  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0862799 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2986  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.32 
 
 
443 aa  128  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3811  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.58 
 
 
451 aa  127  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739118 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0761  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.77 
 
 
389 aa  127  6e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011649  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.07 
 
 
430 aa  126  8.000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6372  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.19 
 
 
474 aa  126  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17068  normal  0.732434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>