More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1567 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1500  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  98.31 
 
 		 473 aa  944    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1567  hemolysin secretion protein D  100 
 
 		 473 aa  956    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.496852  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2575  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  44.4 
 
 		 480 aa  387  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303774 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6771  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  42.46 
 
 		 475 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3075  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  42.27 
 
 		 473 aa  342  1e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.775261  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4926  HlyD family secretion protein  41.6 
 
 		 472 aa  320  5e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.69 
 
 		 447 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540903  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0020  leukotoxin secretion protein D  36.25 
 
 		 479 aa  311  2e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1969  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.11 
 
 		 468 aa  302  8.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.786777  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  39.37 
 
 		 457 aa  299  7e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03671  hemolysin secretion-like transmembrane protein  39.45 
 
 		 447 aa  298  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5004  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.79 
 
 		 447 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2368  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  37.34 
 
 		 447 aa  293  4e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.98 
 
 		 456 aa  279  9e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.295152  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1890  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  38.98 
 
 		 456 aa  279  9e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  36.34 
 
 		 467 aa  277  3e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4164  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.33 
 
 		 469 aa  266  5.999999999999999e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.833076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5422  HlyD family secretion protein  36.21 
 
 		 473 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970488  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  35.88 
 
 		 511 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1021  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  37 
 
 		 444 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3819  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.98 
 
 		 514 aa  228  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.06 
 
 		 472 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0983  secretion protein HlyD family protein  29.44 
 
 		 439 aa  219  1e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.213399  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  28.32 
 
 		 434 aa  217  4e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6495  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.71 
 
 		 479 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.47 
 
 		 451 aa  204  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6669  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.55 
 
 		 466 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00836718  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3697  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.69 
 
 		 481 aa  200  6e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.108936 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0567  secretion protein HlyD family  30 
 
 		 491 aa  196  8.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0162  HlyD family secretion protein  32.95 
 
 		 481 aa  196  9e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0883  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.11 
 
 		 491 aa  189  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.66 
 
 		 465 aa  186  8e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.66 
 
 		 465 aa  186  8e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1976  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.31 
 
 		 448 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3593  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.98 
 
 		 460 aa  181  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4100  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.18 
 
 		 460 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3984  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.18 
 
 		 460 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3907  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.18 
 
 		 460 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.18 
 
 		 460 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07089  hypothetical protein  29.63 
 
 		 486 aa  178  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001011  ABC-type protease exporter membrane fusion protein (MFP) family component PrtE/AprE  30.72 
 
 		 463 aa  177  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2823  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.53 
 
 		 443 aa  175  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.51941 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4319  HlyD family secretion protein  28.76 
 
 		 484 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0380  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.99 
 
 		 460 aa  172  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1101  secretion protein, HlyD family  29.32 
 
 		 463 aa  171  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0794  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.29 
 
 		 440 aa  171  3e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00028021  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2759  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.43 
 
 		 421 aa  170  5e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246245  normal  0.864922 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5972  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.75 
 
 		 433 aa  168  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.802564  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1419  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.81 
 
 		 446 aa  168  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0382  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.09 
 
 		 460 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3644  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.09 
 
 		 460 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1474  secretion system protein D  29.01 
 
 		 378 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0892  acriflavine resistance protein  26.92 
 
 		 488 aa  164  3e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00239109  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6210  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.82 
 
 		 480 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.596847  normal  0.481561 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1159  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.62 
 
 		 466 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.126981 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3201  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.77 
 
 		 471 aa  163  6e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.195077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2301  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.86 
 
 		 468 aa  163  6e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0366  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.57 
 
 		 460 aa  163  6e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1212  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.41 
 
 		 453 aa  163  8.000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3047  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.02 
 
 		 477 aa  162  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.666099  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0311  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.27 
 
 		 460 aa  162  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6075  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.97 
 
 		 474 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0374496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6372  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.97 
 
 		 474 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17068  normal  0.732434 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0164  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.88 
 
 		 487 aa  160  3e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.846875  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3260  HlyD family secretion protein  28.07 
 
 		 460 aa  160  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.51 
 
 		 439 aa  160  5e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1802  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.04 
 
 		 452 aa  159  8e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.520041 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4141  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.85 
 
 		 460 aa  159  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.504346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.46 
 
 		 468 aa  159  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6406  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.84 
 
 		 480 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2502  secretion protein  32.94 
 
 		 439 aa  159  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.867679 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0636  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.36 
 
 		 674 aa  159  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2889  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.36 
 
 		 396 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0810996 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2838  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.36 
 
 		 396 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1509  secretion system protein D  28.07 
 
 		 378 aa  158  3e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2907  type I secretion membrane fusion protein HlyD family  29.36 
 
 		 396 aa  158  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.891206  normal  0.048093 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5063  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.95 
 
 		 458 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1515  HlyD family secretion protein  36.2 
 
 		 227 aa  157  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.619726 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3021  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.12 
 
 		 396 aa  156  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0405011 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2908  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.12 
 
 		 396 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.38 
 
 		 439 aa  155  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3811  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.83 
 
 		 451 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739118 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0136  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.66 
 
 		 455 aa  155  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0184  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.6 
 
 		 458 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326203 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3063  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.9 
 
 		 453 aa  155  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4383  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.81 
 
 		 394 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.915143  normal  0.374406 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2243  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.64 
 
 		 444 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.35 
 
 		 458 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000605389 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1882  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.41 
 
 		 430 aa  154  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0185  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.12 
 
 		 458 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.116801 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2412  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.48 
 
 		 399 aa  153  7e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.449428  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3769  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.78 
 
 		 471 aa  152  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1292  HlyD family secretion protein  28.08 
 
 		 461 aa  152  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.969928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.89 
 
 		 430 aa  151  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0565  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.54 
 
 		 447 aa  151  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2016  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.25 
 
 		 480 aa  151  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0434  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  27.09 
 
 		 460 aa  151  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4600  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.13 
 
 		 410 aa  150  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0803  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.3 
 
 		 394 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0382  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.7 
 
 		 460 aa  150  7e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>