More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_00851 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_00851  transporter component  100 
 
 
391 aa  779    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2526  leukotoxin secretion protein  60.2 
 
 
417 aa  465  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0218  leukotoxin secretion protein  57.87 
 
 
396 aa  434  1e-120  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21021  leukotoxin secretion protein-like protein  48.01 
 
 
376 aa  347  3e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.825476 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1225  transporter component  44.74 
 
 
377 aa  314  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.107173  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14321  hypothetical protein  42.31 
 
 
387 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.471821  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  35.38 
 
 
441 aa  241  2e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01311  hypothetical protein  33.89 
 
 
347 aa  206  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.420588 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0118  hemolysin secretion protein-like  32.67 
 
 
417 aa  189  8e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00640851  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1183  leukotoxin secretion protein-like  31.87 
 
 
317 aa  172  9e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1842  secretion protein HlyD family protein  32.78 
 
 
330 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0372122  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3579  secretion protein HlyD family protein  45.85 
 
 
589 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602098 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1836  secretion protein HlyD family protein  34.24 
 
 
522 aa  156  7e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.161085  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1658  secretion protein HlyD family protein  31.94 
 
 
330 aa  155  9e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1189  secretion protein HlyD  46.51 
 
 
523 aa  155  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.981456  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0527  secretion protein HlyD family protein  42.44 
 
 
576 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0544  secretion protein HlyD family protein  42.44 
 
 
576 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.212185  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0636  secretion protein HlyD family protein  29.95 
 
 
329 aa  152  7e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0903899  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  28.85 
 
 
457 aa  124  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1567  hemolysin secretion protein D  27.08 
 
 
473 aa  119  9e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.496852  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1500  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.78 
 
 
473 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.14 
 
 
451 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0991  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.2 
 
 
389 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1509  secretion system protein D  26.75 
 
 
378 aa  107  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1474  secretion system protein D  26.75 
 
 
378 aa  106  7e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3320  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.25 
 
 
389 aa  106  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6669  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.46 
 
 
466 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00836718  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40230  putative secretion protein  27.4 
 
 
395 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.975175  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6771  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.71 
 
 
475 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0794  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.11 
 
 
440 aa  102  9e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00028021  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3409  putative secretion protein  27.12 
 
 
395 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202661  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0473  secretion protein HylD  26.53 
 
 
457 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150139  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2430  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  24.93 
 
 
379 aa  98.2  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000533378  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0983  secretion protein HlyD family protein  24.64 
 
 
439 aa  98.2  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.213399  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.37 
 
 
465 aa  98.2  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.37 
 
 
465 aa  98.2  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  32.79 
 
 
508 aa  97.4  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0883  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.61 
 
 
491 aa  96.7  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4000  secretion protein HlyD family protein  25.82 
 
 
457 aa  96.7  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3819  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.57 
 
 
514 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891918  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.6 
 
 
511 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0052  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.6 
 
 
395 aa  96.3  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3836  secretion protein HlyD family protein  24.82 
 
 
457 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.929001 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2016  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.55 
 
 
480 aa  94.7  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3265  secretion protein HlyD family protein  26.34 
 
 
549 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2856  secretion protein HlyD family protein  26.34 
 
 
549 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0279875 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2759  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.7 
 
 
421 aa  94.7  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246245  normal  0.864922 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0761  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.98 
 
 
389 aa  94  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011649  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.63 
 
 
472 aa  92  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1890  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  39.47 
 
 
456 aa  92.8  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4164  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.77 
 
 
469 aa  92.4  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.833076  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  39.47 
 
 
456 aa  92.8  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.295152  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  32.61 
 
 
467 aa  91.7  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0164  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24 
 
 
487 aa  92  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.846875  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4926  HlyD family secretion protein  24.15 
 
 
472 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0892  acriflavine resistance protein  24 
 
 
488 aa  90.5  5e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00239109  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  24.88 
 
 
434 aa  89  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0623  secretion protein HlyD  25.07 
 
 
360 aa  89  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3075  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  21.72 
 
 
473 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.775261  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.93 
 
 
427 aa  88.2  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0862799 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0842  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.71 
 
 
394 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4600  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.43 
 
 
410 aa  87.8  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3148  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.2 
 
 
416 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4456  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.15 
 
 
438 aa  87.4  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715639  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0787  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.98 
 
 
403 aa  87.4  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5972  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.29 
 
 
433 aa  87  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.802564  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0585  membrane spanning export protein  25 
 
 
391 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.836061  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3697  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.09 
 
 
481 aa  86.7  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.108936 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1882  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.48 
 
 
430 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.5 
 
 
430 aa  85.5  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6210  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.95 
 
 
480 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.596847  normal  0.481561 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1021  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.84 
 
 
444 aa  85.1  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0827  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.42 
 
 
394 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.72853  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0803  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.35 
 
 
394 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1598  hlyD family secretion protein  24.38 
 
 
389 aa  84.3  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0549137  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4383  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.35 
 
 
394 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.915143  normal  0.374406 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  26.71 
 
 
349 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6406  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.05 
 
 
480 aa  83.2  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0276  HlyD family secretion protein  22.72 
 
 
390 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0227266  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4148  HlyD family secretion protein  26.09 
 
 
441 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1802  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.2 
 
 
452 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.520041 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2429  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.19 
 
 
441 aa  81.6  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4382  secretion protein HlyD  30.86 
 
 
515 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1052  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.57 
 
 
449 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  24.32 
 
 
344 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2276  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.75 
 
 
389 aa  80.1  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0927  secretion protein HlyD  25.41 
 
 
460 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0303688  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3712  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.81 
 
 
390 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.01612  normal  0.250186 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6372  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.35 
 
 
474 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17068  normal  0.732434 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0411  secretion protein HlyD family protein  22.52 
 
 
504 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3021  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.87 
 
 
396 aa  80.1  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0405011 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2823  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.35 
 
 
443 aa  80.1  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.51941 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6075  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.35 
 
 
474 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0374496  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1969  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.79 
 
 
468 aa  80.1  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.786777  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.22 
 
 
439 aa  79.7  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2908  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.87 
 
 
396 aa  80.1  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3518  secretion protein HlyD family protein  36.36 
 
 
550 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1976  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.68 
 
 
448 aa  79.7  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2412  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.13 
 
 
399 aa  79.3  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.449428  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  24.32 
 
 
355 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0127928 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>