More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1132 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1132  hypothetical protein  100 
 
 
567 aa  1150    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.107849  normal  0.642224 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2399  secretion protein HlyD  37.2 
 
 
467 aa  263  8.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105564  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0076  secretion protein HlyD family protein  35.37 
 
 
506 aa  259  9e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0623  secretion protein HlyD  34.35 
 
 
360 aa  207  4e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0235  secretion protein HlyD  29.92 
 
 
500 aa  196  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0621  secretion protein HlyD  38 
 
 
710 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.749458  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1015  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
839 aa  116  7.999999999999999e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0741142  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2430  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  25.53 
 
 
379 aa  107  6e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000533378  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4511  secretion protein HlyD  25.47 
 
 
449 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal  0.0817386 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0426  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  23.92 
 
 
383 aa  100  6e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0528  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.95 
 
 
390 aa  94.4  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.178429 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2059  HlyD family secretion protein  25.06 
 
 
469 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4382  secretion protein HlyD  28.11 
 
 
515 aa  92  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2195  HlyD family secretion protein  24.81 
 
 
471 aa  90.5  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  26.79 
 
 
508 aa  90.5  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6495  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.28 
 
 
479 aa  87  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.71 
 
 
427 aa  86.7  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0862799 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33.78 
 
 
465 aa  85.5  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33.78 
 
 
465 aa  85.5  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5972  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.93 
 
 
433 aa  85.1  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.802564  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4148  HlyD family secretion protein  25.3 
 
 
441 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0511  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.51 
 
 
441 aa  84  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1598  hlyD family secretion protein  26.09 
 
 
389 aa  84.3  0.000000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0549137  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.77 
 
 
451 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2429  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.63 
 
 
441 aa  82.8  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1969  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.17 
 
 
468 aa  82.4  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.786777  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0567  secretion protein HlyD family  22.2 
 
 
491 aa  82  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1825  secretion protein HlyD family protein  22.82 
 
 
457 aa  81.3  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0793741  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2166  toxin secretion protein, HlyD family  22.74 
 
 
445 aa  81.3  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.23 
 
 
439 aa  79.7  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2276  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.28 
 
 
389 aa  79.3  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  26.36 
 
 
366 aa  79.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6669  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.91 
 
 
466 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00836718  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0883  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.93 
 
 
491 aa  78.6  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2759  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  20.53 
 
 
421 aa  78.6  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246245  normal  0.864922 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0411  secretion protein HlyD family protein  21 
 
 
504 aa  77.4  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.74 
 
 
468 aa  77  0.0000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2137  type I secretion adaptor protein (HlyD family)  23.11 
 
 
442 aa  76.6  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.83885  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0052  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.2 
 
 
395 aa  76.6  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1882  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.65 
 
 
430 aa  75.9  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2178  secretion protein HlyD family protein  21.67 
 
 
413 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2986  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.54 
 
 
443 aa  75.1  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3892  secretion protein HlyD family protein  29.93 
 
 
352 aa  75.1  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1802  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.72 
 
 
452 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.520041 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2264  hypothetical protein  26.9 
 
 
627 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2016  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.64 
 
 
480 aa  74.7  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3148  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.81 
 
 
416 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0709  secretion protein HlyD family protein  21.92 
 
 
442 aa  73.9  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000370496  normal  0.219221 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1509  secretion system protein D  21.54 
 
 
378 aa  73.6  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1797  HlyD family secretion protein  25.29 
 
 
441 aa  73.6  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250049  normal  0.0164192 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  24.38 
 
 
344 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0842  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.9 
 
 
394 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3819  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.77 
 
 
514 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891918  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0476  secretion protein HlyD  22.81 
 
 
413 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  23.08 
 
 
434 aa  73.2  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0042  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.17 
 
 
442 aa  72.4  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.48 
 
 
511 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5422  HlyD family secretion protein  22.62 
 
 
473 aa  72.4  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970488  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2166  secretion protein HlyD family protein  23.53 
 
 
431 aa  72.4  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.892226  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0803  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.97 
 
 
394 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0827  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.97 
 
 
394 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.72853  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  25 
 
 
375 aa  71.6  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0224  secretion protein HlyD  24.09 
 
 
627 aa  71.6  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.538127  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1439  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.42 
 
 
488 aa  71.6  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal  0.179501 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1500  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.49 
 
 
473 aa  71.2  0.00000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4383  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.77 
 
 
394 aa  70.9  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.915143  normal  0.374406 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.17 
 
 
474 aa  70.5  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2437  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.52 
 
 
428 aa  70.5  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  23.55 
 
 
355 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00851  transporter component  22.89 
 
 
391 aa  70.5  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1191  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  21.75 
 
 
424 aa  70.5  0.00000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.795272  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3566  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.97 
 
 
463 aa  69.7  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14321  hypothetical protein  24.35 
 
 
387 aa  70.1  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.471821  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3423  secretion protein HlyD family protein  22.5 
 
 
509 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678336  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2078  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.96 
 
 
458 aa  70.1  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.732091 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1419  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.44 
 
 
446 aa  69.3  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2681  secretion protein HlyD family protein  22.5 
 
 
509 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1212  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.61 
 
 
453 aa  68.6  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2907  type I secretion membrane fusion protein HlyD family  25.21 
 
 
396 aa  68.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.891206  normal  0.048093 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3061  secretion protein HlyD family protein  25.5 
 
 
424 aa  68.2  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.404759  normal  0.464933 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2838  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.21 
 
 
396 aa  68.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6344  secretion protein HlyD family protein  21.57 
 
 
387 aa  68.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0164  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  19.37 
 
 
487 aa  68.6  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.846875  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2889  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.21 
 
 
396 aa  68.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0810996 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1759  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.45 
 
 
518 aa  68.6  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0119826 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6075  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.47 
 
 
474 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0374496  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2908  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.21 
 
 
396 aa  68.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3409  putative secretion protein  27.11 
 
 
395 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202661  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  22.3 
 
 
467 aa  68.2  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6372  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.47 
 
 
474 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17068  normal  0.732434 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40230  putative secretion protein  22.6 
 
 
395 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.975175  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1567  hemolysin secretion protein D  23.24 
 
 
473 aa  67.8  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.496852  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3021  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.79 
 
 
396 aa  67.8  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0405011 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01311  hypothetical protein  25.08 
 
 
347 aa  67.8  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.420588 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0730  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.13 
 
 
455 aa  67.8  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.187305  normal  0.492023 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1497  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.55 
 
 
407 aa  67.8  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.30393  hitchhiker  0.00778895 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1774  secretion protein HlyD family protein  24.47 
 
 
355 aa  67.4  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1474  secretion system protein D  28.1 
 
 
378 aa  67.4  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0934  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.45 
 
 
440 aa  67.8  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0970473  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2661  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.44 
 
 
473 aa  67.4  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>