More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1797 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1797  HlyD family secretion protein  100 
 
 
441 aa  894    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250049  normal  0.0164192 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1406  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  90.7 
 
 
441 aa  821    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.575733  normal  0.479497 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0934  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  73.92 
 
 
440 aa  662    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0970473  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16250  Type I secretion membrane fusion protein  66.74 
 
 
441 aa  575  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0719  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  53.99 
 
 
438 aa  462  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0040  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  40.75 
 
 
492 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0639189  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1817  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  40.19 
 
 
455 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000964329  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1706  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  37.16 
 
 
431 aa  287  2e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2544  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  40.34 
 
 
437 aa  280  4e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.110449  normal  0.225812 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0458  sape  35.43 
 
 
427 aa  269  7e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00190667  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02273  HlyD family secretion protein  36.04 
 
 
436 aa  268  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4337  putative toxin/protease secretion system  36.79 
 
 
661 aa  263  6e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165043  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6291  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  39.6 
 
 
442 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.702424  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2542  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  37.76 
 
 
446 aa  262  8e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1562  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  39 
 
 
440 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1643  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  37.87 
 
 
453 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0584  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  37.32 
 
 
455 aa  261  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.767498  normal  0.0809109 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2862  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  37.5 
 
 
455 aa  260  4e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1346  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  34.67 
 
 
462 aa  257  3e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7140  HlyD family secretion protein  36.72 
 
 
446 aa  256  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.706887  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2967  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  36.6 
 
 
448 aa  256  7e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.34356  normal  0.656863 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2740  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.6 
 
 
448 aa  256  7e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3318  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.21 
 
 
447 aa  256  7e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2513  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  37.04 
 
 
420 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3383  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.96 
 
 
435 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2559  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.78 
 
 
446 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.188879 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.78 
 
 
446 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.55639 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0801  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  36.63 
 
 
440 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3886  putative RTX secretion protein D  34.44 
 
 
447 aa  246  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.652406  normal  0.810853 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3355  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.29 
 
 
446 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1281  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  33.72 
 
 
454 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3225  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  38.31 
 
 
435 aa  244  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3025  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  35.54 
 
 
437 aa  241  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4145  alkaline protease secretion protein AprE  33.66 
 
 
432 aa  240  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3160  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32.8 
 
 
445 aa  240  4e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.22456  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0246  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33.25 
 
 
480 aa  239  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.777594  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0970  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.39 
 
 
505 aa  239  9e-62  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.995954  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0649  HlyD family secretion protein  31.71 
 
 
506 aa  238  2e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0155  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.32 
 
 
505 aa  236  7e-61  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.353804  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3973  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.91 
 
 
479 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20040  metalloprotease secretion protein  34.64 
 
 
443 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0389263  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48100  alkaline protease secretion protein AprE  34.22 
 
 
432 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322213 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2977  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  37.24 
 
 
435 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0275  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.78 
 
 
481 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2108  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.42 
 
 
448 aa  233  7.000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1724  metalloprotease secretion protein  34.15 
 
 
443 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3329  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.01 
 
 
417 aa  229  6e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.40218  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1597  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.47 
 
 
443 aa  227  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.362914  normal  0.115374 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3436  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.87 
 
 
471 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360287  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4391  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.8 
 
 
438 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.687432 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2681  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32.94 
 
 
449 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293137 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0794  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.25 
 
 
433 aa  223  7e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2906  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.7 
 
 
442 aa  223  8e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4813  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.16 
 
 
456 aa  222  9e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.474577  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1556  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.98 
 
 
442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3587  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.31 
 
 
408 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50636  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3834  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32.81 
 
 
439 aa  218  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0519478  normal  0.0754142 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3995  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33.26 
 
 
449 aa  216  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2204  secretion protein HlyD family protein  32.48 
 
 
392 aa  215  9.999999999999999e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1113  ABC transporter membrane spanning protein (bacteriocin)  30.3 
 
 
462 aa  215  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1563  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  33.26 
 
 
451 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.838754  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4324  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33.64 
 
 
449 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5906  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.79 
 
 
454 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418691  hitchhiker  0.00374749 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1408  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33.73 
 
 
452 aa  212  9e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0893  RTX secretion protein D  30.84 
 
 
433 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276128  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.84 
 
 
433 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.768701  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2600  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.49 
 
 
444 aa  211  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0114  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.1 
 
 
433 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0685446  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1509  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.52 
 
 
471 aa  209  6e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.81 
 
 
445 aa  209  6e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0939  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.95 
 
 
494 aa  209  8e-53  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0743  metalloprotease secretion protein  31.06 
 
 
389 aa  209  9e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.554659  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2037  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.4 
 
 
477 aa  209  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0271  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.35 
 
 
457 aa  207  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0138  type I secretion membrane fusion protein  31.1 
 
 
435 aa  206  9e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1162  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.25 
 
 
460 aa  206  9e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.793756 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8003  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.46 
 
 
460 aa  206  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0617  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.41 
 
 
432 aa  205  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290614  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1275  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.53 
 
 
460 aa  204  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0751929 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1665  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.25 
 
 
448 aa  204  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195288  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.17 
 
 
439 aa  205  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1982  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33.42 
 
 
448 aa  204  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4712  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.27 
 
 
473 aa  204  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.0413693 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2478  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.7 
 
 
440 aa  204  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1322  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.11 
 
 
458 aa  204  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2949  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.68 
 
 
447 aa  203  6e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4083  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.86 
 
 
442 aa  202  9e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0963  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.91 
 
 
447 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0133  HlyD family hemolysin secretion protein  30.86 
 
 
442 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0380  secretion protein HlyD family protein  31.78 
 
 
393 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000127057  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1747  secretion protein HlyD family protein  32.55 
 
 
393 aa  199  9e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.570517  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3891  HlyD family hemolysin secretion protein  30.62 
 
 
442 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.76201 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1640  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32.09 
 
 
445 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.893315 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2016  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.33 
 
 
480 aa  197  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0681  metalloprotease secretion protein  30.66 
 
 
393 aa  196  5.000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.123046  normal  0.158856 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4335  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.18 
 
 
443 aa  196  7e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526899  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1760  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.77 
 
 
453 aa  196  9e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.3 
 
 
471 aa  195  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0245  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  33.41 
 
 
446 aa  193  4e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0434  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.53 
 
 
435 aa  193  6e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>