More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6344 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012854  Rleg_6344  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 387 aa  780    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2948  secretion protein, putative  28.72 
 
 		 538 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1825  secretion protein HlyD family protein  28.06 
 
 		 457 aa  159  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0793741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0554  colicin V secretion protein  28.46 
 
 		 420 aa  158  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2166  toxin secretion protein, HlyD family  28.06 
 
 		 445 aa  158  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0947  auxiliary membrane fusion protein family transporter  26.44 
 
 		 418 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2178  secretion protein HlyD family protein  27.37 
 
 		 413 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0489  colicin V secretion protein  28.19 
 
 		 420 aa  157  3e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41045  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10350  putative secretion protein  26.13 
 
 		 418 aa  156  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3157  putative secretion protein  26.81 
 
 		 422 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.51351  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0044  putative secretion protein  26.81 
 
 		 422 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3642  putative secretion protein  26.81 
 
 		 422 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3618  putative secretion protein  26.81 
 
 		 422 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1723  putative secretion protein  26.81 
 
 		 422 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.297844  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01631  membrane-fusion protein  30.93 
 
 		 414 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.160838  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4345  secretion protein HlyD family protein  28.39 
 
 		 432 aa  154  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0751758  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1957  secretion protein HlyD family protein  29.66 
 
 		 458 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.54503  normal  0.703042 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2820  secretion protein, putative  26.81 
 
 		 603 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.713157  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0050  toxin secretion, membrane fusion protein  29.1 
 
 		 415 aa  151  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.516709  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3625  secretion protein, putative  26.81 
 
 		 603 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.268433  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0476  secretion protein HlyD  26.53 
 
 		 413 aa  151  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1583  secretion protein HlyD family protein  28.75 
 
 		 414 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1144  anibiotic ABC transporter efflux pump  30.35 
 
 		 419 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0783269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3794  membrane-fusion protein  25.75 
 
 		 428 aa  143  6e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108717 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4509  putative toxin secretion protein  26.08 
 
 		 418 aa  142  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4439  secretion protein HlyD family protein  27.48 
 
 		 429 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4072  secretion protein HlyD family protein  27.48 
 
 		 429 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4553  secretion protein HlyD family protein  28.54 
 
 		 429 aa  139  6e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03509  membrane-fusion protein  23.5 
 
 		 417 aa  139  7e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8164  secretion protein HlyD family protein  28.29 
 
 		 443 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3061  secretion protein HlyD family protein  28.5 
 
 		 424 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.404759  normal  0.464933 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3808  secretion protein HlyD family protein  25.12 
 
 		 419 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0541127 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4873  secretion protein HlyD family protein  26.5 
 
 		 461 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.152026 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2166  secretion protein HlyD family protein  26.3 
 
 		 431 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.892226  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1140  secretion protein, putative  25.99 
 
 		 431 aa  122  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1732  putative secretion protein  26.54 
 
 		 431 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1002  putative secretion protein  26.54 
 
 		 431 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0289  secretion protein, putative  26.54 
 
 		 431 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1320  putative secretion protein  26.54 
 
 		 431 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600864  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0276  putative secretion protein  26.54 
 
 		 431 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396567  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1816  putative secretion protein  26.54 
 
 		 431 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0165273  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2316  secretion protein HlyD family protein  25.71 
 
 		 431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3756  HlyD family secretion protein  25.69 
 
 		 435 aa  112  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229051  normal  0.0155871 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2137  type I secretion adaptor protein (HlyD family)  25.24 
 
 		 442 aa  111  3e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.83885  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0042  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25 
 
 		 442 aa  110  5e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1836  multidrug resistance efflux pump-like  26.87 
 
 		 431 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0902612  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1567  hemolysin secretion protein D  25.12 
 
 		 473 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.496852  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  23.95 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1500  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.88 
 
 		 473 aa  107  4e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3328  multidrug resistance efflux pump-like protein  26.62 
 
 		 431 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4177  multidrug resistance efflux pump-like  26.62 
 
 		 431 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216608  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4189  multidrug resistance efflux pump-like protein  26.62 
 
 		 431 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.378723 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2575  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.6 
 
 		 480 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303774 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.18 
 
 		 465 aa  104  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.18 
 
 		 465 aa  104  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3819  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.48 
 
 		 514 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3697  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.5 
 
 		 481 aa  99.8  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.108936 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.76 
 
 		 472 aa  98.6  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2368  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.41 
 
 		 447 aa  98.6  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6771  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.06 
 
 		 475 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0983  secretion protein HlyD family protein  23.73 
 
 		 439 aa  96.7  6e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.213399  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0106  MFP family transporter  22.42 
 
 		 430 aa  96.7  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0106  MFP family transporter  22.42 
 
 		 430 aa  96.7  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4109  secretion protein HlyD family protein  22.42 
 
 		 430 aa  96.7  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.511066  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6495  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.1 
 
 		 479 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03671  hemolysin secretion-like transmembrane protein  25.81 
 
 		 447 aa  94.4  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0567  secretion protein HlyD family  23.86 
 
 		 491 aa  94.4  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.06 
 
 		 511 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  22.68 
 
 		 508 aa  93.6  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1969  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.64 
 
 		 468 aa  93.6  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.786777  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6669  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.87 
 
 		 466 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00836718  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0730  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.36 
 
 		 455 aa  92.8  9e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.187305  normal  0.492023 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5422  HlyD family secretion protein  33.33 
 
 		 473 aa  92  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970488  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1474  secretion system protein D  23.56 
 
 		 378 aa  90.9  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.95 
 
 		 451 aa  90.9  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0118  hemolysin secretion protein-like  25.2 
 
 		 417 aa  89.4  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00640851  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04478  putative membrane fusion protein/putative ABC transporter protein required for AvrXa21 activity A (raxA)  23.06 
 
 		 412 aa  89  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3121  secretion protein HlyD family protein  26.37 
 
 		 498 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  24.94 
 
 		 441 aa  88.6  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3047  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.3 
 
 		 477 aa  88.6  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.666099  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.95 
 
 		 447 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540903  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1890  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  23.72 
 
 		 456 aa  87.4  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1509  secretion system protein D  24.08 
 
 		 378 aa  87.4  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.72 
 
 		 456 aa  87.4  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.295152  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1976  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.28 
 
 		 448 aa  87.4  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  27.43 
 
 		 467 aa  86.7  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0020  leukotoxin secretion protein D  25.24 
 
 		 479 aa  86.7  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  28.81 
 
 		 457 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0794  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.24 
 
 		 440 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00028021  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.28 
 
 		 430 aa  84.7  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5004  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.95 
 
 		 447 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6210  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.8 
 
 		 480 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.596847  normal  0.481561 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.02 
 
 		 439 aa  84.3  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0883  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.42 
 
 		 491 aa  83.6  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2557  secretion protein HlyD  24.53 
 
 		 498 aa  82.8  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2759  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.82 
 
 		 421 aa  82.8  0.000000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246245  normal  0.864922 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2526  leukotoxin secretion protein  25.9 
 
 		 417 aa  82.4  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0528  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.5 
 
 		 390 aa  82.4  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.178429 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4083  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.77 
 
 		 442 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0133  HlyD family hemolysin secretion protein  21.53 
 
 		 442 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>