More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4553 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4439  secretion protein HlyD family protein  93.01 
 
 		 429 aa  778    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4072  secretion protein HlyD family protein  93.01 
 
 		 429 aa  778    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4553  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 429 aa  845    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4873  secretion protein HlyD family protein  72.94 
 
 		 461 aa  620  1e-176  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.152026 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2166  secretion protein HlyD family protein  37.71 
 
 		 431 aa  273  5.000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.892226  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4345  secretion protein HlyD family protein  37.71 
 
 		 432 aa  262  8e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0751758  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3794  membrane-fusion protein  37.32 
 
 		 428 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108717 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2948  secretion protein, putative  34.38 
 
 		 538 aa  224  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1957  secretion protein HlyD family protein  36.57 
 
 		 458 aa  223  6e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.54503  normal  0.703042 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0554  colicin V secretion protein  33.01 
 
 		 420 aa  222  8e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0489  colicin V secretion protein  32.78 
 
 		 420 aa  222  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41045  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3618  putative secretion protein  33.41 
 
 		 422 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3642  putative secretion protein  33.41 
 
 		 422 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1723  putative secretion protein  33.41 
 
 		 422 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.297844  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3157  putative secretion protein  33.41 
 
 		 422 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.51351  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0044  putative secretion protein  33.41 
 
 		 422 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2820  secretion protein, putative  33.57 
 
 		 603 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.713157  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3625  secretion protein, putative  33.57 
 
 		 603 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.268433  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1583  secretion protein HlyD family protein  32.46 
 
 		 414 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0947  auxiliary membrane fusion protein family transporter  33.1 
 
 		 418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10350  putative secretion protein  32.62 
 
 		 418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1144  anibiotic ABC transporter efflux pump  30.73 
 
 		 419 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0783269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01631  membrane-fusion protein  31.08 
 
 		 414 aa  197  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.160838  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8164  secretion protein HlyD family protein  30.7 
 
 		 443 aa  187  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3061  secretion protein HlyD family protein  30.23 
 
 		 424 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.404759  normal  0.464933 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0106  MFP family transporter  25.89 
 
 		 430 aa  172  9e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0106  MFP family transporter  25.89 
 
 		 430 aa  172  9e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4109  secretion protein HlyD family protein  25.89 
 
 		 430 aa  172  9e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.511066  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2316  secretion protein HlyD family protein  30.09 
 
 		 431 aa  171  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3808  secretion protein HlyD family protein  28.84 
 
 		 419 aa  168  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0541127 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1825  secretion protein HlyD family protein  26.9 
 
 		 457 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0793741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2166  toxin secretion protein, HlyD family  26.9 
 
 		 445 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2178  secretion protein HlyD family protein  27.42 
 
 		 413 aa  160  5e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0050  toxin secretion, membrane fusion protein  26.44 
 
 		 415 aa  159  7e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.516709  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0476  secretion protein HlyD  27.68 
 
 		 413 aa  157  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03509  membrane-fusion protein  28.54 
 
 		 417 aa  150  5e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4509  putative toxin secretion protein  25.24 
 
 		 418 aa  146  7.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6344  secretion protein HlyD family protein  28.54 
 
 		 387 aa  144  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1140  secretion protein, putative  27.49 
 
 		 431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1002  putative secretion protein  27.25 
 
 		 431 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0276  putative secretion protein  27.25 
 
 		 431 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396567  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0289  secretion protein, putative  27.25 
 
 		 431 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1320  putative secretion protein  27.25 
 
 		 431 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600864  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1732  putative secretion protein  27.25 
 
 		 431 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1816  putative secretion protein  27.25 
 
 		 431 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0165273  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04478  putative membrane fusion protein/putative ABC transporter protein required for AvrXa21 activity A (raxA)  29.36 
 
 		 412 aa  108  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3756  HlyD family secretion protein  26.51 
 
 		 435 aa  100  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229051  normal  0.0155871 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3328  multidrug resistance efflux pump-like protein  25.5 
 
 		 431 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4177  multidrug resistance efflux pump-like  25.5 
 
 		 431 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216608  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4189  multidrug resistance efflux pump-like protein  25.5 
 
 		 431 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.378723 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1836  multidrug resistance efflux pump-like  25.68 
 
 		 431 aa  92.8  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0902612  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.42 
 
 		 472 aa  90.9  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2575  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.78 
 
 		 480 aa  87.8  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303774 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6669  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.04 
 
 		 466 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00836718  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6495  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.9 
 
 		 479 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02987  putative secretion protein  27.2 
 
 		 425 aa  84.3  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0731  hypothetical protein  27.15 
 
 		 401 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0794  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.9 
 
 		 440 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00028021  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0983  secretion protein HlyD family protein  23.33 
 
 		 439 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.213399  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.91 
 
 		 465 aa  82  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  25.06 
 
 		 441 aa  82  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.91 
 
 		 465 aa  82  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.82 
 
 		 456 aa  81.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.295152  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0473  secretion protein HylD  26.19 
 
 		 457 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1890  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  23.82 
 
 		 456 aa  81.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3148  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.36 
 
 		 416 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2368  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.93 
 
 		 447 aa  81.3  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4456  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.36 
 
 		 438 aa  80.9  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715639  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3819  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.85 
 
 		 514 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0567  secretion protein HlyD family  24.19 
 
 		 491 aa  78.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  22.95 
 
 		 434 aa  77.8  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3836  secretion protein HlyD family protein  25.11 
 
 		 457 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.929001 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3265  secretion protein HlyD family protein  22.01 
 
 		 549 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2856  secretion protein HlyD family protein  22.01 
 
 		 549 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0279875 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0883  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.62 
 
 		 491 aa  77.4  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4000  secretion protein HlyD family protein  25.51 
 
 		 457 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5422  HlyD family secretion protein  25.87 
 
 		 473 aa  77  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970488  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1439  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.34 
 
 		 488 aa  76.3  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal  0.179501 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0164  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  21.94 
 
 		 487 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.846875  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1567  hemolysin secretion protein D  25 
 
 		 473 aa  74.3  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.496852  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.94 
 
 		 451 aa  74.7  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3455  hypothetical protein  25.97 
 
 		 400 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2884  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.41 
 
 		 479 aa  73.9  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0404561 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1500  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.66 
 
 		 473 aa  73.9  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02828  membrane-fusion protein  32.82 
 
 		 148 aa  72.8  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 432 aa  72.8  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3566  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.42 
 
 		 463 aa  71.6  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3121  secretion protein HlyD family protein  26.69 
 
 		 498 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.36 
 
 		 511 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1969  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.26 
 
 		 468 aa  70.1  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.786777  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3122  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.79 
 
 		 399 aa  69.7  0.00000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5004  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.93 
 
 		 447 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2908  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.72 
 
 		 396 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3697  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.15 
 
 		 481 aa  68.6  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.108936 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3021  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.47 
 
 		 396 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0405011 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2907  type I secretion membrane fusion protein HlyD family  22.36 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.891206  normal  0.048093 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2838  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.36 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2889  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.36 
 
 		 396 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0810996 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0892  acriflavine resistance protein  21.5 
 
 		 488 aa  68.2  0.0000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00239109  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1132  hypothetical protein  25 
 
 		 567 aa  67.8  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.107849  normal  0.642224 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>