202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0731 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0731  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  810    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3455  hypothetical protein  70.65 
 
 		 400 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8164  secretion protein HlyD family protein  26.63 
 
 		 443 aa  102  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4177  multidrug resistance efflux pump-like  26.57 
 
 		 431 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216608  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4189  multidrug resistance efflux pump-like protein  26.57 
 
 		 431 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.378723 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3328  multidrug resistance efflux pump-like protein  26.57 
 
 		 431 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12739  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4509  putative toxin secretion protein  25.99 
 
 		 418 aa  95.1  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03509  membrane-fusion protein  25.41 
 
 		 417 aa  95.1  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1836  multidrug resistance efflux pump-like  26 
 
 		 431 aa  92.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0902612  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0489  colicin V secretion protein  27.49 
 
 		 420 aa  90.1  5e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41045  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0554  colicin V secretion protein  27.49 
 
 		 420 aa  89.7  8e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1816  putative secretion protein  24.86 
 
 		 431 aa  89.7  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0165273  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1002  putative secretion protein  24.86 
 
 		 431 aa  89.7  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0289  secretion protein, putative  24.86 
 
 		 431 aa  89.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0276  putative secretion protein  24.86 
 
 		 431 aa  89.7  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396567  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1732  putative secretion protein  24.86 
 
 		 431 aa  89.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1320  putative secretion protein  24.86 
 
 		 431 aa  89.7  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600864  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1957  secretion protein HlyD family protein  27.34 
 
 		 458 aa  89  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.54503  normal  0.703042 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1140  secretion protein, putative  24.64 
 
 		 431 aa  88.6  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2178  secretion protein HlyD family protein  25.69 
 
 		 413 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2948  secretion protein, putative  27.76 
 
 		 538 aa  87.4  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10350  putative secretion protein  25.8 
 
 		 418 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0947  auxiliary membrane fusion protein family transporter  26.41 
 
 		 418 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01631  membrane-fusion protein  29.71 
 
 		 414 aa  83.2  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.160838  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0044  putative secretion protein  26.5 
 
 		 422 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3794  membrane-fusion protein  30 
 
 		 428 aa  82.4  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108717 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1723  putative secretion protein  26.5 
 
 		 422 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.297844  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3618  putative secretion protein  26.5 
 
 		 422 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3642  putative secretion protein  26.5 
 
 		 422 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3157  putative secretion protein  26.5 
 
 		 422 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.51351  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2820  secretion protein, putative  26.57 
 
 		 603 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.713157  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2316  secretion protein HlyD family protein  31.13 
 
 		 431 aa  80.9  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3061  secretion protein HlyD family protein  25.42 
 
 		 424 aa  80.5  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.404759  normal  0.464933 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3625  secretion protein, putative  26.29 
 
 		 603 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.268433  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0050  toxin secretion, membrane fusion protein  24.45 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.516709  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1144  anibiotic ABC transporter efflux pump  27.32 
 
 		 419 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0783269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4345  secretion protein HlyD family protein  25.85 
 
 		 432 aa  77.4  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0751758  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6344  secretion protein HlyD family protein  24.09 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4439  secretion protein HlyD family protein  26.18 
 
 		 429 aa  76.3  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4072  secretion protein HlyD family protein  26.18 
 
 		 429 aa  76.3  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4553  secretion protein HlyD family protein  26.04 
 
 		 429 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1583  secretion protein HlyD family protein  27.97 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1825  secretion protein HlyD family protein  25.21 
 
 		 457 aa  71.6  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0793741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2166  toxin secretion protein, HlyD family  25.21 
 
 		 445 aa  72  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5422  HlyD family secretion protein  24.66 
 
 		 473 aa  71.2  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970488  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0476  secretion protein HlyD  23.97 
 
 		 413 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2166  secretion protein HlyD family protein  24.85 
 
 		 431 aa  69.7  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.892226  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4873  secretion protein HlyD family protein  26.59 
 
 		 461 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.152026 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4109  secretion protein HlyD family protein  23.6 
 
 		 430 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.511066  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0106  MFP family transporter  23.6 
 
 		 430 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0106  MFP family transporter  23.6 
 
 		 430 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2430  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  30.72 
 
 		 379 aa  65.5  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000533378  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5972  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.2 
 
 		 433 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.802564  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3808  secretion protein HlyD family protein  23.76 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0541127 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  23.26 
 
 		 467 aa  65.1  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4382  secretion protein HlyD  26.34 
 
 		 515 aa  63.2  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3047  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.41 
 
 		 477 aa  62.4  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.666099  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  27.05 
 
 		 508 aa  61.6  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6075  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.73 
 
 		 474 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0374496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0927  secretion protein HlyD  30.46 
 
 		 460 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0303688  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4511  secretion protein HlyD  24.11 
 
 		 449 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal  0.0817386 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6372  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.73 
 
 		 474 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17068  normal  0.732434 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4148  HlyD family secretion protein  23.08 
 
 		 441 aa  60.5  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3566  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.04 
 
 		 463 aa  60.5  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3756  HlyD family secretion protein  25 
 
 		 435 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229051  normal  0.0155871 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6771  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.71 
 
 		 475 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4164  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.68 
 
 		 469 aa  59.3  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.833076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3811  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.87 
 
 		 451 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739118 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0162  HlyD family secretion protein  22.4 
 
 		 481 aa  59.3  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2661  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.68 
 
 		 473 aa  58.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0782  hypothetical protein  24.74 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0411  secretion protein HlyD family protein  26.19 
 
 		 504 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04478  putative membrane fusion protein/putative ABC transporter protein required for AvrXa21 activity A (raxA)  25.12 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2429  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.23 
 
 		 441 aa  57  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1691  hypothetical protein  29.31 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.06847  normal  0.0302884 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3020  HlyD family secretion protein  24.53 
 
 		 179 aa  57  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.133267 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3836  secretion protein HlyD family protein  28.16 
 
 		 457 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.929001 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1419  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.08 
 
 		 446 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1439  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.57 
 
 		 488 aa  55.8  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal  0.179501 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.47 
 
 		 430 aa  55.5  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1515  HlyD family secretion protein  25.16 
 
 		 227 aa  55.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.619726 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1969  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.78 
 
 		 468 aa  55.1  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.786777  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1876  HlyD family secretion protein  23.96 
 
 		 475 aa  55.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6406  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.72 
 
 		 480 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0536  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.53 
 
 		 448 aa  54.7  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.544643  normal  0.538846 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0636  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.08 
 
 		 674 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2399  secretion protein HlyD  29.09 
 
 		 467 aa  54.3  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105564  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.14 
 
 		 465 aa  54.3  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6210  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.13 
 
 		 480 aa  54.3  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.596847  normal  0.481561 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.14 
 
 		 465 aa  54.3  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.88 
 
 		 511 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1052  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.69 
 
 		 449 aa  53.9  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2301  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.34 
 
 		 468 aa  53.9  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2093  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.04 
 
 		 468 aa  53.1  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3265  secretion protein HlyD family protein  25.85 
 
 		 549 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2856  secretion protein HlyD family protein  25.85 
 
 		 549 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0279875 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3075  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.45 
 
 		 473 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.775261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.65 
 
 		 451 aa  52.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00851  transporter component  24.29 
 
 		 391 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0511  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.53 
 
 		 441 aa  52.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>