More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1144 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1144  anibiotic ABC transporter efflux pump  100 
 
 		 419 aa  839    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0783269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0554  colicin V secretion protein  38.85 
 
 		 420 aa  300  4e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0489  colicin V secretion protein  38.85 
 
 		 420 aa  299  5e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41045  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01631  membrane-fusion protein  39.95 
 
 		 414 aa  294  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.160838  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1583  secretion protein HlyD family protein  38.76 
 
 		 414 aa  268  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3642  putative secretion protein  36.41 
 
 		 422 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3157  putative secretion protein  36.41 
 
 		 422 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.51351  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1723  putative secretion protein  36.41 
 
 		 422 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.297844  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0044  putative secretion protein  36.41 
 
 		 422 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3618  putative secretion protein  36.41 
 
 		 422 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0947  auxiliary membrane fusion protein family transporter  37.44 
 
 		 418 aa  266  4e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2820  secretion protein, putative  36.41 
 
 		 603 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.713157  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3625  secretion protein, putative  36.41 
 
 		 603 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.268433  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3794  membrane-fusion protein  36 
 
 		 428 aa  263  3e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108717 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10350  putative secretion protein  36.71 
 
 		 418 aa  262  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2948  secretion protein, putative  36.17 
 
 		 538 aa  261  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8164  secretion protein HlyD family protein  36.32 
 
 		 443 aa  256  5e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2166  toxin secretion protein, HlyD family  35.59 
 
 		 445 aa  253  3e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1825  secretion protein HlyD family protein  35.59 
 
 		 457 aa  253  3e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0793741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1957  secretion protein HlyD family protein  36.21 
 
 		 458 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.54503  normal  0.703042 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2166  secretion protein HlyD family protein  32.06 
 
 		 431 aa  222  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.892226  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4439  secretion protein HlyD family protein  30.33 
 
 		 429 aa  199  7e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4072  secretion protein HlyD family protein  30.33 
 
 		 429 aa  199  7e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0050  toxin secretion, membrane fusion protein  29.62 
 
 		 415 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.516709  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4345  secretion protein HlyD family protein  31.44 
 
 		 432 aa  198  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0751758  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4553  secretion protein HlyD family protein  30.73 
 
 		 429 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4873  secretion protein HlyD family protein  30.58 
 
 		 461 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.152026 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4509  putative toxin secretion protein  30.97 
 
 		 418 aa  192  9e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0476  secretion protein HlyD  31.83 
 
 		 413 aa  192  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2178  secretion protein HlyD family protein  28.99 
 
 		 413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3061  secretion protein HlyD family protein  30.94 
 
 		 424 aa  181  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.404759  normal  0.464933 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3808  secretion protein HlyD family protein  30.68 
 
 		 419 aa  176  9e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0541127 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03509  membrane-fusion protein  27.27 
 
 		 417 aa  172  7.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2316  secretion protein HlyD family protein  31.22 
 
 		 431 aa  166  8e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6344  secretion protein HlyD family protein  31.09 
 
 		 387 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04478  putative membrane fusion protein/putative ABC transporter protein required for AvrXa21 activity A (raxA)  30.83 
 
 		 412 aa  146  5e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0106  MFP family transporter  24.77 
 
 		 430 aa  129  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4109  secretion protein HlyD family protein  24.77 
 
 		 430 aa  129  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.511066  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0106  MFP family transporter  24.77 
 
 		 430 aa  129  8.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3756  HlyD family secretion protein  26.58 
 
 		 435 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229051  normal  0.0155871 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1140  secretion protein, putative  26.43 
 
 		 431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1816  putative secretion protein  26.43 
 
 		 431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0165273  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0276  putative secretion protein  26.43 
 
 		 431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396567  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1002  putative secretion protein  26.43 
 
 		 431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0289  secretion protein, putative  26.43 
 
 		 431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1732  putative secretion protein  26.43 
 
 		 431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1320  putative secretion protein  26.43 
 
 		 431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600864  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1836  multidrug resistance efflux pump-like  26.24 
 
 		 431 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0902612  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4177  multidrug resistance efflux pump-like  25.99 
 
 		 431 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216608  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4189  multidrug resistance efflux pump-like protein  25.99 
 
 		 431 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.378723 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3328  multidrug resistance efflux pump-like protein  25.99 
 
 		 431 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02828  membrane-fusion protein  37.14 
 
 		 148 aa  100  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3121  secretion protein HlyD family protein  26.89 
 
 		 498 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6669  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.42 
 
 		 466 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00836718  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  24.94 
 
 		 441 aa  90.9  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.28 
 
 		 472 aa  89  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  26.19 
 
 		 508 aa  88.2  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.94 
 
 		 451 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3697  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.23 
 
 		 481 aa  85.1  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.108936 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5422  HlyD family secretion protein  31.14 
 
 		 473 aa  84.3  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970488  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1836  secretion protein HlyD family protein  25.05 
 
 		 522 aa  84.3  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.161085  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0883  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.75 
 
 		 491 aa  82.8  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4382  secretion protein HlyD  24.47 
 
 		 515 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.23 
 
 		 465 aa  81.3  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.23 
 
 		 465 aa  81.3  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2759  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.46 
 
 		 421 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246245  normal  0.864922 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3455  hypothetical protein  25.74 
 
 		 400 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0567  secretion protein HlyD family  21.96 
 
 		 491 aa  79  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0731  hypothetical protein  25.62 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1189  secretion protein HlyD  24.52 
 
 		 523 aa  78.2  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.981456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  20.25 
 
 		 434 aa  77.4  0.0000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4164  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.01 
 
 		 469 aa  77.8  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.833076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2137  type I secretion adaptor protein (HlyD family)  23.72 
 
 		 442 aa  77.8  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.83885  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3819  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.62 
 
 		 514 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2526  leukotoxin secretion protein  26.99 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02987  putative secretion protein  27.75 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5004  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.65 
 
 		 447 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01311  hypothetical protein  25 
 
 		 347 aa  76.6  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.420588 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0042  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.9 
 
 		 442 aa  76.3  0.0000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0118  hemolysin secretion protein-like  20.45 
 
 		 417 aa  76.3  0.0000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00640851  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01629  membrane-fusion protein  36.45 
 
 		 139 aa  75.9  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0312207  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.96 
 
 		 447 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540903  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.03 
 
 		 511 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6495  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.77 
 
 		 479 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1658  secretion protein HlyD family protein  26.71 
 
 		 330 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  20.5 
 
 		 457 aa  70.9  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1159  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.45 
 
 		 466 aa  70.9  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.126981 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3047  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.57 
 
 		 477 aa  71.2  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.666099  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2093  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.9 
 
 		 468 aa  70.5  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3566  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.65 
 
 		 463 aa  70.1  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0636  secretion protein HlyD family protein  27.7 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0903899  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2884  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.18 
 
 		 479 aa  69.7  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0404561 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2681  secretion protein HlyD family protein  24.55 
 
 		 509 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0411  secretion protein HlyD family protein  21.27 
 
 		 504 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1419  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  20.85 
 
 		 446 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0426  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  21.54 
 
 		 383 aa  68.9  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3423  secretion protein HlyD family protein  24.32 
 
 		 509 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0761  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.7 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2557  secretion protein HlyD  25.17 
 
 		 498 aa  67  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2368  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.63 
 
 		 447 aa  66.6  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>