More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0636 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0636  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 329 aa  659    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0903899  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1658  secretion protein HlyD family protein  81.16 
 
 		 330 aa  553  1e-156  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1842  secretion protein HlyD family protein  81.4 
 
 		 330 aa  553  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0372122  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1189  secretion protein HlyD  46.96 
 
 		 523 aa  185  8e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.981456  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1836  secretion protein HlyD family protein  46.96 
 
 		 522 aa  181  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.161085  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1225  transporter component  35.42 
 
 		 377 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.107173  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0527  secretion protein HlyD family protein  36.27 
 
 		 576 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0544  secretion protein HlyD family protein  36.27 
 
 		 576 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.212185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3579  secretion protein HlyD family protein  38.77 
 
 		 589 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602098 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  28.4 
 
 		 441 aa  162  9e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21021  leukotoxin secretion protein-like protein  32.49 
 
 		 376 aa  160  4e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.825476 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01311  hypothetical protein  30.64 
 
 		 347 aa  155  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.420588 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1183  leukotoxin secretion protein-like  31.33 
 
 		 317 aa  149  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00851  transporter component  29.4 
 
 		 391 aa  149  8e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0118  hemolysin secretion protein-like  41.34 
 
 		 417 aa  139  4.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00640851  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2526  leukotoxin secretion protein  27.98 
 
 		 417 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0218  leukotoxin secretion protein  27.23 
 
 		 396 aa  117  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14321  hypothetical protein  29.31 
 
 		 387 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.471821  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4600  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.42 
 
 		 410 aa  99.8  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2368  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.52 
 
 		 447 aa  98.2  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6771  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.26 
 
 		 475 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1567  hemolysin secretion protein D  31.9 
 
 		 473 aa  91.7  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.496852  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1500  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.43 
 
 		 473 aa  91.7  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03671  hemolysin secretion-like transmembrane protein  38.19 
 
 		 447 aa  90.9  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.04 
 
 		 511 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2557  secretion protein HlyD  29.75 
 
 		 498 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6669  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.55 
 
 		 466 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00836718  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  28.72 
 
 		 508 aa  87.4  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25 
 
 		 447 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540903  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0761  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.68 
 
 		 389 aa  87.4  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0052  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.18 
 
 		 395 aa  87.4  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0883  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.05 
 
 		 491 aa  86.7  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1598  hlyD family secretion protein  25.54 
 
 		 389 aa  86.7  5e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0549137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3819  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.62 
 
 		 514 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1890  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  27.67 
 
 		 456 aa  85.9  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3320  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.82 
 
 		 389 aa  85.1  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.67 
 
 		 456 aa  85.9  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.295152  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4382  secretion protein HlyD  26.54 
 
 		 515 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5004  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.11 
 
 		 447 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1969  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.51 
 
 		 468 aa  84.3  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.786777  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0991  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.6 
 
 		 389 aa  84  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3075  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.54 
 
 		 473 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.775261  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5105  secretion protein HlyD family protein  29.33 
 
 		 498 aa  83.6  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  27.6 
 
 		 467 aa  82.8  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0623  secretion protein HlyD  24.14 
 
 		 360 aa  82.8  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0184  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.5 
 
 		 458 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326203 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.95 
 
 		 468 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3265  secretion protein HlyD family protein  29.67 
 
 		 549 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2856  secretion protein HlyD family protein  29.67 
 
 		 549 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0279875 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1759  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.13 
 
 		 518 aa  82  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0119826 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0567  secretion protein HlyD family  31.18 
 
 		 491 aa  81.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2575  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.17 
 
 		 480 aa  80.9  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303774 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  30.19 
 
 		 434 aa  80.5  0.00000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5422  HlyD family secretion protein  31.85 
 
 		 473 aa  80.1  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970488  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1509  secretion system protein D  24.29 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3346  secretion protein HlyD family protein  24.09 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  0.0983986 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  27.57 
 
 		 457 aa  79.3  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0136  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.63 
 
 		 455 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4164  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.5 
 
 		 469 aa  78.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.833076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6495  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.26 
 
 		 479 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3121  secretion protein HlyD family protein  23.9 
 
 		 498 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0380  secretion protein HlyD family protein  23.92 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000127057  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3518  secretion protein HlyD family protein  31.2 
 
 		 550 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0983  secretion protein HlyD family protein  31.67 
 
 		 439 aa  77.4  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.213399  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0681  metalloprotease secretion protein  23.5 
 
 		 393 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.123046  normal  0.158856 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03509  membrane-fusion protein  22.94 
 
 		 417 aa  76.3  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  28.63 
 
 		 408 aa  76.3  0.0000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0020  leukotoxin secretion protein D  34.81 
 
 		 479 aa  76.3  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2166  toxin secretion protein, HlyD family  25.21 
 
 		 445 aa  76.3  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24 
 
 		 458 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000605389 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0185  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24 
 
 		 458 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.116801 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1825  secretion protein HlyD family protein  25.21 
 
 		 457 aa  75.9  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0793741  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1474  secretion system protein D  24.07 
 
 		 378 aa  75.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1163  secretion protein HlyD family protein  21.71 
 
 		 379 aa  75.1  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1515  HlyD family secretion protein  29.79 
 
 		 227 aa  75.5  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.619726 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0743  metalloprotease secretion protein  24.22 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.554659  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0476  secretion protein HlyD  31.39 
 
 		 413 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  29.46 
 
 		 408 aa  75.1  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2178  secretion protein HlyD family protein  29.7 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3020  HlyD family secretion protein  28.4 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.133267 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2204  secretion protein HlyD family protein  24.43 
 
 		 392 aa  73.2  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2681  secretion protein HlyD family protein  27.62 
 
 		 509 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.11 
 
 		 465 aa  73.2  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.11 
 
 		 465 aa  73.2  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0276  HlyD family secretion protein  22.75 
 
 		 390 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0227266  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0473  secretion protein HylD  28.98 
 
 		 457 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3423  secretion protein HlyD family protein  26.53 
 
 		 509 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3148  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.22 
 
 		 416 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2759  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32.84 
 
 		 421 aa  72.4  0.000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246245  normal  0.864922 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.67 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0426  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  21.39 
 
 		 383 aa  71.2  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0927  secretion protein HlyD  30.11 
 
 		 460 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0303688  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  26.07 
 
 		 399 aa  71.6  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2276  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.1 
 
 		 389 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1351  chromosome segregation ATPase-like protein  34.65 
 
 		 726 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.100674 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4000  secretion protein HlyD family protein  28.98 
 
 		 457 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4345  secretion protein HlyD family protein  27.63 
 
 		 432 aa  70.9  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0751758  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3697  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.88 
 
 		 481 aa  70.5  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.108936 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2502  secretion protein  31.13 
 
 		 439 aa  70.5  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.867679 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0458  sape  33.56 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00190667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>