296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3346 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3346  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 390 aa  796    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  0.0983986 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4909  secretion protein HlyD family protein  36.72 
 
 		 404 aa  280  3e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.070438 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1094  secretion protein HlyD family protein  38.67 
 
 		 359 aa  246  4e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1163  secretion protein HlyD family protein  36.46 
 
 		 379 aa  236  4e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1658  secretion protein HlyD family protein  26.27 
 
 		 330 aa  92  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1598  hlyD family secretion protein  24.74 
 
 		 389 aa  90.5  4e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0549137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14321  hypothetical protein  29.39 
 
 		 387 aa  88.6  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.471821  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1183  leukotoxin secretion protein-like  29.55 
 
 		 317 aa  82.8  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0118  hemolysin secretion protein-like  26.47 
 
 		 417 aa  82.4  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00640851  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0636  secretion protein HlyD family protein  23.68 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0903899  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5004  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.02 
 
 		 447 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  27.31 
 
 		 457 aa  80.5  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  27.82 
 
 		 508 aa  80.1  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1842  secretion protein HlyD family protein  24.21 
 
 		 330 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0372122  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.14 
 
 		 447 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540903  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0720  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  23.84 
 
 		 380 aa  75.1  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000365102  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2137  type I secretion adaptor protein (HlyD family)  28.72 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.83885  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0042  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.21 
 
 		 442 aa  74.3  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0276  HlyD family secretion protein  24.53 
 
 		 390 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0227266  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  24.78 
 
 		 441 aa  73.9  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2430  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  20.72 
 
 		 379 aa  72  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000533378  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  26.13 
 
 		 467 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3061  secretion protein HlyD family protein  24.19 
 
 		 424 aa  71.6  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.404759  normal  0.464933 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.46 
 
 		 427 aa  72  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862799 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0623  secretion protein HlyD  22.65 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.9 
 
 		 465 aa  70.9  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.9 
 
 		 465 aa  70.9  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0761  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.72 
 
 		 389 aa  69.7  0.00000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6771  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.79 
 
 		 475 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0020  leukotoxin secretion protein D  30.77 
 
 		 479 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1500  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.66 
 
 		 473 aa  68.6  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1836  secretion protein HlyD family protein  28.17 
 
 		 522 aa  68.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.161085  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0426  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  20.78 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3075  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.66 
 
 		 473 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.775261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2368  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.04 
 
 		 447 aa  67.4  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1567  hemolysin secretion protein D  23.81 
 
 		 473 aa  67.4  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.496852  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2526  leukotoxin secretion protein  28.33 
 
 		 417 aa  67  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1189  secretion protein HlyD  28.67 
 
 		 523 aa  67  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.981456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.37 
 
 		 432 aa  67  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  24.9 
 
 		 366 aa  67  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1021  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.81 
 
 		 444 aa  66.6  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00851  transporter component  27.23 
 
 		 391 aa  66.6  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03509  membrane-fusion protein  22.87 
 
 		 417 aa  66.6  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2399  secretion protein HlyD  22.92 
 
 		 467 aa  66.2  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105564  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.49 
 
 		 472 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5105  secretion protein HlyD family protein  24.62 
 
 		 498 aa  65.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0927  secretion protein HlyD  25.35 
 
 		 460 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0303688  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6344  secretion protein HlyD family protein  27.23 
 
 		 387 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.2 
 
 		 474 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5422  HlyD family secretion protein  32.95 
 
 		 473 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970488  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4456  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.71 
 
 		 438 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715639  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4148  HlyD family secretion protein  25.51 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3862  secretion protein-like protein  23.15 
 
 		 456 aa  64.3  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.941945  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0794  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.99 
 
 		 440 aa  64.3  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00028021  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1225  transporter component  26.44 
 
 		 377 aa  63.2  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.107173  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3121  secretion protein HlyD family protein  22.68 
 
 		 498 aa  62.8  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0983  secretion protein HlyD family protein  20.82 
 
 		 439 aa  62.8  0.000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.213399  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0621  secretion protein HlyD  33.06 
 
 		 710 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.749458  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4382  secretion protein HlyD  26.44 
 
 		 515 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0554  colicin V secretion protein  29.44 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2661  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.21 
 
 		 473 aa  62.4  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2986  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.23 
 
 		 443 aa  62.4  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21021  leukotoxin secretion protein-like protein  27.44 
 
 		 376 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.825476 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0489  colicin V secretion protein  29.44 
 
 		 420 aa  62  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41045  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6406  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.03 
 
 		 480 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  21.3 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6210  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.48 
 
 		 480 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.596847  normal  0.481561 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4873  secretion protein HlyD family protein  21.24 
 
 		 461 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.152026 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2823  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.67 
 
 		 443 aa  60.5  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.51941 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3021  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.47 
 
 		 396 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0405011 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2907  type I secretion membrane fusion protein HlyD family  26.47 
 
 		 396 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.891206  normal  0.048093 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0004  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.83 
 
 		 442 aa  60.1  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.197437  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  29.41 
 
 		 368 aa  60.1  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2908  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.47 
 
 		 396 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0476  secretion protein HlyD  26.86 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2889  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.47 
 
 		 396 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0810996 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2838  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.47 
 
 		 396 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2856  secretion protein HlyD family protein  29.51 
 
 		 549 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0279875 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1474  secretion system protein D  24.85 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3265  secretion protein HlyD family protein  29.51 
 
 		 549 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.67 
 
 		 468 aa  59.7  0.00000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0730  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.33 
 
 		 455 aa  59.7  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.187305  normal  0.492023 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4000  secretion protein HlyD family protein  21.58 
 
 		 457 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2429  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.71 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01311  hypothetical protein  25.32 
 
 		 347 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.420588 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0218  leukotoxin secretion protein  22.38 
 
 		 396 aa  59.7  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1759  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.19 
 
 		 518 aa  58.9  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0119826 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0567  secretion protein HlyD family  22.68 
 
 		 491 aa  59.7  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1882  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.39 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3122  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.63 
 
 		 399 aa  59.3  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2544  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.27 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.110449  normal  0.225812 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2078  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.57 
 
 		 458 aa  58.9  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732091 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2412  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.43 
 
 		 399 aa  59.3  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.449428  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0511  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.54 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0340  secretion protein HlyD family protein  23.56 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0473  secretion protein HylD  21.72 
 
 		 457 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1876  HlyD family secretion protein  23.87 
 
 		 475 aa  58.9  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2301  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.61 
 
 		 468 aa  58.2  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1890  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  25.32 
 
 		 456 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1969  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.17 
 
 		 468 aa  58.2  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.786777  normal  0.522263 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>