More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0426 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0426  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  100 
 
 
383 aa  779    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2430  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  36.44 
 
 
379 aa  231  2e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000533378  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0720  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  31.39 
 
 
380 aa  134  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000365102  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1183  leukotoxin secretion protein-like  25.54 
 
 
317 aa  99.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1132  hypothetical protein  23.92 
 
 
567 aa  99.4  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.107849  normal  0.642224 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1083  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  22.69 
 
 
500 aa  96.7  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.102695  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2264  hypothetical protein  26.48 
 
 
627 aa  94  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6495  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.04 
 
 
479 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  19.9 
 
 
430 aa  85.9  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0623  secretion protein HlyD  23.58 
 
 
360 aa  85.1  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1802  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.38 
 
 
452 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.520041 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2759  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.17 
 
 
421 aa  83.2  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246245  normal  0.864922 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.11 
 
 
427 aa  83.6  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0862799 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0730  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.94 
 
 
455 aa  83.6  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.187305  normal  0.492023 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.69 
 
 
474 aa  83.2  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0567  secretion protein HlyD family  20.81 
 
 
491 aa  82  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5105  secretion protein HlyD family protein  30.91 
 
 
498 aa  81.6  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0794  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.68 
 
 
440 aa  80.5  0.00000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00028021  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  20.67 
 
 
441 aa  79.7  0.00000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1212  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.65 
 
 
453 aa  79.3  0.00000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.03 
 
 
439 aa  79.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1474  secretion system protein D  25.99 
 
 
378 aa  78.2  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1509  secretion system protein D  24.2 
 
 
378 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1842  secretion protein HlyD family protein  23.53 
 
 
330 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0372122  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1292  HlyD family secretion protein  23.06 
 
 
461 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.969928  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3047  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  21.1 
 
 
477 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.666099  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2823  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.85 
 
 
443 aa  78.2  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.51941 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0528  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.25 
 
 
390 aa  78.2  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.178429 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3063  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.55 
 
 
453 aa  77.8  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4148  HlyD family secretion protein  21.63 
 
 
441 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  22.31 
 
 
434 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4206  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.5 
 
 
437 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4600  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.46 
 
 
410 aa  75.5  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1759  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.44 
 
 
518 aa  74.3  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0119826 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4141  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.47 
 
 
460 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.504346  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3148  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.15 
 
 
416 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2429  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.72 
 
 
441 aa  73.6  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00851  transporter component  22.13 
 
 
391 aa  73.6  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0991  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.26 
 
 
389 aa  73.6  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03509  membrane-fusion protein  22.7 
 
 
417 aa  73.2  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1460  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  21.95 
 
 
453 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4909  secretion protein HlyD family protein  21.64 
 
 
404 aa  72.8  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.070438 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1976  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.63 
 
 
448 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0585  membrane spanning export protein  22.42 
 
 
391 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.836061  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1658  secretion protein HlyD family protein  22.99 
 
 
330 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0636  secretion protein HlyD family protein  21.39 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0903899  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2557  secretion protein HlyD  25.29 
 
 
498 aa  71.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1419  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.2 
 
 
446 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  23.16 
 
 
344 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0136  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  20.09 
 
 
455 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3122  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.74 
 
 
399 aa  70.5  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0892  acriflavine resistance protein  22.17 
 
 
488 aa  70.5  0.00000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00239109  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3811  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.66 
 
 
451 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739118 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3320  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.58 
 
 
389 aa  70.1  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0743  metalloprotease secretion protein  22.96 
 
 
389 aa  70.1  0.00000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.554659  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  25.9 
 
 
508 aa  70.1  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2526  leukotoxin secretion protein  24.11 
 
 
417 aa  68.9  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0052  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  20.87 
 
 
395 aa  68.9  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  21.73 
 
 
467 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14321  hypothetical protein  22.85 
 
 
387 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.471821  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1163  secretion protein HlyD family protein  21.73 
 
 
379 aa  67.8  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1500  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.75 
 
 
473 aa  67.8  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4383  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.53 
 
 
394 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.915143  normal  0.374406 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1567  hemolysin secretion protein D  22.67 
 
 
473 aa  67.8  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.496852  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3346  secretion protein HlyD family protein  20.78 
 
 
390 aa  67.8  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  0.0983986 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1969  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.58 
 
 
468 aa  67.8  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.786777  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0020  leukotoxin secretion protein D  27.67 
 
 
479 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3836  secretion protein HlyD family protein  22.2 
 
 
457 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.929001 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6075  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.81 
 
 
474 aa  67  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0374496  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  21.71 
 
 
468 aa  67  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01631  membrane-fusion protein  22.06 
 
 
414 aa  67  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.160838  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6372  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.81 
 
 
474 aa  67  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17068  normal  0.732434 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  22.62 
 
 
355 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1101  secretion protein, HlyD family  19.95 
 
 
463 aa  66.6  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1598  hlyD family secretion protein  22.4 
 
 
389 aa  66.6  0.0000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0549137  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.74 
 
 
439 aa  66.6  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0842  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.38 
 
 
394 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0761  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.19 
 
 
389 aa  65.5  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011649  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3697  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.97 
 
 
481 aa  66.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.108936 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3260  HlyD family secretion protein  19.82 
 
 
460 aa  65.9  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2108  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  19.73 
 
 
448 aa  65.9  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2907  type I secretion membrane fusion protein HlyD family  21.39 
 
 
396 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.891206  normal  0.048093 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1189  secretion protein HlyD  26.75 
 
 
523 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.981456  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2195  HlyD family secretion protein  21.97 
 
 
471 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3021  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.67 
 
 
396 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0405011 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3769  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  19.64 
 
 
471 aa  65.5  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2838  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.39 
 
 
396 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1836  secretion protein HlyD family protein  27.85 
 
 
522 aa  65.1  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.161085  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0184  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.38 
 
 
458 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.326203 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2889  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.39 
 
 
396 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0810996 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2908  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.39 
 
 
396 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.9 
 
 
458 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000605389 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0803  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.1 
 
 
394 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  19.63 
 
 
457 aa  64.7  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0218  leukotoxin secretion protein  21.12 
 
 
396 aa  64.7  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2906  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.52 
 
 
442 aa  64.3  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0827  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.81 
 
 
394 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.72853  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0636  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  19.78 
 
 
674 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0164  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  21.82 
 
 
487 aa  63.9  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.846875  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0475  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20 
 
 
460 aa  63.9  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.205035  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>