More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1083 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1083  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  100 
 
 		 500 aa  973    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.102695  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0320  antibiotic ABC transporter  88.61 
 
 		 324 aa  540  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2264  hypothetical protein  29 
 
 		 627 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0168  hypothetical protein  26.04 
 
 		 437 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0328  hypothetical protein  27.42 
 
 		 466 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00489922  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0252  secretion protein HlyD family protein  27.42 
 
 		 466 aa  115  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0254849  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3260  HlyD family secretion protein  23.95 
 
 		 460 aa  111  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0426  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  22.69 
 
 		 383 aa  105  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  19.67 
 
 		 439 aa  100  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  22.56 
 
 		 508 aa  100  7e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0366  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.87 
 
 		 460 aa  99.8  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2399  secretion protein HlyD  22.6 
 
 		 467 aa  98.6  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105564  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3063  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.93 
 
 		 453 aa  98.6  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0311  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23 
 
 		 460 aa  97.4  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4382  secretion protein HlyD  20.7 
 
 		 515 aa  96.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1212  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.49 
 
 		 453 aa  94  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4319  HlyD family secretion protein  22.11 
 
 		 484 aa  93.2  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0656  bacteriocin ABC transporter, putative  29.63 
 
 		 370 aa  93.2  9e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.2243  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4141  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.85 
 
 		 460 aa  92  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.504346  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5105  secretion protein HlyD family protein  23.91 
 
 		 498 aa  92.4  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2429  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.72 
 
 		 441 aa  91.7  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3593  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.61 
 
 		 460 aa  90.5  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0382  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.11 
 
 		 460 aa  90.5  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3644  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.11 
 
 		 460 aa  90.5  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0434  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  22.07 
 
 		 460 aa  90.1  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0162  HlyD family secretion protein  23.96 
 
 		 481 aa  89.7  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2759  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  20.82 
 
 		 421 aa  89.7  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246245  normal  0.864922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0380  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.02 
 
 		 460 aa  89  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0473  secretion protein HylD  18.2 
 
 		 457 aa  87.8  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0301  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  20.97 
 
 		 471 aa  87.4  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4100  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.64 
 
 		 460 aa  87.4  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.64 
 
 		 460 aa  87.4  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3984  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.64 
 
 		 460 aa  87.4  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3907  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.64 
 
 		 460 aa  87.4  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.22 
 
 		 430 aa  87  7e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0475  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.51 
 
 		 460 aa  87  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.205035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4000  secretion protein HlyD family protein  18.41 
 
 		 457 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2093  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.1 
 
 		 468 aa  86.7  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07089  hypothetical protein  23.19 
 
 		 486 aa  84.7  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3265  secretion protein HlyD family protein  22.08 
 
 		 549 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001011  ABC-type protease exporter membrane fusion protein (MFP) family component PrtE/AprE  23.61 
 
 		 463 aa  81.6  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2856  secretion protein HlyD family protein  22.08 
 
 		 549 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0279875 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0164  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.05 
 
 		 487 aa  81.3  0.00000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.846875  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0623  secretion protein HlyD  25.52 
 
 		 360 aa  80.1  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6075  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  19.84 
 
 		 474 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0374496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0411  secretion protein HlyD family protein  21.92 
 
 		 504 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6372  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  19.84 
 
 		 474 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17068  normal  0.732434 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0892  acriflavine resistance protein  23.09 
 
 		 488 aa  78.2  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00239109  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2557  secretion protein HlyD  25.12 
 
 		 498 aa  78.6  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0076  secretion protein HlyD family protein  18.87 
 
 		 506 aa  77.8  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1101  secretion protein, HlyD family  23.6 
 
 		 463 aa  77.8  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.27 
 
 		 451 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1976  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.27 
 
 		 448 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1882  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.24 
 
 		 430 aa  77  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0235  secretion protein HlyD  21.98 
 
 		 500 aa  77  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0275  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  20.3 
 
 		 481 aa  77  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  17.21 
 
 		 511 aa  76.6  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3769  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  21.28 
 
 		 471 aa  76.6  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2437  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.13 
 
 		 428 aa  76.6  0.0000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  20.85 
 
 		 468 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0730  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.72 
 
 		 455 aa  76.6  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.187305  normal  0.492023 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  19.2 
 
 		 465 aa  75.5  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  19.2 
 
 		 465 aa  75.5  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4148  HlyD family secretion protein  23.1 
 
 		 441 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  18.68 
 
 		 472 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1876  HlyD family secretion protein  27.78 
 
 		 475 aa  74.3  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.15 
 
 		 439 aa  74.3  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2059  HlyD family secretion protein  28.28 
 
 		 469 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1583  secretion protein HlyD family protein  25.1 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4337  putative toxin/protease secretion system  21.41 
 
 		 661 aa  73.2  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165043  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1836  secretion protein HlyD family protein  21.47 
 
 		 522 aa  73.2  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.161085  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0246  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  18.8 
 
 		 480 aa  73.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.777594  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0720  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  33.01 
 
 		 380 aa  72.4  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000365102  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2137  type I secretion adaptor protein (HlyD family)  21.09 
 
 		 442 aa  72.4  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.83885  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0621  secretion protein HlyD  24.89 
 
 		 710 aa  72.4  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.749458  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2195  HlyD family secretion protein  27.78 
 
 		 471 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0511  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.52 
 
 		 441 aa  72  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0636  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.21 
 
 		 674 aa  72.4  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1173  hypothetical protein  23.97 
 
 		 442 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5063  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  19.06 
 
 		 458 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0136  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.24 
 
 		 455 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1663  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.73 
 
 		 472 aa  71.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.131459 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1292  HlyD family secretion protein  22.17 
 
 		 461 aa  70.9  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.969928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3518  secretion protein HlyD family protein  21.57 
 
 		 550 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2430  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  28.48 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000533378  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1567  hemolysin secretion protein D  19.88 
 
 		 473 aa  69.7  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.496852  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5422  HlyD family secretion protein  17.06 
 
 		 473 aa  70.1  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970488  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4712  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  17.67 
 
 		 473 aa  69.7  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.0413693 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1159  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.33 
 
 		 466 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.126981 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5972  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  18.31 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.802564  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  19.57 
 
 		 441 aa  68.9  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2661  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.59 
 
 		 473 aa  68.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.2 
 
 		 474 aa  69.3  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3819  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  17.5 
 
 		 514 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01631  membrane-fusion protein  21.58 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.160838  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02273  HlyD family secretion protein  22.38 
 
 		 436 aa  68.2  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1419  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.24 
 
 		 446 aa  68.2  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  26.49 
 
 		 467 aa  67.8  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6406  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  20.24 
 
 		 480 aa  67.8  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2986  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.29 
 
 		 443 aa  67.8  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>