More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4337 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4337  putative toxin/protease secretion system  100 
 
 
661 aa  1339    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165043  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2862  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  49.4 
 
 
455 aa  412  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3383  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  48.73 
 
 
435 aa  416  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2513  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  50.12 
 
 
420 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2542  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  48.56 
 
 
446 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2740  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  47.97 
 
 
448 aa  404  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3318  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  49.75 
 
 
447 aa  405  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2967  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  47.97 
 
 
448 aa  404  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.34356  normal  0.656863 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7140  HlyD family secretion protein  48.14 
 
 
446 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.706887  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2544  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  51.11 
 
 
437 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.110449  normal  0.225812 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3025  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  49.05 
 
 
437 aa  398  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6291  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  48.88 
 
 
442 aa  381  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.702424  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0801  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  46.1 
 
 
440 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1562  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  44.82 
 
 
440 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3225  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  41.5 
 
 
435 aa  320  7e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4391  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  43.78 
 
 
438 aa  313  7.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.687432 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0040  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  39.77 
 
 
492 aa  310  4e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0639189  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02273  HlyD family secretion protein  39.21 
 
 
436 aa  305  2.0000000000000002e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2977  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  40.19 
 
 
435 aa  303  7.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0794  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.3 
 
 
433 aa  303  9e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0245  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  42.48 
 
 
446 aa  300  6e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1563  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  38.26 
 
 
451 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.838754  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16250  Type I secretion membrane fusion protein  38.04 
 
 
441 aa  282  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1665  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  37.87 
 
 
448 aa  280  5e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195288  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0138  type I secretion membrane fusion protein  37.98 
 
 
435 aa  280  9e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1982  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  37.62 
 
 
448 aa  279  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0719  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.88 
 
 
438 aa  277  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1797  HlyD family secretion protein  36.75 
 
 
441 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250049  normal  0.0164192 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0934  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  36.75 
 
 
440 aa  269  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0970473  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1406  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.8 
 
 
441 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.575733  normal  0.479497 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1113  ABC transporter membrane spanning protein (bacteriocin)  35.35 
 
 
462 aa  258  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2478  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  35.61 
 
 
440 aa  258  3e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0434  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  35.56 
 
 
435 aa  257  6e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.31 
 
 
433 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.768701  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0893  RTX secretion protein D  35.31 
 
 
433 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276128  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0458  sape  33.73 
 
 
427 aa  251  3e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00190667  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0114  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.66 
 
 
433 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0685446  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0246  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  35.75 
 
 
480 aa  244  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.777594  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0275  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  35.02 
 
 
481 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2037  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.2 
 
 
477 aa  242  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0271  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  35.02 
 
 
457 aa  241  4e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0649  HlyD family secretion protein  33.18 
 
 
506 aa  240  6.999999999999999e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2949  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  34.05 
 
 
447 aa  240  6.999999999999999e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2600  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.25 
 
 
444 aa  239  9e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3886  putative RTX secretion protein D  34.62 
 
 
447 aa  239  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.652406  normal  0.810853 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0963  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  34.98 
 
 
447 aa  239  1e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1162  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.08 
 
 
460 aa  239  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.793756 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1322  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  35.08 
 
 
458 aa  236  7e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1275  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.89 
 
 
460 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0751929 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4145  alkaline protease secretion protein AprE  32.13 
 
 
432 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8003  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33.09 
 
 
460 aa  232  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.87 
 
 
471 aa  231  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5906  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.84 
 
 
454 aa  231  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418691  hitchhiker  0.00374749 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1706  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  34.43 
 
 
431 aa  230  7e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1724  metalloprotease secretion protein  34.61 
 
 
443 aa  229  9e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20040  metalloprotease secretion protein  34.84 
 
 
443 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0389263  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3973  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.25 
 
 
479 aa  228  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1281  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  33.25 
 
 
454 aa  226  9e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1509  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.92 
 
 
471 aa  225  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48100  alkaline protease secretion protein AprE  30.95 
 
 
432 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322213 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3436  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.21 
 
 
471 aa  221  3.9999999999999997e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360287  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4335  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.64 
 
 
443 aa  220  6e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526899  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1817  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  35.78 
 
 
455 aa  220  7.999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000964329  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2108  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.27 
 
 
448 aa  219  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4712  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.47 
 
 
473 aa  218  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.0413693 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4324  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33.03 
 
 
449 aa  216  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1556  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.75 
 
 
442 aa  216  9e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0155  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.53 
 
 
505 aa  216  9.999999999999999e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.353804  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1408  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.53 
 
 
452 aa  216  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2906  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.99 
 
 
442 aa  214  5.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0970  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.11 
 
 
505 aa  212  1e-53  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.995954  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3834  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32.69 
 
 
439 aa  213  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0519478  normal  0.0754142 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3587  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.34 
 
 
408 aa  213  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50636  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3160  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.34 
 
 
445 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.22456  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1346  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32.85 
 
 
462 aa  209  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2681  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32.63 
 
 
449 aa  208  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293137 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0617  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.04 
 
 
432 aa  208  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290614  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3329  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.71 
 
 
417 aa  207  6e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.40218  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3995  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.56 
 
 
449 aa  207  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0064  putative type I secretion protein, HlyD family  31.7 
 
 
429 aa  207  7e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4813  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.63 
 
 
456 aa  205  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.474577  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0939  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.93 
 
 
494 aa  202  9.999999999999999e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1643  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.02 
 
 
453 aa  197  6e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2559  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.18 
 
 
446 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.188879 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.18 
 
 
446 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.55639 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1597  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.91 
 
 
443 aa  195  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.362914  normal  0.115374 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0584  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.86 
 
 
455 aa  194  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.767498  normal  0.0809109 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3355  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.94 
 
 
446 aa  193  9e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2301  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.26 
 
 
468 aa  192  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1640  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.14 
 
 
445 aa  187  5e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.893315 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1760  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.25 
 
 
453 aa  186  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2093  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.92 
 
 
468 aa  184  6e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.6 
 
 
439 aa  182  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2495  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.1 
 
 
436 aa  181  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.848242  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001279  membrane-fusion protein  32.18 
 
 
446 aa  181  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2059  HlyD family secretion protein  31.72 
 
 
469 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2195  HlyD family secretion protein  31.49 
 
 
471 aa  178  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05157  hypothetical protein  33.87 
 
 
446 aa  177  5e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.69 
 
 
445 aa  175  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1460  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.58 
 
 
453 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>