More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0138 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0138  type I secretion membrane fusion protein  100 
 
 		 435 aa  856    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2478  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  59.31 
 
 		 440 aa  496  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0893  RTX secretion protein D  57.75 
 
 		 433 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276128  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  57.75 
 
 		 433 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.768701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0114  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  59.29 
 
 		 433 aa  478  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0685446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2037  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  50.81 
 
 		 477 aa  438  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0434  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  48.03 
 
 		 435 aa  387  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1113  ABC transporter membrane spanning protein (bacteriocin)  44.78 
 
 		 462 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3383  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.9 
 
 		 435 aa  316  4e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0794  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  41.61 
 
 		 433 aa  307  3e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2513  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.24 
 
 		 420 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4391  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.97 
 
 		 438 aa  301  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.687432 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2544  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  38.82 
 
 		 437 aa  300  4e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.110449  normal  0.225812 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2862  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  40.09 
 
 		 455 aa  297  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0801  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  39.24 
 
 		 440 aa  297  3e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2977  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  39.77 
 
 		 435 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1563  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  40.71 
 
 		 451 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.838754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3225  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  39.53 
 
 		 435 aa  294  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2967  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  39.56 
 
 		 448 aa  291  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.34356  normal  0.656863 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2740  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  39.56 
 
 		 448 aa  291  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2542  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  38.66 
 
 		 446 aa  290  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7140  HlyD family secretion protein  40 
 
 		 446 aa  286  5e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.706887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6291  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.05 
 
 		 442 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.702424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1562  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  38.85 
 
 		 440 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4337  putative toxin/protease secretion system  37.98 
 
 		 661 aa  280  4e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3318  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.52 
 
 		 447 aa  278  9e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3025  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  37.41 
 
 		 437 aa  270  4e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1665  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  39.56 
 
 		 448 aa  270  4e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1982  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  39.56 
 
 		 448 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0040  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  34.91 
 
 		 492 aa  268  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0639189  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3973  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.12 
 
 		 479 aa  257  3e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02273  HlyD family secretion protein  34.77 
 
 		 436 aa  256  4e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0246  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33.41 
 
 		 480 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.777594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0275  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.87 
 
 		 481 aa  242  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0245  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  36.12 
 
 		 446 aa  228  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16250  Type I secretion membrane fusion protein  33.01 
 
 		 441 aa  225  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0617  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.1 
 
 		 432 aa  219  6e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290614  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4813  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.92 
 
 		 456 aa  219  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.474577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0458  sape  30.48 
 
 		 427 aa  218  1e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00190667  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0963  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.6 
 
 		 447 aa  218  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0970  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.43 
 
 		 505 aa  218  2e-55  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.995954  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1509  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.29 
 
 		 471 aa  217  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2949  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.47 
 
 		 447 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2600  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.71 
 
 		 444 aa  213  5.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0155  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.74 
 
 		 505 aa  211  2e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.353804  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1281  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30 
 
 		 454 aa  210  5e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0719  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.59 
 
 		 438 aa  209  6e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3886  putative RTX secretion protein D  31.99 
 
 		 447 aa  208  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.652406  normal  0.810853 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1706  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.17 
 
 		 431 aa  207  3e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4335  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.12 
 
 		 443 aa  207  4e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001279  membrane-fusion protein  29.77 
 
 		 446 aa  206  6e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1797  HlyD family secretion protein  31.1 
 
 		 441 aa  206  9e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250049  normal  0.0164192 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4712  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.37 
 
 		 473 aa  205  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.0413693 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3436  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.58 
 
 		 471 aa  204  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360287  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3834  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  34.04 
 
 		 439 aa  202  9e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0519478  normal  0.0754142 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2108  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  35.03 
 
 		 448 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1275  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.79 
 
 		 460 aa  199  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0751929 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1406  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.9 
 
 		 441 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.575733  normal  0.479497 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0934  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.38 
 
 		 440 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0970473  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_002978  WD0649  HlyD family secretion protein  29.2 
 
 		 506 aa  196  5.000000000000001e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05157  hypothetical protein  29.29 
 
 		 446 aa  195  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1817  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30 
 
 		 455 aa  195  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000964329  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1724  metalloprotease secretion protein  32.45 
 
 		 443 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1556  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.39 
 
 		 442 aa  194  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4324  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.79 
 
 		 449 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2906  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.22 
 
 		 442 aa  194  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5906  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.47 
 
 		 454 aa  193  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418691  hitchhiker  0.00374749 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2559  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.22 
 
 		 446 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.188879 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.22 
 
 		 446 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.55639 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20040  metalloprotease secretion protein  31.96 
 
 		 443 aa  192  9e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0389263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3355  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.24 
 
 		 446 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1322  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.94 
 
 		 458 aa  190  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3160  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.43 
 
 		 445 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.22456  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2681  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32.64 
 
 		 449 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293137 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1640  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.36 
 
 		 445 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.893315 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0939  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.06 
 
 		 494 aa  187  3e-46  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1162  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.71 
 
 		 460 aa  187  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.793756 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3995  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.14 
 
 		 449 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0271  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.18 
 
 		 457 aa  187  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3329  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.63 
 
 		 417 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.40218  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.57 
 
 		 445 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0064  putative type I secretion protein, HlyD family  29.48 
 
 		 429 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8003  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.42 
 
 		 460 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1597  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.68 
 
 		 443 aa  184  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.362914  normal  0.115374 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1346  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.47 
 
 		 462 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4145  alkaline protease secretion protein AprE  30.34 
 
 		 432 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1760  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.51 
 
 		 453 aa  174  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3587  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.83 
 
 		 408 aa  173  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50636  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48100  alkaline protease secretion protein AprE  28.81 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322213 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.72 
 
 		 471 aa  170  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2495  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.11 
 
 		 436 aa  164  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.848242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1408  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.35 
 
 		 452 aa  162  8.000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0584  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.71 
 
 		 455 aa  154  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.767498  normal  0.0809109 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3891  HlyD family hemolysin secretion protein  29.34 
 
 		 442 aa  154  4e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.76201 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4083  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.34 
 
 		 442 aa  153  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1643  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.54 
 
 		 453 aa  152  8.999999999999999e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0133  HlyD family hemolysin secretion protein  29.34 
 
 		 442 aa  152  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2437  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.77 
 
 		 428 aa  150  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1663  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.56 
 
 		 472 aa  146  6e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.131459 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.8 
 
 		 430 aa  145  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>