More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2542 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_2740  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  74.72 
 
 
448 aa  659    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2862  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  77.47 
 
 
455 aa  671    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2542  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  100 
 
 
446 aa  885    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2967  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  74.72 
 
 
448 aa  659    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.34356  normal  0.656863 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3318  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  86.1 
 
 
447 aa  744    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3383  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  62.47 
 
 
435 aa  543  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2513  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  65.85 
 
 
420 aa  537  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2544  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  60.6 
 
 
437 aa  509  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.110449  normal  0.225812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7140  HlyD family secretion protein  60.94 
 
 
446 aa  502  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.706887  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3025  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  57.91 
 
 
437 aa  474  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6291  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  53.77 
 
 
442 aa  426  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.702424  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1562  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  52.53 
 
 
440 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4337  putative toxin/protease secretion system  48.89 
 
 
661 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165043  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0801  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  49.65 
 
 
440 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4391  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  50 
 
 
438 aa  376  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.687432 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3225  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  45.65 
 
 
435 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2977  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  45.31 
 
 
435 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0794  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  44.66 
 
 
433 aa  330  4e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0040  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  42.92 
 
 
492 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0639189  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1665  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  43.07 
 
 
448 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195288  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1982  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  42.82 
 
 
448 aa  306  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1563  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  41.71 
 
 
451 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.838754  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1113  ABC transporter membrane spanning protein (bacteriocin)  39.18 
 
 
462 aa  302  7.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2037  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.46 
 
 
477 aa  300  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16250  Type I secretion membrane fusion protein  41.73 
 
 
441 aa  297  3e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2478  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  40.27 
 
 
440 aa  295  1e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0138  type I secretion membrane fusion protein  38.66 
 
 
435 aa  290  3e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0893  RTX secretion protein D  41.85 
 
 
433 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276128  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  41.85 
 
 
433 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.768701  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0114  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  39.51 
 
 
433 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0685446  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02273  HlyD family secretion protein  36.3 
 
 
436 aa  273  5.000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0245  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  40.14 
 
 
446 aa  271  2e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1797  HlyD family secretion protein  37.76 
 
 
441 aa  262  8e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250049  normal  0.0164192 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0271  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  36.98 
 
 
457 aa  261  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8003  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  36.24 
 
 
460 aa  261  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5906  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.63 
 
 
454 aa  259  8e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418691  hitchhiker  0.00374749 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1406  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  37.76 
 
 
441 aa  259  9e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.575733  normal  0.479497 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3886  putative RTX secretion protein D  38.43 
 
 
447 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.652406  normal  0.810853 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1275  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.53 
 
 
460 aa  256  6e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0751929 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0434  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  36.7 
 
 
435 aa  256  7e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1322  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  35.02 
 
 
458 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1162  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.46 
 
 
460 aa  254  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.793756 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0934  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  37.44 
 
 
440 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0970473  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0719  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.92 
 
 
438 aa  252  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1509  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.63 
 
 
471 aa  246  8e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.99 
 
 
471 aa  244  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1281  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  35.11 
 
 
454 aa  241  2e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0246  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33.73 
 
 
480 aa  237  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.777594  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4712  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.78 
 
 
473 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.0413693 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0617  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.7 
 
 
432 aa  230  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290614  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3973  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.64 
 
 
479 aa  229  6e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0275  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.53 
 
 
481 aa  229  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0970  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.34 
 
 
505 aa  229  9e-59  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.995954  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0155  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.8 
 
 
505 aa  228  1e-58  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.353804  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0649  HlyD family secretion protein  31.55 
 
 
506 aa  225  1e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3436  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.44 
 
 
471 aa  224  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360287  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4813  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.72 
 
 
456 aa  223  4.9999999999999996e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.474577  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1817  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  34.23 
 
 
455 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000964329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20040  metalloprotease secretion protein  37.11 
 
 
443 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0389263  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1724  metalloprotease secretion protein  37.35 
 
 
443 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2949  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.53 
 
 
447 aa  218  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48100  alkaline protease secretion protein AprE  33.98 
 
 
432 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322213 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2108  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  34.52 
 
 
448 aa  216  7e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0458  sape  33.18 
 
 
427 aa  214  2.9999999999999995e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00190667  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1706  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.95 
 
 
431 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0963  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.5 
 
 
447 aa  213  5.999999999999999e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4145  alkaline protease secretion protein AprE  33.49 
 
 
432 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0584  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.9 
 
 
455 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.767498  normal  0.0809109 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2495  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.88 
 
 
436 aa  206  5e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.848242  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1408  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33.41 
 
 
452 aa  206  9e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2600  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.56 
 
 
444 aa  205  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3834  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.71 
 
 
439 aa  204  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0519478  normal  0.0754142 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2559  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.43 
 
 
446 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.188879 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.43 
 
 
446 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.55639 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0939  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.67 
 
 
494 aa  202  9.999999999999999e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1556  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.63 
 
 
442 aa  201  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1346  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.11 
 
 
462 aa  199  9e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3355  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.32 
 
 
446 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1640  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32.64 
 
 
445 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.893315 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2906  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.16 
 
 
442 aa  193  6e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0064  putative type I secretion protein, HlyD family  28.88 
 
 
429 aa  193  6e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4324  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.8 
 
 
449 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3587  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.42 
 
 
408 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50636  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1760  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32 
 
 
453 aa  190  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3995  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.11 
 
 
449 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1597  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.71 
 
 
443 aa  182  8.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.362914  normal  0.115374 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4335  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.64 
 
 
443 aa  182  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526899  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2681  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.57 
 
 
449 aa  179  7e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293137 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3160  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.44 
 
 
445 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.22456  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3329  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.28 
 
 
417 aa  177  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.40218  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1643  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.22 
 
 
453 aa  175  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.74 
 
 
445 aa  172  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001279  membrane-fusion protein  29.93 
 
 
446 aa  170  6e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2204  secretion protein HlyD family protein  31.67 
 
 
392 aa  166  5e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0164  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.21 
 
 
487 aa  162  8.000000000000001e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.846875  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05157  hypothetical protein  28.77 
 
 
446 aa  162  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0892  acriflavine resistance protein  28.21 
 
 
488 aa  161  2e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00239109  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3891  HlyD family hemolysin secretion protein  30.7 
 
 
442 aa  161  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.76201 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4083  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.7 
 
 
442 aa  160  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2093  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.74 
 
 
468 aa  160  5e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>