More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_48100 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4145  alkaline protease secretion protein AprE  93.52 
 
 
432 aa  811    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48100  alkaline protease secretion protein AprE  100 
 
 
432 aa  865    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322213 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1724  metalloprotease secretion protein  51.99 
 
 
443 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20040  metalloprotease secretion protein  52.46 
 
 
443 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0389263  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2681  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  49.65 
 
 
449 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293137 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1281  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  46.23 
 
 
454 aa  397  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2906  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  49.19 
 
 
442 aa  397  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3160  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  50.47 
 
 
445 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.22456  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1556  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  48.96 
 
 
442 aa  395  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2108  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  47.53 
 
 
448 aa  391  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1597  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  44.96 
 
 
443 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.362914  normal  0.115374 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3329  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  50 
 
 
417 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.40218  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1408  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  45.99 
 
 
452 aa  355  5.999999999999999e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2559  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  42.06 
 
 
446 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.188879 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  42.06 
 
 
446 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.55639 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3355  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  41.12 
 
 
446 aa  322  6e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4083  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  41.43 
 
 
442 aa  303  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0133  HlyD family hemolysin secretion protein  41.19 
 
 
442 aa  302  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3891  HlyD family hemolysin secretion protein  41.19 
 
 
442 aa  301  2e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.76201 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4927  secretion protein HlyD  38.88 
 
 
349 aa  290  4e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0040  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  36.19 
 
 
492 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0639189  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0584  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  39.8 
 
 
455 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.767498  normal  0.0809109 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1346  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  36.3 
 
 
462 aa  271  1e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1643  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.31 
 
 
453 aa  263  4e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16250  Type I secretion membrane fusion protein  36.65 
 
 
441 aa  249  5e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0934  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  34.54 
 
 
440 aa  247  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0970473  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1406  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.15 
 
 
441 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.575733  normal  0.479497 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0719  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.43 
 
 
438 aa  238  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5906  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.87 
 
 
454 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418691  hitchhiker  0.00374749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1322  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  34.95 
 
 
458 aa  236  7e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3886  putative RTX secretion protein D  33.65 
 
 
447 aa  236  8e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.652406  normal  0.810853 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1797  HlyD family secretion protein  34.22 
 
 
441 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250049  normal  0.0164192 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2862  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  35.06 
 
 
455 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0271  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  35.19 
 
 
457 aa  234  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8003  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  34.22 
 
 
460 aa  234  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1275  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.74 
 
 
460 aa  234  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0751929 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1162  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.95 
 
 
460 aa  234  3e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.793756 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2544  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33.74 
 
 
437 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.110449  normal  0.225812 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2513  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.56 
 
 
420 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2967  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  35.31 
 
 
448 aa  232  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.34356  normal  0.656863 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2740  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.31 
 
 
448 aa  232  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3383  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.71 
 
 
435 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3025  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  34.57 
 
 
437 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1747  secretion protein HlyD family protein  35.03 
 
 
393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.570517  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1562  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33.81 
 
 
440 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4337  putative toxin/protease secretion system  30.35 
 
 
661 aa  220  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165043  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6291  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.49 
 
 
442 aa  218  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.702424  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0801  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32.37 
 
 
440 aa  217  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2542  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33.98 
 
 
446 aa  216  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02273  HlyD family secretion protein  31.78 
 
 
436 aa  216  5e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1817  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32.24 
 
 
455 aa  211  3e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000964329  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0380  secretion protein HlyD family protein  33.72 
 
 
393 aa  211  3e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000127057  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0743  metalloprotease secretion protein  33.95 
 
 
389 aa  210  5e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.554659  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3318  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.66 
 
 
447 aa  209  6e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3834  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  33.41 
 
 
439 aa  209  6e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0519478  normal  0.0754142 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0155  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.3 
 
 
505 aa  208  2e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.353804  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0970  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.67 
 
 
505 aa  208  2e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.995954  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4391  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.94 
 
 
438 aa  204  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.687432 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3225  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.47 
 
 
435 aa  202  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1509  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.69 
 
 
471 aa  200  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0458  sape  28.14 
 
 
427 aa  201  3e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00190667  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7140  HlyD family secretion protein  30.98 
 
 
446 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.706887  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2600  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.07 
 
 
444 aa  196  5.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2204  secretion protein HlyD family protein  33.73 
 
 
392 aa  196  8.000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0617  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.68 
 
 
432 aa  196  8.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290614  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.73 
 
 
445 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0246  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.14 
 
 
480 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.777594  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2977  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.38 
 
 
435 aa  193  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3436  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.61 
 
 
471 aa  193  6e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360287  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4712  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.71 
 
 
473 aa  192  8e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.0413693 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.57 
 
 
471 aa  192  9e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3973  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.93 
 
 
479 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0275  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.68 
 
 
481 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3587  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.53 
 
 
408 aa  189  9e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50636  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0681  metalloprotease secretion protein  33.25 
 
 
393 aa  189  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.123046  normal  0.158856 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2037  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.03 
 
 
477 aa  187  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.79 
 
 
433 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.768701  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0893  RTX secretion protein D  29.79 
 
 
433 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276128  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0649  HlyD family secretion protein  26.74 
 
 
506 aa  186  7e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4813  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.88 
 
 
456 aa  185  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.474577  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2495  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.71 
 
 
436 aa  182  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.848242  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4324  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.91 
 
 
449 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1113  ABC transporter membrane spanning protein (bacteriocin)  29.86 
 
 
462 aa  179  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1760  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.92 
 
 
453 aa  177  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1706  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.44 
 
 
431 aa  177  4e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3995  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.38 
 
 
449 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0114  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.12 
 
 
433 aa  173  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0685446  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2478  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.23 
 
 
440 aa  173  5.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0138  type I secretion membrane fusion protein  28.81 
 
 
435 aa  171  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05157  hypothetical protein  28.23 
 
 
446 aa  171  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0434  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.07 
 
 
435 aa  169  6e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1882  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.31 
 
 
430 aa  169  7e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2949  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.64 
 
 
447 aa  169  8e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0963  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.8 
 
 
447 aa  169  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0064  putative type I secretion protein, HlyD family  26.75 
 
 
429 aa  167  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0939  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.82 
 
 
494 aa  167  5e-40  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001279  membrane-fusion protein  27.58 
 
 
446 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1640  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.39 
 
 
445 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.893315 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0794  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.54 
 
 
433 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4141  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.67 
 
 
460 aa  163  6e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.504346  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>