More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2552 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0114  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  83.37 
 
 
433 aa  699    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0685446  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0893  RTX secretion protein D  100 
 
 
433 aa  858    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276128  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  100 
 
 
433 aa  858    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.768701  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0138  type I secretion membrane fusion protein  57.75 
 
 
435 aa  478  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2478  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  58.88 
 
 
440 aa  478  1e-134  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2037  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  56.81 
 
 
477 aa  476  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1113  ABC transporter membrane spanning protein (bacteriocin)  45.77 
 
 
462 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0434  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  48.01 
 
 
435 aa  365  1e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1562  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  41.87 
 
 
440 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0801  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  40.84 
 
 
440 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3383  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  39.76 
 
 
435 aa  290  4e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2542  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  41.85 
 
 
446 aa  288  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2544  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  38.99 
 
 
437 aa  287  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.110449  normal  0.225812 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2862  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  40.42 
 
 
455 aa  285  8e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7140  HlyD family secretion protein  41.09 
 
 
446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.706887  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2740  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.65 
 
 
448 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2967  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  40.65 
 
 
448 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.34356  normal  0.656863 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2513  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  39.76 
 
 
420 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3318  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  41.83 
 
 
447 aa  280  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4391  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  39.49 
 
 
438 aa  271  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.687432 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0794  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.48 
 
 
433 aa  266  5e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3025  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  36.53 
 
 
437 aa  260  4e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6291  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.79 
 
 
442 aa  259  7e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.702424  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02273  HlyD family secretion protein  33.95 
 
 
436 aa  258  1e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2977  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  36.32 
 
 
435 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4337  putative toxin/protease secretion system  35.75 
 
 
661 aa  253  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165043  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3225  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  36.08 
 
 
435 aa  254  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1563  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  37.59 
 
 
451 aa  249  7e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.838754  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3973  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.4 
 
 
479 aa  249  7e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0040  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  35.38 
 
 
492 aa  248  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0639189  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1982  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  38.69 
 
 
448 aa  246  6e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1665  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.46 
 
 
448 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195288  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0719  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.35 
 
 
438 aa  241  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0246  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  34.65 
 
 
480 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.777594  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1281  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32.86 
 
 
454 aa  232  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16250  Type I secretion membrane fusion protein  32.94 
 
 
441 aa  231  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0275  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33.49 
 
 
481 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0617  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.6 
 
 
432 aa  225  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290614  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0934  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32.24 
 
 
440 aa  223  4e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0970473  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0458  sape  33.17 
 
 
427 aa  220  3e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00190667  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3886  putative RTX secretion protein D  33.71 
 
 
447 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.652406  normal  0.810853 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0245  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  34.1 
 
 
446 aa  218  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0155  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.22 
 
 
505 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.353804  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0970  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.54 
 
 
505 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.995954  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1797  HlyD family secretion protein  30.84 
 
 
441 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250049  normal  0.0164192 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1509  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.19 
 
 
471 aa  209  8e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5906  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.69 
 
 
454 aa  206  6e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418691  hitchhiker  0.00374749 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2559  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.7 
 
 
446 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.188879 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1817  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32.95 
 
 
455 aa  206  7e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000964329  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2949  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.65 
 
 
447 aa  206  7e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.7 
 
 
446 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.55639 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05157  hypothetical protein  31.32 
 
 
446 aa  205  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1724  metalloprotease secretion protein  34.93 
 
 
443 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1640  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  33.71 
 
 
445 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.893315 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3355  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.47 
 
 
446 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1322  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.77 
 
 
458 aa  203  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2108  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.95 
 
 
448 aa  203  6e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0963  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.56 
 
 
447 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20040  metalloprotease secretion protein  34.45 
 
 
443 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0389263  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1406  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.91 
 
 
441 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.575733  normal  0.479497 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3436  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30 
 
 
471 aa  199  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360287  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8003  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.12 
 
 
460 aa  199  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0271  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.54 
 
 
457 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3587  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.84 
 
 
408 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50636  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1706  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.52 
 
 
431 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1162  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.37 
 
 
460 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.793756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1346  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.04 
 
 
462 aa  195  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1275  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.12 
 
 
460 aa  195  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0751929 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2681  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32 
 
 
449 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293137 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4813  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.02 
 
 
456 aa  194  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.474577  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0939  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.73 
 
 
494 aa  192  8e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001279  membrane-fusion protein  30.48 
 
 
446 aa  192  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2906  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.16 
 
 
442 aa  192  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1556  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.32 
 
 
442 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2600  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.73 
 
 
444 aa  191  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.31 
 
 
471 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4335  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.57 
 
 
443 aa  190  5.999999999999999e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526899  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4712  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.79 
 
 
473 aa  189  8e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.0413693 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3160  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  33.1 
 
 
445 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.22456  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48100  alkaline protease secretion protein AprE  29.79 
 
 
432 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322213 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3329  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.1 
 
 
417 aa  186  9e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.40218  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0649  HlyD family secretion protein  27.54 
 
 
506 aa  185  1.0000000000000001e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1408  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31 
 
 
452 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.94 
 
 
445 aa  181  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0584  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.45 
 
 
455 aa  180  4.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.767498  normal  0.0809109 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4324  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.64 
 
 
449 aa  179  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1760  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.39 
 
 
453 aa  178  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3995  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.74 
 
 
449 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4145  alkaline protease secretion protein AprE  28.88 
 
 
432 aa  177  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3891  HlyD family hemolysin secretion protein  29.7 
 
 
442 aa  176  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.76201 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4083  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.47 
 
 
442 aa  173  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3834  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.37 
 
 
439 aa  172  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0519478  normal  0.0754142 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1597  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.54 
 
 
443 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.362914  normal  0.115374 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0133  HlyD family hemolysin secretion protein  29.23 
 
 
442 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1643  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.79 
 
 
453 aa  165  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0064  putative type I secretion protein, HlyD family  26.4 
 
 
429 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4927  secretion protein HlyD  30.16 
 
 
349 aa  160  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0743  metalloprotease secretion protein  29.6 
 
 
389 aa  159  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.554659  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1747  secretion protein HlyD family protein  30.02 
 
 
393 aa  157  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.570517  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2495  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.73 
 
 
436 aa  144  4e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.848242  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>