More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6291 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6291  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  100 
 
 
442 aa  880    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.702424  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3383  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  57.48 
 
 
435 aa  483  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2513  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  57.28 
 
 
420 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2544  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  56.64 
 
 
437 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.110449  normal  0.225812 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2967  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  51.33 
 
 
448 aa  449  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.34356  normal  0.656863 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2740  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  51.33 
 
 
448 aa  449  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2862  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  52.82 
 
 
455 aa  449  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3318  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  53.05 
 
 
447 aa  441  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2542  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  51.01 
 
 
446 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7140  HlyD family secretion protein  53.42 
 
 
446 aa  431  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.706887  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3025  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  53.61 
 
 
437 aa  420  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0801  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  50.12 
 
 
440 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1562  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  48.2 
 
 
440 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4337  putative toxin/protease secretion system  48.05 
 
 
661 aa  386  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165043  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3225  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  46.15 
 
 
435 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2977  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  45.69 
 
 
435 aa  359  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4391  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  47.13 
 
 
438 aa  356  3.9999999999999996e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.687432 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0794  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  42.93 
 
 
433 aa  315  9e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0138  type I secretion membrane fusion protein  38.99 
 
 
435 aa  298  2e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1563  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  38.9 
 
 
451 aa  296  6e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.838754  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1982  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  41.19 
 
 
448 aa  291  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1665  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  41.19 
 
 
448 aa  291  1e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195288  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2478  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  38.72 
 
 
440 aa  291  1e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0040  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  39.52 
 
 
492 aa  285  8e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0639189  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0245  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  39.91 
 
 
446 aa  283  4.0000000000000003e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0114  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  39.17 
 
 
433 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0685446  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02273  HlyD family secretion protein  35.25 
 
 
436 aa  275  9e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0893  RTX secretion protein D  37.95 
 
 
433 aa  273  6e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276128  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  37.95 
 
 
433 aa  273  6e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.768701  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1797  HlyD family secretion protein  38.8 
 
 
441 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250049  normal  0.0164192 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16250  Type I secretion membrane fusion protein  37.59 
 
 
441 aa  270  4e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1406  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  37.59 
 
 
441 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.575733  normal  0.479497 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1113  ABC transporter membrane spanning protein (bacteriocin)  34.12 
 
 
462 aa  263  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0934  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  38.63 
 
 
440 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0970473  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0434  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  37.38 
 
 
435 aa  257  3e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2037  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.32 
 
 
477 aa  255  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3973  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.85 
 
 
479 aa  246  8e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0271  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  35.45 
 
 
457 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0246  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  34.38 
 
 
480 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.777594  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1322  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33.87 
 
 
458 aa  233  5e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0275  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33.66 
 
 
481 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3436  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.87 
 
 
471 aa  231  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360287  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1162  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.64 
 
 
460 aa  231  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.793756 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5906  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.61 
 
 
454 aa  231  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418691  hitchhiker  0.00374749 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0719  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.57 
 
 
438 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4145  alkaline protease secretion protein AprE  32.85 
 
 
432 aa  231  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8003  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.88 
 
 
460 aa  229  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2949  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32.02 
 
 
447 aa  227  3e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48100  alkaline protease secretion protein AprE  32.37 
 
 
432 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322213 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1275  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.12 
 
 
460 aa  226  7e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0751929 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2600  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.66 
 
 
444 aa  225  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4712  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.39 
 
 
473 aa  224  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.0413693 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2108  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.79 
 
 
448 aa  223  4e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1509  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.32 
 
 
471 aa  223  4.9999999999999996e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0963  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  33.02 
 
 
447 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1281  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.84 
 
 
454 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0617  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.45 
 
 
432 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290614  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0458  sape  32.13 
 
 
427 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00190667  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3886  putative RTX secretion protein D  34.12 
 
 
447 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.652406  normal  0.810853 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1346  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.83 
 
 
462 aa  216  8e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1556  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.54 
 
 
442 aa  215  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0064  putative type I secretion protein, HlyD family  32.88 
 
 
429 aa  213  5.999999999999999e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1724  metalloprotease secretion protein  32.93 
 
 
443 aa  210  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20040  metalloprotease secretion protein  32.69 
 
 
443 aa  210  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0389263  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1817  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  33.97 
 
 
455 aa  208  1e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000964329  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3355  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.74 
 
 
446 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0970  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.63 
 
 
505 aa  207  3e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.995954  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2559  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.74 
 
 
446 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.188879 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.74 
 
 
446 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.55639 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2906  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.77 
 
 
442 aa  206  5e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1706  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.31 
 
 
431 aa  204  2e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0155  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.33 
 
 
505 aa  202  9.999999999999999e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.353804  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1408  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33.25 
 
 
452 aa  200  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0649  HlyD family secretion protein  29.63 
 
 
506 aa  200  5e-50  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4813  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.25 
 
 
456 aa  199  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.474577  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1640  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.73 
 
 
445 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.893315 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4335  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.11 
 
 
443 aa  196  5.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526899  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3160  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.28 
 
 
445 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.22456  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.26 
 
 
471 aa  195  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1597  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.72 
 
 
443 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.362914  normal  0.115374 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4324  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.73 
 
 
449 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3329  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.2 
 
 
417 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.40218  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0584  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.12 
 
 
455 aa  189  7e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.767498  normal  0.0809109 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3995  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.05 
 
 
449 aa  189  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.82 
 
 
445 aa  185  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1643  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.78 
 
 
453 aa  183  6e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2681  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.01 
 
 
449 aa  179  8e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293137 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1760  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.87 
 
 
453 aa  177  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3587  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.55 
 
 
408 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50636  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1976  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.5 
 
 
448 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0892  acriflavine resistance protein  30.41 
 
 
488 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00239109  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0939  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.45 
 
 
494 aa  174  2.9999999999999996e-42  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001279  membrane-fusion protein  28.77 
 
 
446 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2093  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.19 
 
 
468 aa  174  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05157  hypothetical protein  30.5 
 
 
446 aa  172  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1159  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.98 
 
 
466 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.126981 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3834  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.52 
 
 
439 aa  171  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0519478  normal  0.0754142 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0164  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.17 
 
 
487 aa  169  7e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.846875  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4083  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.59 
 
 
442 aa  169  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3201  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.1 
 
 
471 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.195077  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>