More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_16250 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_16250  Type I secretion membrane fusion protein  100 
 
 
441 aa  887    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1797  HlyD family secretion protein  66.74 
 
 
441 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250049  normal  0.0164192 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0934  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  64.87 
 
 
440 aa  569  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0970473  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1406  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  65.81 
 
 
441 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.575733  normal  0.479497 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0719  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  55.4 
 
 
438 aa  473  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0040  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  43.97 
 
 
492 aa  350  3e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0639189  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2544  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  41.77 
 
 
437 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.110449  normal  0.225812 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0458  sape  38.59 
 
 
427 aa  309  5e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00190667  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1817  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  39.5 
 
 
455 aa  308  8e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000964329  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1706  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  39.63 
 
 
431 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3318  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  42.93 
 
 
447 aa  298  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2542  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  41.73 
 
 
446 aa  297  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2862  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  41.04 
 
 
455 aa  295  1e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02273  HlyD family secretion protein  35.66 
 
 
436 aa  290  3e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2967  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  40.8 
 
 
448 aa  289  6e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.34356  normal  0.656863 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2740  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.8 
 
 
448 aa  289  6e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2513  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  41.03 
 
 
420 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7140  HlyD family secretion protein  39.45 
 
 
446 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.706887  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3383  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.64 
 
 
435 aa  281  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3025  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  39.86 
 
 
437 aa  280  3e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4337  putative toxin/protease secretion system  38.77 
 
 
661 aa  278  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165043  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1562  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  39.04 
 
 
440 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1281  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  37.08 
 
 
454 aa  270  5e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2559  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  37.19 
 
 
446 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.188879 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  37.19 
 
 
446 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.55639 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0801  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  37.83 
 
 
440 aa  263  6e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6291  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.23 
 
 
442 aa  263  6.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.702424  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0970  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.95 
 
 
505 aa  262  8.999999999999999e-69  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.995954  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3355  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.7 
 
 
446 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0584  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.05 
 
 
455 aa  262  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.767498  normal  0.0809109 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1643  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.05 
 
 
453 aa  261  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3886  putative RTX secretion protein D  35.78 
 
 
447 aa  259  7e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.652406  normal  0.810853 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1346  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  36.85 
 
 
462 aa  258  1e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4145  alkaline protease secretion protein AprE  36.19 
 
 
432 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0246  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  34.93 
 
 
480 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.777594  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0794  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.39 
 
 
433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5906  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  37.26 
 
 
454 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418691  hitchhiker  0.00374749 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0155  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32.25 
 
 
505 aa  251  1e-65  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.353804  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20040  metalloprotease secretion protein  36.69 
 
 
443 aa  250  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0389263  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3160  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  34.51 
 
 
445 aa  249  5e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.22456  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48100  alkaline protease secretion protein AprE  36.65 
 
 
432 aa  249  5e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322213 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1408  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  35.03 
 
 
452 aa  249  7e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1563  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  36.41 
 
 
451 aa  249  8e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.838754  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0275  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  34.47 
 
 
481 aa  249  9e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2906  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  34.91 
 
 
442 aa  249  9e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2681  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  34.93 
 
 
449 aa  248  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293137 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3973  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.83 
 
 
479 aa  248  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1556  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  34.43 
 
 
442 aa  248  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1724  metalloprotease secretion protein  36.69 
 
 
443 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2977  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  36.49 
 
 
435 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4813  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.85 
 
 
456 aa  246  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.474577  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1597  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.5 
 
 
443 aa  246  4.9999999999999997e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.362914  normal  0.115374 
 
 
-
 
NC_002978  WD0649  HlyD family secretion protein  31.65 
 
 
506 aa  245  9.999999999999999e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3329  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.01 
 
 
417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.40218  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3225  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  37.11 
 
 
435 aa  244  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0617  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  37.8 
 
 
432 aa  244  3e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290614  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1275  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.25 
 
 
460 aa  243  5e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0751929 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3834  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  36.1 
 
 
439 aa  241  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0519478  normal  0.0754142 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4391  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.77 
 
 
438 aa  241  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.687432 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0271  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  36.36 
 
 
457 aa  241  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1162  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.36 
 
 
460 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.793756 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1322  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  35.95 
 
 
458 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2108  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33.73 
 
 
448 aa  239  6.999999999999999e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0114  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.61 
 
 
433 aa  239  8e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0685446  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8003  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  35.14 
 
 
460 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1509  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  37.76 
 
 
471 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3587  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.15 
 
 
408 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50636  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2600  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.46 
 
 
444 aa  233  5e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1760  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.81 
 
 
453 aa  232  9e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2478  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  34.98 
 
 
440 aa  232  9e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0893  RTX secretion protein D  32.94 
 
 
433 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276128  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.94 
 
 
433 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.768701  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4083  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.95 
 
 
442 aa  229  8e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0939  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.3 
 
 
494 aa  229  1e-58  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3436  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.29 
 
 
471 aa  228  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360287  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0133  HlyD family hemolysin secretion protein  32.95 
 
 
442 aa  227  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0963  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  33.56 
 
 
447 aa  226  8e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4324  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.89 
 
 
449 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3891  HlyD family hemolysin secretion protein  32.73 
 
 
442 aa  225  1e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.76201 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0138  type I secretion membrane fusion protein  33.01 
 
 
435 aa  225  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2949  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  33.04 
 
 
447 aa  224  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2037  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.9 
 
 
477 aa  224  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4712  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.48 
 
 
473 aa  220  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.0413693 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3995  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.78 
 
 
449 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1113  ABC transporter membrane spanning protein (bacteriocin)  30.9 
 
 
462 aa  219  7e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2204  secretion protein HlyD family protein  34.43 
 
 
392 aa  218  2e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1640  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  34.12 
 
 
445 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.893315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1665  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.25 
 
 
448 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195288  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1982  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33.25 
 
 
448 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0743  metalloprotease secretion protein  34.52 
 
 
389 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.554659  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33.5 
 
 
445 aa  213  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001279  membrane-fusion protein  33.33 
 
 
446 aa  210  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0434  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  34.96 
 
 
435 aa  209  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4335  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.72 
 
 
443 aa  205  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526899  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0064  putative type I secretion protein, HlyD family  31.26 
 
 
429 aa  203  4e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05157  hypothetical protein  31.18 
 
 
446 aa  199  6e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0380  secretion protein HlyD family protein  32.55 
 
 
393 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000127057  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.38 
 
 
471 aa  197  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0245  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.74 
 
 
446 aa  197  4.0000000000000005e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1747  secretion protein HlyD family protein  33.02 
 
 
393 aa  192  7e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.570517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>