More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2559 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2559  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  100 
 
 		 446 aa  903    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.188879 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  99.78 
 
 		 446 aa  903    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.55639 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3355  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  96.64 
 
 		 446 aa  879    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1281  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  46.39 
 
 		 454 aa  408  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48100  alkaline protease secretion protein AprE  42.06 
 
 		 432 aa  330  4e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322213 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4145  alkaline protease secretion protein AprE  42.48 
 
 		 432 aa  323  4e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20040  metalloprotease secretion protein  42.19 
 
 		 443 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0389263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2108  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  40.49 
 
 		 448 aa  320  3e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1724  metalloprotease secretion protein  41.59 
 
 		 443 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1597  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  41.1 
 
 		 443 aa  314  1.9999999999999998e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.362914  normal  0.115374 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0584  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  41.55 
 
 		 455 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.767498  normal  0.0809109 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1408  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  40.38 
 
 		 452 aa  311  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1643  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  41.78 
 
 		 453 aa  311  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2906  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  39.91 
 
 		 442 aa  305  9.000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1556  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  39.91 
 
 		 442 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3160  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  38.21 
 
 		 445 aa  294  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.22456  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3329  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.89 
 
 		 417 aa  292  9e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.40218  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2681  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  38.03 
 
 		 449 aa  291  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293137 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1346  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  36.61 
 
 		 462 aa  281  2e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3891  HlyD family hemolysin secretion protein  38.05 
 
 		 442 aa  281  2e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.76201 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4083  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.28 
 
 		 442 aa  280  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0133  HlyD family hemolysin secretion protein  38.05 
 
 		 442 aa  279  6e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0040  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  35.66 
 
 		 492 aa  277  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0639189  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16250  Type I secretion membrane fusion protein  37.19 
 
 		 441 aa  267  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0719  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.86 
 
 		 438 aa  260  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0743  metalloprotease secretion protein  35.5 
 
 		 389 aa  256  8e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.554659  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1747  secretion protein HlyD family protein  35.5 
 
 		 393 aa  254  3e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.570517  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1797  HlyD family secretion protein  35.78 
 
 		 441 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250049  normal  0.0164192 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0934  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  36.03 
 
 		 440 aa  249  8e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0970473  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1406  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.56 
 
 		 441 aa  243  6e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.575733  normal  0.479497 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0458  sape  32.94 
 
 		 427 aa  242  1e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00190667  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0380  secretion protein HlyD family protein  34.26 
 
 		 393 aa  237  3e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000127057  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3886  putative RTX secretion protein D  33.33 
 
 		 447 aa  231  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.652406  normal  0.810853 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02273  HlyD family secretion protein  31.52 
 
 		 436 aa  231  3e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0246  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33.33 
 
 		 480 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.777594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1509  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.07 
 
 		 471 aa  227  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2204  secretion protein HlyD family protein  33.57 
 
 		 392 aa  226  7e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1706  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.79 
 
 		 431 aa  224  2e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2037  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.4 
 
 		 477 aa  224  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0681  metalloprotease secretion protein  33.18 
 
 		 393 aa  224  3e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.123046  normal  0.158856 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2544  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  34.15 
 
 		 437 aa  223  6e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.110449  normal  0.225812 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1817  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  34.77 
 
 		 455 aa  221  3e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000964329  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0275  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.15 
 
 		 481 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3025  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  36.47 
 
 		 437 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1562  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.58 
 
 		 440 aa  213  7e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3587  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.36 
 
 		 408 aa  212  9e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50636  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0801  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.62 
 
 		 440 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2478  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32.78 
 
 		 440 aa  211  3e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0114  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.62 
 
 		 433 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0685446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1322  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.91 
 
 		 458 aa  207  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4813  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.64 
 
 		 456 aa  206  6e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.474577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.7 
 
 		 433 aa  206  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.768701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0893  RTX secretion protein D  30.7 
 
 		 433 aa  206  7e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276128  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7140  HlyD family secretion protein  32.93 
 
 		 446 aa  206  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.706887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2600  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.71 
 
 		 444 aa  205  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1162  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.14 
 
 		 460 aa  204  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.793756 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2513  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.53 
 
 		 420 aa  204  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.28 
 
 		 445 aa  203  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2542  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.43 
 
 		 446 aa  203  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0271  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.67 
 
 		 457 aa  204  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3973  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.73 
 
 		 479 aa  202  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3383  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.57 
 
 		 435 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2740  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.6 
 
 		 448 aa  199  9e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2967  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.6 
 
 		 448 aa  199  9e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.34356  normal  0.656863 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6291  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.83 
 
 		 442 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.702424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2977  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33.73 
 
 		 435 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3318  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.93 
 
 		 447 aa  197  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2862  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.4 
 
 		 455 aa  197  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001279  membrane-fusion protein  29.77 
 
 		 446 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3436  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.22 
 
 		 471 aa  196  8.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360287  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3225  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.68 
 
 		 435 aa  196  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4927  secretion protein HlyD  38.99 
 
 		 349 aa  195  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1113  ABC transporter membrane spanning protein (bacteriocin)  29.29 
 
 		 462 aa  195  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0794  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.16 
 
 		 433 aa  195  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0617  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.31 
 
 		 432 aa  195  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290614  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.75 
 
 		 471 aa  194  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1275  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.75 
 
 		 460 aa  194  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0751929 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8003  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.75 
 
 		 460 aa  192  7e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4337  putative toxin/protease secretion system  30.69 
 
 		 661 aa  192  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0138  type I secretion membrane fusion protein  30.22 
 
 		 435 aa  192  9e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0970  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.38 
 
 		 505 aa  191  2e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.995954  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0649  HlyD family secretion protein  30.02 
 
 		 506 aa  190  4e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4391  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.73 
 
 		 438 aa  189  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.687432 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05157  hypothetical protein  29.06 
 
 		 446 aa  188  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0434  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.25 
 
 		 435 aa  187  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5063  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.93 
 
 		 458 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0963  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.23 
 
 		 447 aa  187  5e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5906  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.27 
 
 		 454 aa  186  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418691  hitchhiker  0.00374749 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1212  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.2 
 
 		 453 aa  186  8e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0155  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.22 
 
 		 505 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.353804  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3063  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.98 
 
 		 453 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1802  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.77 
 
 		 452 aa  184  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.520041 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1760  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.79 
 
 		 453 aa  184  4.0000000000000006e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2949  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.53 
 
 		 447 aa  182  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1563  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.18 
 
 		 451 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.838754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3811  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.86 
 
 		 451 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739118 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0939  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.59 
 
 		 494 aa  179  7e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3995  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.77 
 
 		 449 aa  179  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1460  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.43 
 
 		 453 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1665  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.56 
 
 		 448 aa  177  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195288  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>