More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0133 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0133  HlyD family hemolysin secretion protein  100 
 
 		 442 aa  891    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3891  HlyD family hemolysin secretion protein  98.87 
 
 		 442 aa  882    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.76201 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4083  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  99.55 
 
 		 442 aa  888    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1408  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  50.12 
 
 		 452 aa  382  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1724  metalloprotease secretion protein  43.79 
 
 		 443 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20040  metalloprotease secretion protein  43.46 
 
 		 443 aa  325  7e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0389263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2108  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  40.43 
 
 		 448 aa  317  3e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2906  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  40.14 
 
 		 442 aa  315  8e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1556  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  40.52 
 
 		 442 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48100  alkaline protease secretion protein AprE  41.19 
 
 		 432 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322213 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4145  alkaline protease secretion protein AprE  40.95 
 
 		 432 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1281  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  36.98 
 
 		 454 aa  299  8e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1597  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.52 
 
 		 443 aa  298  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.362914  normal  0.115374 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3160  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  40.24 
 
 		 445 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.22456  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.52 
 
 		 446 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.55639 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2559  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.52 
 
 		 446 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.188879 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3329  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  40.53 
 
 		 417 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.40218  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3355  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.28 
 
 		 446 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2681  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  39.9 
 
 		 449 aa  278  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293137 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1346  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  34.95 
 
 		 462 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0584  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.81 
 
 		 455 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.767498  normal  0.0809109 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0040  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  33.41 
 
 		 492 aa  242  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0639189  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16250  Type I secretion membrane fusion protein  32.95 
 
 		 441 aa  238  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0719  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.12 
 
 		 438 aa  229  9e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0934  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  33.18 
 
 		 440 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0970473  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3886  putative RTX secretion protein D  33.49 
 
 		 447 aa  220  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.652406  normal  0.810853 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1817  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.46 
 
 		 455 aa  210  3e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000964329  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1797  HlyD family secretion protein  30.86 
 
 		 441 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250049  normal  0.0164192 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1406  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.86 
 
 		 441 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.575733  normal  0.479497 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1643  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.46 
 
 		 453 aa  206  6e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0458  sape  28.61 
 
 		 427 aa  204  3e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00190667  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1509  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.64 
 
 		 471 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2513  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.05 
 
 		 420 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0275  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.7 
 
 		 481 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3973  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.18 
 
 		 479 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2600  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.03 
 
 		 444 aa  194  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1706  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.4 
 
 		 431 aa  194  4e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0617  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.06 
 
 		 432 aa  194  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290614  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7140  HlyD family secretion protein  32.84 
 
 		 446 aa  193  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.706887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3383  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.49 
 
 		 435 aa  192  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0246  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.47 
 
 		 480 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.777594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2544  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.05 
 
 		 437 aa  190  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.110449  normal  0.225812 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3025  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32.16 
 
 		 437 aa  189  9e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4324  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.38 
 
 		 449 aa  189  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0743  metalloprotease secretion protein  29.41 
 
 		 389 aa  188  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.554659  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0380  secretion protein HlyD family protein  31.06 
 
 		 393 aa  187  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000127057  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.69 
 
 		 471 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1747  secretion protein HlyD family protein  29.63 
 
 		 393 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.570517  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2862  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.99 
 
 		 455 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3995  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.91 
 
 		 449 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0271  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.4 
 
 		 457 aa  182  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0114  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.26 
 
 		 433 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0685446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3587  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.08 
 
 		 408 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50636  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1162  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.93 
 
 		 460 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.793756 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4337  putative toxin/protease secretion system  30.86 
 
 		 661 aa  179  8e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02273  HlyD family secretion protein  30.48 
 
 		 436 aa  179  9e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4927  secretion protein HlyD  30.48 
 
 		 349 aa  179  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3225  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.62 
 
 		 435 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2740  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.35 
 
 		 448 aa  177  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0893  RTX secretion protein D  29.93 
 
 		 433 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276128  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.93 
 
 		 433 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.768701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2967  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.35 
 
 		 448 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.34356  normal  0.656863 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2977  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.62 
 
 		 435 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1322  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.69 
 
 		 458 aa  177  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1562  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.64 
 
 		 440 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0649  HlyD family secretion protein  30.05 
 
 		 506 aa  177  4e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8003  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.21 
 
 		 460 aa  177  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3834  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.26 
 
 		 439 aa  176  8e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0519478  normal  0.0754142 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0801  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.37 
 
 		 440 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2478  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.48 
 
 		 440 aa  172  9e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2542  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.7 
 
 		 446 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3318  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.01 
 
 		 447 aa  172  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1113  ABC transporter membrane spanning protein (bacteriocin)  29.62 
 
 		 462 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5906  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.05 
 
 		 454 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418691  hitchhiker  0.00374749 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2204  secretion protein HlyD family protein  31.78 
 
 		 392 aa  170  5e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6291  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.82 
 
 		 442 aa  169  8e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.702424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0963  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.17 
 
 		 447 aa  169  9e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0939  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.38 
 
 		 494 aa  168  1e-40  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0245  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.86 
 
 		 446 aa  168  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0794  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.84 
 
 		 433 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4391  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.24 
 
 		 438 aa  166  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.687432 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2949  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.95 
 
 		 447 aa  166  9e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3436  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.91 
 
 		 471 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360287  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0681  metalloprotease secretion protein  29.14 
 
 		 393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.123046  normal  0.158856 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1275  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.83 
 
 		 460 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0751929 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1640  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.37 
 
 		 445 aa  163  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.893315 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0155  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.61 
 
 		 505 aa  161  2e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.353804  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1760  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.81 
 
 		 453 aa  161  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0138  type I secretion membrane fusion protein  29.34 
 
 		 435 aa  160  6e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4712  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.06 
 
 		 473 aa  159  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.0413693 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2495  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.14 
 
 		 436 aa  159  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.848242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0970  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.96 
 
 		 505 aa  157  2e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.995954  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2037  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.54 
 
 		 477 aa  157  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.86 
 
 		 445 aa  156  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0434  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.51 
 
 		 435 aa  156  7e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0064  putative type I secretion protein, HlyD family  26.96 
 
 		 429 aa  155  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001279  membrane-fusion protein  27.56 
 
 		 446 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1563  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.06 
 
 		 451 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.838754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05157  hypothetical protein  26.88 
 
 		 446 aa  147  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0136  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.78 
 
 		 455 aa  147  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>