More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0719 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0719  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  100 
 
 		 438 aa  868    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16250  Type I secretion membrane fusion protein  55.4 
 
 		 441 aa  473  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0934  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  54.46 
 
 		 440 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0970473  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1797  HlyD family secretion protein  53.99 
 
 		 441 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250049  normal  0.0164192 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1406  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  53.05 
 
 		 441 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.575733  normal  0.479497 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1817  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  41.53 
 
 		 455 aa  315  9e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000964329  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0040  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  40.61 
 
 		 492 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0639189  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1706  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  38.35 
 
 		 431 aa  293  5e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2544  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  39.04 
 
 		 437 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.110449  normal  0.225812 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0458  sape  37.18 
 
 		 427 aa  278  1e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00190667  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0584  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.96 
 
 		 455 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.767498  normal  0.0809109 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1643  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.69 
 
 		 453 aa  271  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4337  putative toxin/protease secretion system  36.74 
 
 		 661 aa  271  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1562  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  40.24 
 
 		 440 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5906  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.52 
 
 		 454 aa  267  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418691  hitchhiker  0.00374749 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7140  HlyD family secretion protein  37.97 
 
 		 446 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.706887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0271  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  37.74 
 
 		 457 aa  265  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1346  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  37.35 
 
 		 462 aa  264  3e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20040  metalloprotease secretion protein  38.23 
 
 		 443 aa  264  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0389263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1275  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  37.38 
 
 		 460 aa  262  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0751929 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1162  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.78 
 
 		 460 aa  261  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.793756 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2559  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.86 
 
 		 446 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.188879 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1322  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  36.78 
 
 		 458 aa  260  4e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0246  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  37.83 
 
 		 480 aa  260  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.777594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.9 
 
 		 446 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.55639 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8003  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  36.6 
 
 		 460 aa  259  7e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2513  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  37.78 
 
 		 420 aa  259  9e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2108  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  34.84 
 
 		 448 aa  258  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1724  metalloprotease secretion protein  37.65 
 
 		 443 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3025  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  38.66 
 
 		 437 aa  257  4e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3355  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.04 
 
 		 446 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0801  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  38.22 
 
 		 440 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1556  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  35.06 
 
 		 442 aa  252  9.000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2906  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  35.29 
 
 		 442 aa  252  9.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2542  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  34.92 
 
 		 446 aa  252  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3318  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.63 
 
 		 447 aa  252  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0794  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.58 
 
 		 433 aa  251  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3973  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.94 
 
 		 479 aa  251  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0275  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  37.17 
 
 		 481 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3383  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.41 
 
 		 435 aa  251  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1408  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  36.81 
 
 		 452 aa  250  4e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2740  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.52 
 
 		 448 aa  245  9e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2967  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  34.52 
 
 		 448 aa  245  9e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.34356  normal  0.656863 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2862  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  34.83 
 
 		 455 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1597  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.05 
 
 		 443 aa  244  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.362914  normal  0.115374 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3886  putative RTX secretion protein D  33.41 
 
 		 447 aa  244  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.652406  normal  0.810853 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1281  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  33.81 
 
 		 454 aa  243  3e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.35 
 
 		 433 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.768701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0893  RTX secretion protein D  34.35 
 
 		 433 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276128  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02273  HlyD family secretion protein  34.37 
 
 		 436 aa  241  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48100  alkaline protease secretion protein AprE  36.43 
 
 		 432 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322213 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0939  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.85 
 
 		 494 aa  237  3e-61  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4145  alkaline protease secretion protein AprE  35.97 
 
 		 432 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0970  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.32 
 
 		 505 aa  236  8e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.995954  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1563  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  35.51 
 
 		 451 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.838754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0617  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.04 
 
 		 432 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290614  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3834  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  35.46 
 
 		 439 aa  230  5e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0519478  normal  0.0754142 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3436  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.08 
 
 		 471 aa  228  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360287  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0155  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.09 
 
 		 505 aa  227  3e-58  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.353804  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1509  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.62 
 
 		 471 aa  227  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3160  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  33.57 
 
 		 445 aa  225  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.22456  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6291  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.43 
 
 		 442 aa  225  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.702424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0114  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.21 
 
 		 433 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0685446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2949  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.89 
 
 		 447 aa  223  7e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3587  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.45 
 
 		 408 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50636  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4813  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32 
 
 		 456 aa  220  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.474577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2681  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32.24 
 
 		 449 aa  220  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293137 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4712  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.38 
 
 		 473 aa  220  5e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.0413693 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4083  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.65 
 
 		 442 aa  219  6e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2977  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  34.01 
 
 		 435 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0649  HlyD family secretion protein  30.95 
 
 		 506 aa  219  1e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3225  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33.33 
 
 		 435 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0133  HlyD family hemolysin secretion protein  33.65 
 
 		 442 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1640  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  33.64 
 
 		 445 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.893315 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1113  ABC transporter membrane spanning protein (bacteriocin)  30.38 
 
 		 462 aa  218  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3891  HlyD family hemolysin secretion protein  33.65 
 
 		 442 aa  217  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.76201 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0963  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.44 
 
 		 447 aa  216  5e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3329  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.5 
 
 		 417 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.40218  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4391  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.87 
 
 		 438 aa  215  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.687432 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  34.76 
 
 		 445 aa  212  7.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1665  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.54 
 
 		 448 aa  212  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0743  metalloprotease secretion protein  32.79 
 
 		 389 aa  210  3e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.554659  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0138  type I secretion membrane fusion protein  30.59 
 
 		 435 aa  209  6e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2478  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  33.17 
 
 		 440 aa  209  9e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1982  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  35.29 
 
 		 448 aa  209  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2204  secretion protein HlyD family protein  32.78 
 
 		 392 aa  205  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1760  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.73 
 
 		 453 aa  204  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2037  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.94 
 
 		 477 aa  204  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2600  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.72 
 
 		 444 aa  202  8e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3995  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33.57 
 
 		 449 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4335  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.58 
 
 		 443 aa  196  8.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0380  secretion protein HlyD family protein  32.95 
 
 		 393 aa  196  8.000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000127057  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0681  metalloprotease secretion protein  32 
 
 		 393 aa  195  1e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.123046  normal  0.158856 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0434  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  33.01 
 
 		 435 aa  194  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.44 
 
 		 471 aa  193  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001279  membrane-fusion protein  31.92 
 
 		 446 aa  192  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4324  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.79 
 
 		 449 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0245  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.19 
 
 		 446 aa  189  9e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1747  secretion protein HlyD family protein  30.42 
 
 		 393 aa  187  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.570517  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0064  putative type I secretion protein, HlyD family  30.65 
 
 		 429 aa  186  9e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>