More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2740 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_2740  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  100 
 
 
448 aa  886    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2542  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  74.72 
 
 
446 aa  659    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2967  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  100 
 
 
448 aa  886    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.34356  normal  0.656863 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2862  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  95.21 
 
 
455 aa  827    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3318  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  72.77 
 
 
447 aa  629  1e-179  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3383  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  63.76 
 
 
435 aa  548  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2513  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  66.51 
 
 
420 aa  544  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2544  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  60.24 
 
 
437 aa  500  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.110449  normal  0.225812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7140  HlyD family secretion protein  57.51 
 
 
446 aa  464  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.706887  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3025  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  55.35 
 
 
437 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6291  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  54.14 
 
 
442 aa  434  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.702424  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0801  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  49.18 
 
 
440 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4337  putative toxin/protease secretion system  48.54 
 
 
661 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165043  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1562  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  48.63 
 
 
440 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4391  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  49.42 
 
 
438 aa  378  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.687432 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3225  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  45.41 
 
 
435 aa  361  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2977  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  44 
 
 
435 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0040  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  44.11 
 
 
492 aa  317  2e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0639189  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1665  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.62 
 
 
448 aa  311  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195288  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0794  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  41.94 
 
 
433 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1982  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  40.4 
 
 
448 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1113  ABC transporter membrane spanning protein (bacteriocin)  40.33 
 
 
462 aa  304  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1563  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  40.77 
 
 
451 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.838754  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0138  type I secretion membrane fusion protein  39.56 
 
 
435 aa  291  2e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16250  Type I secretion membrane fusion protein  40.8 
 
 
441 aa  289  6e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2037  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  41.19 
 
 
477 aa  286  5e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.65 
 
 
433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.768701  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0893  RTX secretion protein D  40.65 
 
 
433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276128  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3886  putative RTX secretion protein D  41.65 
 
 
447 aa  282  9e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.652406  normal  0.810853 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1275  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.27 
 
 
460 aa  281  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0751929 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2478  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  39.58 
 
 
440 aa  280  3e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02273  HlyD family secretion protein  36.82 
 
 
436 aa  280  4e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0245  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  39.35 
 
 
446 aa  277  3e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0114  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.95 
 
 
433 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0685446  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8003  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  36.85 
 
 
460 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5906  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.21 
 
 
454 aa  274  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418691  hitchhiker  0.00374749 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0271  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  37.99 
 
 
457 aa  270  4e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1322  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  37.77 
 
 
458 aa  264  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1162  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  37.53 
 
 
460 aa  263  6e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.793756 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0434  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  36.95 
 
 
435 aa  258  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1406  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  37.47 
 
 
441 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.575733  normal  0.479497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1797  HlyD family secretion protein  36.6 
 
 
441 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250049  normal  0.0164192 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0934  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  37.32 
 
 
440 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0970473  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0246  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  34.02 
 
 
480 aa  250  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.777594  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1509  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  37.76 
 
 
471 aa  248  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0719  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.52 
 
 
438 aa  245  9e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0155  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.49 
 
 
505 aa  243  6e-63  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.353804  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0275  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.64 
 
 
481 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2949  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32.38 
 
 
447 aa  238  1e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4712  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.03 
 
 
473 aa  237  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.0413693 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0970  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.15 
 
 
505 aa  236  9e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.995954  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.08 
 
 
471 aa  234  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0617  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.42 
 
 
432 aa  232  8.000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290614  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48100  alkaline protease secretion protein AprE  35.31 
 
 
432 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322213 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3973  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.68 
 
 
479 aa  228  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4145  alkaline protease secretion protein AprE  34.95 
 
 
432 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1281  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  34.38 
 
 
454 aa  226  4e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0963  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.89 
 
 
447 aa  226  7e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3436  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.19 
 
 
471 aa  224  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360287  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4813  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.88 
 
 
456 aa  220  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.474577  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1724  metalloprotease secretion protein  37.72 
 
 
443 aa  220  5e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1706  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  33.41 
 
 
431 aa  218  1e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20040  metalloprotease secretion protein  37.8 
 
 
443 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0389263  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0649  HlyD family secretion protein  30.88 
 
 
506 aa  217  2.9999999999999998e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0458  sape  33.33 
 
 
427 aa  217  2.9999999999999998e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00190667  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3834  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  34.38 
 
 
439 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0519478  normal  0.0754142 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2600  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.26 
 
 
444 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2108  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  34.68 
 
 
448 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1346  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32.8 
 
 
462 aa  210  3e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1817  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32.68 
 
 
455 aa  206  5e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000964329  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0584  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.73 
 
 
455 aa  204  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.767498  normal  0.0809109 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4335  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.55 
 
 
443 aa  202  9e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526899  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1556  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.71 
 
 
442 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1760  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.96 
 
 
453 aa  199  6e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.6 
 
 
446 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.55639 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2559  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.6 
 
 
446 aa  199  9e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.188879 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3329  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33 
 
 
417 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.40218  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1640  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  33.41 
 
 
445 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.893315 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0064  putative type I secretion protein, HlyD family  28.23 
 
 
429 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3160  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32.51 
 
 
445 aa  196  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.22456  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2495  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.04 
 
 
436 aa  196  7e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.848242  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3355  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.37 
 
 
446 aa  196  9e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1408  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33.33 
 
 
452 aa  194  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2906  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.48 
 
 
442 aa  194  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1597  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.91 
 
 
443 aa  190  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.362914  normal  0.115374 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2681  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32.94 
 
 
449 aa  189  7e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293137 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3995  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.73 
 
 
449 aa  189  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1643  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.51 
 
 
453 aa  188  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4324  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.5 
 
 
449 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0939  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.49 
 
 
494 aa  180  4.999999999999999e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3587  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.94 
 
 
408 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50636  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.95 
 
 
445 aa  179  8e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001279  membrane-fusion protein  30.72 
 
 
446 aa  176  7e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2093  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.61 
 
 
468 aa  171  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3891  HlyD family hemolysin secretion protein  31.35 
 
 
442 aa  171  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.76201 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0301  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.69 
 
 
471 aa  170  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4083  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.35 
 
 
442 aa  170  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0133  HlyD family hemolysin secretion protein  31.35 
 
 
442 aa  169  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1419  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.16 
 
 
446 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1876  HlyD family secretion protein  31.19 
 
 
475 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.111027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>