More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2681 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3329  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  80.29 
 
 
417 aa  674    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.40218  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3160  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  78.23 
 
 
445 aa  698    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.22456  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2681  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  100 
 
 
449 aa  910    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293137 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4145  alkaline protease secretion protein AprE  50.81 
 
 
432 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48100  alkaline protease secretion protein AprE  49.65 
 
 
432 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322213 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1724  metalloprotease secretion protein  49.65 
 
 
443 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20040  metalloprotease secretion protein  49.3 
 
 
443 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0389263  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1281  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  42.82 
 
 
454 aa  369  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1597  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  45.39 
 
 
443 aa  369  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.362914  normal  0.115374 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2108  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  43.33 
 
 
448 aa  363  4e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1408  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  45.43 
 
 
452 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2906  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  42.73 
 
 
442 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1556  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  41.69 
 
 
442 aa  330  3e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2559  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.03 
 
 
446 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.188879 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3355  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.03 
 
 
446 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.03 
 
 
446 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.55639 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4083  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.14 
 
 
442 aa  276  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0133  HlyD family hemolysin secretion protein  39.9 
 
 
442 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0040  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  35.68 
 
 
492 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0639189  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3891  HlyD family hemolysin secretion protein  39.67 
 
 
442 aa  273  6e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.76201 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4927  secretion protein HlyD  36.24 
 
 
349 aa  268  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16250  Type I secretion membrane fusion protein  34.93 
 
 
441 aa  257  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0584  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  37.19 
 
 
455 aa  252  7e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.767498  normal  0.0809109 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1346  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  33.57 
 
 
462 aa  248  1e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0934  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  34.64 
 
 
440 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0970473  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1643  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.63 
 
 
453 aa  245  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3886  putative RTX secretion protein D  35.63 
 
 
447 aa  242  9e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.652406  normal  0.810853 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1406  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.96 
 
 
441 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.575733  normal  0.479497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1797  HlyD family secretion protein  31.92 
 
 
441 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250049  normal  0.0164192 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0719  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.24 
 
 
438 aa  229  6e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4337  putative toxin/protease secretion system  32.38 
 
 
661 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165043  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2544  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33.17 
 
 
437 aa  209  9e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.110449  normal  0.225812 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0458  sape  28.74 
 
 
427 aa  206  8e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00190667  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32 
 
 
433 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.768701  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0893  RTX secretion protein D  32 
 
 
433 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276128  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3973  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.86 
 
 
479 aa  202  9e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02273  HlyD family secretion protein  32.77 
 
 
436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.55 
 
 
471 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3587  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.08 
 
 
408 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50636  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4712  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.77 
 
 
473 aa  199  9e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.0413693 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1706  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.55 
 
 
431 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1817  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.21 
 
 
455 aa  197  3e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000964329  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0114  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.1 
 
 
433 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0685446  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0801  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.56 
 
 
440 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0794  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.97 
 
 
433 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2740  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.94 
 
 
448 aa  196  6e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2967  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.94 
 
 
448 aa  196  6e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.34356  normal  0.656863 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5906  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.38 
 
 
454 aa  195  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418691  hitchhiker  0.00374749 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2862  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.22 
 
 
455 aa  195  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3025  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.46 
 
 
437 aa  194  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0138  type I secretion membrane fusion protein  32.64 
 
 
435 aa  193  5e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3436  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.5 
 
 
471 aa  192  7e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360287  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0246  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.35 
 
 
480 aa  192  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.777594  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1509  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.16 
 
 
471 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0380  secretion protein HlyD family protein  31.02 
 
 
393 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000127057  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0681  metalloprotease secretion protein  29.01 
 
 
393 aa  190  5e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.123046  normal  0.158856 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3834  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32.46 
 
 
439 aa  189  8e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0519478  normal  0.0754142 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1562  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.91 
 
 
440 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3225  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30 
 
 
435 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2977  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.21 
 
 
435 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0743  metalloprotease secretion protein  31.94 
 
 
389 aa  188  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.554659  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2513  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.33 
 
 
420 aa  187  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1747  secretion protein HlyD family protein  30.57 
 
 
393 aa  187  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.570517  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2037  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.93 
 
 
477 aa  186  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0275  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.88 
 
 
481 aa  186  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2600  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.18 
 
 
444 aa  186  7e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4391  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.08 
 
 
438 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.687432 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3318  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.19 
 
 
447 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2542  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.57 
 
 
446 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6291  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.31 
 
 
442 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.702424  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0970  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.38 
 
 
505 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.995954  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0617  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.44 
 
 
432 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290614  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0271  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.76 
 
 
457 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3383  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33 
 
 
435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2478  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.98 
 
 
440 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1322  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.05 
 
 
458 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1162  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.05 
 
 
460 aa  180  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.793756 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.85 
 
 
445 aa  179  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8003  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.9 
 
 
460 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0155  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.38 
 
 
505 aa  178  2e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.353804  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1113  ABC transporter membrane spanning protein (bacteriocin)  29.28 
 
 
462 aa  178  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2204  secretion protein HlyD family protein  28.84 
 
 
392 aa  177  3e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1275  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.2 
 
 
460 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0751929 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7140  HlyD family secretion protein  29.53 
 
 
446 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.706887  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0649  HlyD family secretion protein  25.86 
 
 
506 aa  172  1e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2949  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.5 
 
 
447 aa  172  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0434  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.8 
 
 
435 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0963  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.16 
 
 
447 aa  170  5e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1640  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.55 
 
 
445 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.893315 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1760  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.77 
 
 
453 aa  162  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1563  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.5 
 
 
451 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.838754  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4324  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.01 
 
 
449 aa  156  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2495  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.24 
 
 
436 aa  155  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.848242  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001279  membrane-fusion protein  27.44 
 
 
446 aa  152  8.999999999999999e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3995  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.47 
 
 
449 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0245  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.02 
 
 
446 aa  151  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0366  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.48 
 
 
460 aa  150  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05157  hypothetical protein  27.32 
 
 
446 aa  150  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0475  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.4 
 
 
460 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.205035  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4335  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.25 
 
 
443 aa  147  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526899  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>