More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3593 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0366  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  79.78 
 
 
460 aa  763    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4319  HlyD family secretion protein  94.35 
 
 
484 aa  869    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0475  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  77.17 
 
 
460 aa  717    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.205035  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3984  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  93.48 
 
 
460 aa  868    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0311  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  81.3 
 
 
460 aa  775    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3593  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  100 
 
 
460 aa  936    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0382  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  82.39 
 
 
460 aa  768    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  93.48 
 
 
460 aa  868    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4141  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  80 
 
 
460 aa  768    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.504346  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4100  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  93.48 
 
 
460 aa  868    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0382  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  94.35 
 
 
460 aa  869    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3644  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  94.35 
 
 
460 aa  869    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0434  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  81.52 
 
 
460 aa  763    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3260  HlyD family secretion protein  80.22 
 
 
460 aa  775    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3907  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  93.48 
 
 
460 aa  868    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0380  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  94.57 
 
 
460 aa  872    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0162  HlyD family secretion protein  50.98 
 
 
481 aa  487  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1101  secretion protein, HlyD family  48.69 
 
 
463 aa  464  1e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001011  ABC-type protease exporter membrane fusion protein (MFP) family component PrtE/AprE  48.69 
 
 
463 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07089  hypothetical protein  48.14 
 
 
486 aa  451  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1802  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  43.27 
 
 
452 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.520041 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1212  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  41.37 
 
 
453 aa  374  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3063  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  39.96 
 
 
453 aa  369  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0794  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  41.68 
 
 
440 aa  363  2e-99  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00028021  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3811  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.26 
 
 
451 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739118 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1460  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  41.15 
 
 
453 aa  360  4e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2823  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  42.83 
 
 
443 aa  357  2.9999999999999997e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.51941 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3201  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  42.57 
 
 
471 aa  356  5e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.195077  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6372  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  41.74 
 
 
474 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17068  normal  0.732434 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  42.26 
 
 
439 aa  350  2e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6075  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  41.52 
 
 
474 aa  349  6e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0374496  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1292  HlyD family secretion protein  42.23 
 
 
461 aa  348  1e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.969928  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5972  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  41.71 
 
 
433 aa  347  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.802564  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5063  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.04 
 
 
458 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0136  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  40.94 
 
 
455 aa  344  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0892  acriflavine resistance protein  39.05 
 
 
488 aa  342  5.999999999999999e-93  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00239109  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  39.82 
 
 
430 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0164  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  37.83 
 
 
487 aa  334  2e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.846875  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1419  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  39.56 
 
 
446 aa  331  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2093  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  41.34 
 
 
468 aa  327  2.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.04 
 
 
458 aa  325  7e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000605389 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0004  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  39.14 
 
 
442 aa  325  7e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.197437  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0185  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.85 
 
 
458 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.116801 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1474  secretion system protein D  40.99 
 
 
378 aa  323  4e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0184  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.85 
 
 
458 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.326203 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  39.45 
 
 
474 aa  323  4e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1976  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.73 
 
 
448 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1509  secretion system protein D  40.77 
 
 
378 aa  319  6e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0301  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  38.85 
 
 
471 aa  317  3e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1159  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  37.2 
 
 
466 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.126981 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2661  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.89 
 
 
473 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0786  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  39.02 
 
 
472 aa  310  2.9999999999999997e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.378265  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1882  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  38.94 
 
 
430 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1663  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  39.47 
 
 
472 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.131459 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3769  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  36.8 
 
 
471 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1876  HlyD family secretion protein  40.38 
 
 
475 aa  302  8.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2243  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  35.5 
 
 
444 aa  302  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4206  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.93 
 
 
437 aa  295  1e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2016  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  37.27 
 
 
480 aa  295  1e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0565  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  37.53 
 
 
447 aa  293  6e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0991  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  38.11 
 
 
389 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3320  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  38.11 
 
 
389 aa  281  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02941  HlyD family secretion protein  34.22 
 
 
455 aa  276  6e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107369  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0636  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  34.92 
 
 
674 aa  276  7e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0052  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  37 
 
 
395 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2759  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  37.47 
 
 
421 aa  270  4e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246245  normal  0.864922 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0585  membrane spanning export protein  36.49 
 
 
391 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.836061  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40230  putative secretion protein  36.36 
 
 
395 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.975175  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3409  putative secretion protein  35.9 
 
 
395 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202661  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.44 
 
 
468 aa  248  1e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3122  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.2 
 
 
399 aa  248  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3148  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.4 
 
 
416 aa  247  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2059  HlyD family secretion protein  34.26 
 
 
469 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2195  HlyD family secretion protein  34.26 
 
 
471 aa  246  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2301  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.63 
 
 
468 aa  241  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.03 
 
 
439 aa  242  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4383  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.03 
 
 
394 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.915143  normal  0.374406 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0842  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  37.07 
 
 
394 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2838  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33.41 
 
 
396 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2889  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33.63 
 
 
396 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0810996 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3021  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33.94 
 
 
396 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0405011 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2907  type I secretion membrane fusion protein HlyD family  34.17 
 
 
396 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.891206  normal  0.048093 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.29 
 
 
427 aa  237  3e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0862799 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2908  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33.71 
 
 
396 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0803  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.59 
 
 
394 aa  236  8e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0827  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.83 
 
 
394 aa  236  8e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.72853  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2412  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.18 
 
 
399 aa  233  4.0000000000000004e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.449428  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4600  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.81 
 
 
410 aa  232  8.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2437  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.93 
 
 
428 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1759  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.14 
 
 
518 aa  225  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0119826 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0276  HlyD family secretion protein  30.02 
 
 
390 aa  217  4e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0227266  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2502  secretion protein  33.56 
 
 
439 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.867679 
 
 
-
 
NC_003296  RS05073  putative hemolysin-type secretion transmembrane protein  34.91 
 
 
358 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1191  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.29 
 
 
424 aa  210  4e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.795272  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3712  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.41 
 
 
390 aa  207  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.01612  normal  0.250186 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0528  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.48 
 
 
390 aa  207  3e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.178429 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4164  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.66 
 
 
469 aa  205  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.833076  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4324  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.98 
 
 
403 aa  200  6e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.415601  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0787  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.95 
 
 
403 aa  199  7.999999999999999e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0761  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.21 
 
 
389 aa  188  1e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011649  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>