More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2714 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  100 
 
 
451 aa  905    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  48.55 
 
 
472 aa  411  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3075  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32.15 
 
 
473 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.775261  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1969  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30 
 
 
468 aa  217  4e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.786777  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6771  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.3 
 
 
475 aa  210  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1567  hemolysin secretion protein D  31.47 
 
 
473 aa  204  2e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.496852  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1500  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.25 
 
 
473 aa  204  3e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6406  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.43 
 
 
480 aa  194  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2575  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.49 
 
 
480 aa  192  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00303774 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4164  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.16 
 
 
469 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.833076  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6210  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.43 
 
 
480 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.596847  normal  0.481561 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4926  HlyD family secretion protein  30.62 
 
 
472 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5422  HlyD family secretion protein  30.97 
 
 
473 aa  180  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970488  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  31.83 
 
 
467 aa  179  9e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1802  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.08 
 
 
452 aa  176  7e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.520041 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  31.35 
 
 
457 aa  176  8e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1890  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  32.16 
 
 
456 aa  174  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.16 
 
 
456 aa  174  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.295152  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.79 
 
 
511 aa  173  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3819  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.39 
 
 
514 aa  172  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891918  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3811  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.29 
 
 
451 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739118 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1021  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.73 
 
 
444 aa  171  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6075  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.28 
 
 
474 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0374496  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6669  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.02 
 
 
466 aa  170  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00836718  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6372  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.28 
 
 
474 aa  170  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17068  normal  0.732434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5063  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.61 
 
 
458 aa  169  8e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6495  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.97 
 
 
479 aa  169  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0136  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.06 
 
 
455 aa  169  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.87 
 
 
439 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1212  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.27 
 
 
453 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2661  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.17 
 
 
473 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.27 
 
 
439 aa  166  6.9999999999999995e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.28 
 
 
430 aa  166  9e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3047  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.63 
 
 
477 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.666099  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0184  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.75 
 
 
458 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.326203 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.11 
 
 
458 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000605389 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2368  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.76 
 
 
447 aa  164  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0185  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.11 
 
 
458 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.116801 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5972  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.11 
 
 
433 aa  163  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.802564  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0983  secretion protein HlyD family protein  27.25 
 
 
439 aa  162  8.000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.213399  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3063  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.55 
 
 
453 aa  162  9e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1882  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.37 
 
 
430 aa  160  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.75 
 
 
474 aa  160  5e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  23.27 
 
 
434 aa  160  5e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1460  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.56 
 
 
453 aa  159  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0301  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.46 
 
 
471 aa  158  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2759  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.43 
 
 
421 aa  158  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246245  normal  0.864922 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1159  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.37 
 
 
466 aa  154  4e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.126981 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.65 
 
 
465 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.65 
 
 
465 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02941  HlyD family secretion protein  28.15 
 
 
455 aa  152  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107369  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1292  HlyD family secretion protein  31.12 
 
 
461 aa  152  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.969928  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.81 
 
 
427 aa  152  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0862799 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0162  HlyD family secretion protein  26.91 
 
 
481 aa  152  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.91 
 
 
447 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540903  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0892  acriflavine resistance protein  26.44 
 
 
488 aa  151  2e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00239109  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5004  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.7 
 
 
447 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1419  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.14 
 
 
446 aa  149  7e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2243  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.24 
 
 
444 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1474  secretion system protein D  28.27 
 
 
378 aa  149  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1976  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.44 
 
 
448 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2059  HlyD family secretion protein  27.46 
 
 
469 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2195  HlyD family secretion protein  27.46 
 
 
471 aa  147  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0164  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.67 
 
 
487 aa  147  6e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.846875  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0842  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.8 
 
 
394 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0883  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.12 
 
 
491 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2412  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.71 
 
 
399 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.449428  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2137  type I secretion adaptor protein (HlyD family)  26.59 
 
 
442 aa  145  2e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.83885  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0794  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.46 
 
 
440 aa  145  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00028021  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0827  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.55 
 
 
394 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.72853  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3769  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.65 
 
 
471 aa  144  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0803  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.55 
 
 
394 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1598  hlyD family secretion protein  28.61 
 
 
389 aa  143  7e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0549137  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0565  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.64 
 
 
447 aa  142  9e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4383  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.55 
 
 
394 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.915143  normal  0.374406 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3593  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.85 
 
 
460 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1509  secretion system protein D  27.4 
 
 
378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1759  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.22 
 
 
518 aa  140  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0119826 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.5 
 
 
468 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0636  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.74 
 
 
674 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0311  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.29 
 
 
460 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3021  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.46 
 
 
396 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0405011 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3697  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.45 
 
 
481 aa  139  7.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.108936 
 
 
-
 
NC_003296  RS03671  hemolysin secretion-like transmembrane protein  28 
 
 
447 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0042  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.71 
 
 
442 aa  139  1e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2838  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.21 
 
 
396 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2502  secretion protein  28.77 
 
 
439 aa  139  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.867679 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2908  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.46 
 
 
396 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0475  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.03 
 
 
460 aa  139  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.205035  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3907  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.81 
 
 
460 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4456  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.68 
 
 
438 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715639  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.81 
 
 
460 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3984  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.81 
 
 
460 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2907  type I secretion membrane fusion protein HlyD family  26.21 
 
 
396 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.891206  normal  0.048093 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0382  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.91 
 
 
460 aa  138  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4100  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.81 
 
 
460 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2889  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.21 
 
 
396 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0810996 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3122  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.65 
 
 
399 aa  138  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3566  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.84 
 
 
463 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0786  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.32 
 
 
472 aa  137  4e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.378265  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>