More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5156 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5004  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  94.41 
 
 
447 aa  839    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  100 
 
 
447 aa  892    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540903  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_003296  RS03671  hemolysin secretion-like transmembrane protein  64.43 
 
 
447 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2368  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  56.38 
 
 
447 aa  504  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2575  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  42.58 
 
 
480 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00303774 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3075  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  43.25 
 
 
473 aa  349  6e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.775261  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1567  hemolysin secretion protein D  38.69 
 
 
473 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.496852  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1500  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.27 
 
 
473 aa  312  7.999999999999999e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4926  HlyD family secretion protein  37.37 
 
 
472 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6771  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.3 
 
 
475 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1969  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.67 
 
 
468 aa  262  8.999999999999999e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.786777  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4164  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.92 
 
 
469 aa  245  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.833076  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5422  HlyD family secretion protein  36.3 
 
 
473 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970488  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3819  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.85 
 
 
514 aa  236  6e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891918  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  33.18 
 
 
457 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  37.12 
 
 
511 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1890  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  34.79 
 
 
456 aa  229  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.79 
 
 
456 aa  229  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.295152  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  30.82 
 
 
467 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0020  leukotoxin secretion protein D  28.51 
 
 
479 aa  210  5e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1021  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  34.68 
 
 
444 aa  199  7.999999999999999e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3697  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.05 
 
 
481 aa  192  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.108936 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0883  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.08 
 
 
491 aa  190  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  27.92 
 
 
434 aa  187  3e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6495  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.39 
 
 
479 aa  186  8e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6669  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.74 
 
 
466 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00836718  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0983  secretion protein HlyD family protein  26.8 
 
 
439 aa  182  9.000000000000001e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.213399  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.1 
 
 
472 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30 
 
 
465 aa  168  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30 
 
 
465 aa  168  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1515  HlyD family secretion protein  40.91 
 
 
227 aa  160  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.619726 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1759  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.95 
 
 
518 aa  159  9e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0119826 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3020  HlyD family secretion protein  41.81 
 
 
179 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.133267 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1474  secretion system protein D  28.32 
 
 
378 aa  154  4e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1882  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.62 
 
 
430 aa  154  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0136  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.07 
 
 
455 aa  153  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1460  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.19 
 
 
453 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1509  secretion system protein D  27.55 
 
 
378 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1802  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.72 
 
 
452 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.520041 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5063  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.36 
 
 
458 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2016  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.36 
 
 
480 aa  151  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.91 
 
 
451 aa  151  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0004  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.7 
 
 
442 aa  150  5e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.197437  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0382  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.98 
 
 
460 aa  150  5e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3644  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.98 
 
 
460 aa  150  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0475  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.98 
 
 
460 aa  149  8e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.205035  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4319  HlyD family secretion protein  25.83 
 
 
484 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4141  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26 
 
 
460 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.504346  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0184  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.02 
 
 
458 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.326203 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.5 
 
 
458 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000605389 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4148  HlyD family secretion protein  26.04 
 
 
441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3260  HlyD family secretion protein  27.23 
 
 
460 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0185  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.5 
 
 
458 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.116801 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1212  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.74 
 
 
453 aa  147  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0567  secretion protein HlyD family  26.34 
 
 
491 aa  147  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2195  HlyD family secretion protein  26.8 
 
 
471 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0380  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.42 
 
 
460 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0311  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.63 
 
 
460 aa  146  9e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0434  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  27.01 
 
 
460 aa  145  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2059  HlyD family secretion protein  27.27 
 
 
469 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3811  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.82 
 
 
451 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739118 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0052  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.53 
 
 
395 aa  144  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3122  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.75 
 
 
399 aa  144  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0366  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.46 
 
 
460 aa  144  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0382  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.38 
 
 
460 aa  144  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0565  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.42 
 
 
447 aa  143  7e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3593  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.97 
 
 
460 aa  143  7e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0162  HlyD family secretion protein  27.79 
 
 
481 aa  143  8e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0761  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.5 
 
 
389 aa  142  9e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011649  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3063  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.49 
 
 
453 aa  142  9e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3984  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.48 
 
 
460 aa  141  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3907  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.48 
 
 
460 aa  141  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02941  HlyD family secretion protein  27.54 
 
 
455 aa  141  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107369  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4100  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.48 
 
 
460 aa  141  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.48 
 
 
460 aa  141  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1976  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.63 
 
 
448 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.41 
 
 
439 aa  140  6e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6210  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.59 
 
 
480 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.596847  normal  0.481561 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1159  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.72 
 
 
466 aa  139  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.126981 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2301  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30 
 
 
468 aa  138  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0636  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.83 
 
 
674 aa  138  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6406  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.1 
 
 
480 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.4 
 
 
468 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0786  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.21 
 
 
472 aa  137  5e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.378265  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2759  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.93 
 
 
421 aa  137  5e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246245  normal  0.864922 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2429  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.71 
 
 
441 aa  136  6.0000000000000005e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0794  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.02 
 
 
440 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00028021  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1663  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.13 
 
 
472 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.131459 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2276  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.65 
 
 
389 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1419  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26 
 
 
446 aa  134  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0276  HlyD family secretion protein  28.68 
 
 
390 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0227266  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3047  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.1 
 
 
477 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.666099  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.43 
 
 
427 aa  134  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0862799 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2838  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.08 
 
 
396 aa  133  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1598  hlyD family secretion protein  28.1 
 
 
389 aa  132  7.999999999999999e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0549137  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2907  type I secretion membrane fusion protein HlyD family  28.08 
 
 
396 aa  132  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.891206  normal  0.048093 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3021  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.65 
 
 
396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0405011 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2661  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.68 
 
 
473 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2908  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.65 
 
 
396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4600  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.17 
 
 
410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>