More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2368 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2368  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  100 
 
 		 447 aa  905    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03671  hemolysin secretion-like transmembrane protein  61.3 
 
 		 447 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  56.38 
 
 		 447 aa  504  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540903  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5004  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  55.48 
 
 		 447 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2575  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  44.64 
 
 		 480 aa  395  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303774 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3075  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  43.44 
 
 		 473 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.775261  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4926  HlyD family secretion protein  38.22 
 
 		 472 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1567  hemolysin secretion protein D  37.34 
 
 		 473 aa  293  4e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.496852  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1500  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  37.13 
 
 		 473 aa  292  8e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6771  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.57 
 
 		 475 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  36.36 
 
 		 457 aa  264  3e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1969  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.12 
 
 		 468 aa  254  1.0000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.786777  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4164  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.77 
 
 		 469 aa  252  9.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.833076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  37.34 
 
 		 511 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1890  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  35.84 
 
 		 456 aa  244  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.84 
 
 		 456 aa  244  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.295152  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3819  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.62 
 
 		 514 aa  241  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0020  leukotoxin secretion protein D  30.9 
 
 		 479 aa  228  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5422  HlyD family secretion protein  33.7 
 
 		 473 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970488  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6669  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.92 
 
 		 466 aa  208  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00836718  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  31.66 
 
 		 467 aa  205  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6495  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.38 
 
 		 479 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0883  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.14 
 
 		 491 aa  199  7.999999999999999e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1021  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.52 
 
 		 444 aa  193  5e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0983  secretion protein HlyD family protein  27.48 
 
 		 439 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.213399  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  27.75 
 
 		 434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3697  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.11 
 
 		 481 aa  178  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.108936 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.11 
 
 		 465 aa  176  6e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.11 
 
 		 465 aa  176  6e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.56 
 
 		 472 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1515  HlyD family secretion protein  42.01 
 
 		 227 aa  169  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.619726 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1759  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.44 
 
 		 518 aa  167  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0119826 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.76 
 
 		 451 aa  164  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1976  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.39 
 
 		 448 aa  159  7e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0567  secretion protein HlyD family  28.82 
 
 		 491 aa  159  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3020  HlyD family secretion protein  42.53 
 
 		 179 aa  157  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.133267 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0366  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.08 
 
 		 460 aa  157  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2016  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.06 
 
 		 480 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3593  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.93 
 
 		 460 aa  153  5e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3907  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.22 
 
 		 460 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.22 
 
 		 460 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4141  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.59 
 
 		 460 aa  152  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.504346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3984  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.22 
 
 		 460 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0636  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.52 
 
 		 674 aa  152  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4100  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.22 
 
 		 460 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0382  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.77 
 
 		 460 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3644  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.77 
 
 		 460 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0475  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.95 
 
 		 460 aa  151  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.205035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3260  HlyD family secretion protein  27.95 
 
 		 460 aa  151  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0136  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.22 
 
 		 455 aa  150  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4319  HlyD family secretion protein  27.35 
 
 		 484 aa  150  6e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0380  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.58 
 
 		 460 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1882  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.89 
 
 		 430 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0786  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.42 
 
 		 472 aa  147  3e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.378265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2195  HlyD family secretion protein  26.94 
 
 		 471 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0311  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.9 
 
 		 460 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1159  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.73 
 
 		 466 aa  146  6e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.126981 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1474  secretion system protein D  27.11 
 
 		 378 aa  146  7.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2059  HlyD family secretion protein  27.64 
 
 		 469 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1292  HlyD family secretion protein  28.11 
 
 		 461 aa  144  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.969928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.9 
 
 		 439 aa  144  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1419  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.6 
 
 		 446 aa  143  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.82 
 
 		 427 aa  143  6e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0185  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.01 
 
 		 458 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.116801 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3811  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.95 
 
 		 451 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739118 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.33 
 
 		 458 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000605389 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5063  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.38 
 
 		 458 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1460  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.31 
 
 		 453 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0382  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.27 
 
 		 460 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0052  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.24 
 
 		 395 aa  141  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2759  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.78 
 
 		 421 aa  140  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246245  normal  0.864922 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1802  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.84 
 
 		 452 aa  141  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.520041 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0184  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.78 
 
 		 458 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326203 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1509  secretion system protein D  26.63 
 
 		 378 aa  140  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3047  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.46 
 
 		 477 aa  140  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.666099  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0004  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.88 
 
 		 442 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.197437  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2301  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.86 
 
 		 468 aa  139  7.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3063  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.27 
 
 		 453 aa  139  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2661  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.75 
 
 		 473 aa  139  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1598  hlyD family secretion protein  27.75 
 
 		 389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0549137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1212  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.96 
 
 		 453 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0991  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.12 
 
 		 389 aa  137  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1663  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.6 
 
 		 472 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.131459 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3201  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.67 
 
 		 471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.195077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0761  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.68 
 
 		 389 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.71 
 
 		 468 aa  134  3e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6210  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.81 
 
 		 480 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.596847  normal  0.481561 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6406  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.6 
 
 		 480 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0565  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.22 
 
 		 447 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3122  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.5 
 
 		 399 aa  133  6e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0276  HlyD family secretion protein  26.04 
 
 		 390 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0227266  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3320  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.35 
 
 		 389 aa  133  6.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0528  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.46 
 
 		 390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.178429 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0162  HlyD family secretion protein  26.51 
 
 		 481 aa  131  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0794  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.72 
 
 		 440 aa  131  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00028021  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4600  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.66 
 
 		 410 aa  131  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02941  HlyD family secretion protein  26.3 
 
 		 455 aa  130  5.0000000000000004e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107369  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0434  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  40.67 
 
 		 460 aa  130  6e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2986  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.55 
 
 		 443 aa  129  9.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4148  HlyD family secretion protein  25.17 
 
 		 441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>