More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1057 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  100 
 
 		 467 aa  948    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  45.01 
 
 		 457 aa  364  2e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.41 
 
 		 456 aa  305  9.000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.295152  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1890  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  40.41 
 
 		 456 aa  305  9.000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3075  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  39.01 
 
 		 473 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.775261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1500  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.34 
 
 		 473 aa  278  1e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1567  hemolysin secretion protein D  36.34 
 
 		 473 aa  277  3e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.496852  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1969  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.28 
 
 		 468 aa  267  2.9999999999999995e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.786777  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4926  HlyD family secretion protein  37.36 
 
 		 472 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3819  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36 
 
 		 514 aa  244  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33.33 
 
 		 511 aa  239  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2575  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.28 
 
 		 480 aa  236  5.0000000000000005e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303774 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6771  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.45 
 
 		 475 aa  230  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0020  leukotoxin secretion protein D  34.08 
 
 		 479 aa  228  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5422  HlyD family secretion protein  31.19 
 
 		 473 aa  223  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970488  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4164  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.56 
 
 		 469 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.833076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.82 
 
 		 447 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540903  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5004  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.66 
 
 		 447 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_003296  RS03671  hemolysin secretion-like transmembrane protein  33.48 
 
 		 447 aa  206  5e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2368  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.66 
 
 		 447 aa  205  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6495  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.41 
 
 		 479 aa  204  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3697  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.3 
 
 		 481 aa  204  4e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.108936 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1021  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  33.18 
 
 		 444 aa  203  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  27.81 
 
 		 434 aa  197  3e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.8 
 
 		 472 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.83 
 
 		 451 aa  179  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0883  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.58 
 
 		 491 aa  172  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0983  secretion protein HlyD family protein  28.64 
 
 		 439 aa  170  6e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.213399  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1159  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.73 
 
 		 466 aa  168  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.126981 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6669  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.77 
 
 		 466 aa  167  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00836718  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0567  secretion protein HlyD family  26.91 
 
 		 491 aa  157  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.41 
 
 		 465 aa  156  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.41 
 
 		 465 aa  156  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3811  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.26 
 
 		 451 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739118 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1802  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.14 
 
 		 452 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.520041 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1515  HlyD family secretion protein  35.43 
 
 		 227 aa  153  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.619726 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0636  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.37 
 
 		 674 aa  152  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1976  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.18 
 
 		 448 aa  151  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0565  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.17 
 
 		 447 aa  150  5e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1419  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.11 
 
 		 446 aa  149  8e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2093  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.79 
 
 		 468 aa  149  8e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0162  HlyD family secretion protein  27.82 
 
 		 481 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0311  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.56 
 
 		 460 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.76 
 
 		 439 aa  148  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3020  HlyD family secretion protein  40.85 
 
 		 179 aa  147  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.133267 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3593  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.47 
 
 		 460 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5105  secretion protein HlyD family protein  26.04 
 
 		 498 aa  146  8.000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001011  ABC-type protease exporter membrane fusion protein (MFP) family component PrtE/AprE  27.38 
 
 		 463 aa  146  9e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0382  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.01 
 
 		 460 aa  144  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2557  secretion protein HlyD  24.41 
 
 		 498 aa  144  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1460  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.12 
 
 		 453 aa  144  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5063  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  29.24 
 
 		 458 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3260  HlyD family secretion protein  27.84 
 
 		 460 aa  144  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07089  hypothetical protein  26.76 
 
 		 486 aa  142  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1292  HlyD family secretion protein  28.78 
 
 		 461 aa  141  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.969928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0382  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.67 
 
 		 460 aa  141  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3644  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.67 
 
 		 460 aa  141  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0475  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.27 
 
 		 460 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.205035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0892  acriflavine resistance protein  26.48 
 
 		 488 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00239109  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4148  HlyD family secretion protein  26.04 
 
 		 441 aa  140  6e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0730  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.2 
 
 		 455 aa  140  7e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.187305  normal  0.492023 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0511  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.11 
 
 		 441 aa  139  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0786  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.29 
 
 		 472 aa  139  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.378265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0366  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.33 
 
 		 460 aa  138  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3907  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.76 
 
 		 460 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.76 
 
 		 460 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3984  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.76 
 
 		 460 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4100  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.76 
 
 		 460 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4141  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.5 
 
 		 460 aa  139  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.504346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0164  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.74 
 
 		 487 aa  138  2e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.846875  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2986  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.31 
 
 		 443 aa  139  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0380  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.76 
 
 		 460 aa  138  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1101  secretion protein, HlyD family  24.27 
 
 		 463 aa  138  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6210  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.55 
 
 		 480 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.596847  normal  0.481561 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3047  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.35 
 
 		 477 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.666099  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.97 
 
 		 458 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000605389 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0184  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.74 
 
 		 458 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326203 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.54 
 
 		 427 aa  137  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862799 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4319  HlyD family secretion protein  26.53 
 
 		 484 aa  137  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0185  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.97 
 
 		 458 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.116801 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6406  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.59 
 
 		 480 aa  137  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0004  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.99 
 
 		 442 aa  136  8e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.197437  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0434  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  25.72 
 
 		 460 aa  136  8e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0585  membrane spanning export protein  30.25 
 
 		 391 aa  136  9e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.836061  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1212  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.22 
 
 		 453 aa  136  9e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6075  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.78 
 
 		 474 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0374496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0301  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.54 
 
 		 471 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3063  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.26 
 
 		 453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3769  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.54 
 
 		 471 aa  134  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2243  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.73 
 
 		 444 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2502  secretion protein  27.42 
 
 		 439 aa  133  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.867679 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0136  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.06 
 
 		 455 aa  133  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6372  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.78 
 
 		 474 aa  133  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17068  normal  0.732434 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3021  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.57 
 
 		 396 aa  133  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0405011 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0794  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.5 
 
 		 440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00028021  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2908  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.33 
 
 		 396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1474  secretion system protein D  25.82 
 
 		 378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1509  secretion system protein D  25.87 
 
 		 378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2889  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.86 
 
 		 396 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0810996 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2838  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.86 
 
 		 396 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>