More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1515 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1515  HlyD family secretion protein  100 
 
 
227 aa  448  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.619726 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4164  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  96.92 
 
 
469 aa  439  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.833076  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3020  HlyD family secretion protein  94.89 
 
 
179 aa  332  3e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.133267 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1969  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  43.36 
 
 
468 aa  181  7e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.786777  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2368  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  42.01 
 
 
447 aa  169  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  40.27 
 
 
457 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3075  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  45.12 
 
 
473 aa  165  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.775261  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  48.47 
 
 
456 aa  162  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.295152  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1890  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  48.47 
 
 
456 aa  162  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5004  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.91 
 
 
447 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.91 
 
 
447 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540903  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1500  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.65 
 
 
473 aa  157  1e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1567  hemolysin secretion protein D  36.2 
 
 
473 aa  157  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.496852  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2575  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.32 
 
 
480 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00303774 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4926  HlyD family secretion protein  40.36 
 
 
472 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03671  hemolysin secretion-like transmembrane protein  40.31 
 
 
447 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  35.43 
 
 
467 aa  153  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  35.51 
 
 
511 aa  149  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3819  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.86 
 
 
514 aa  148  8e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891918  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1021  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  36.2 
 
 
444 aa  141  8e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5422  HlyD family secretion protein  37.7 
 
 
473 aa  140  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970488  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6771  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.77 
 
 
475 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3697  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.45 
 
 
481 aa  139  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.108936 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0020  leukotoxin secretion protein D  33.33 
 
 
479 aa  135  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0983  secretion protein HlyD family protein  42.76 
 
 
439 aa  128  9.000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.213399  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6669  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.98 
 
 
466 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00836718  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3260  HlyD family secretion protein  32.16 
 
 
460 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.72 
 
 
460 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3984  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.72 
 
 
460 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3907  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.72 
 
 
460 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4100  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.72 
 
 
460 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6495  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.62 
 
 
479 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0475  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.6 
 
 
460 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.205035  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4319  HlyD family secretion protein  33 
 
 
484 aa  124  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0382  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.5 
 
 
460 aa  123  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3644  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.5 
 
 
460 aa  123  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0380  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33 
 
 
460 aa  123  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3063  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33 
 
 
453 aa  123  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3021  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.07 
 
 
396 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0405011 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2908  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.07 
 
 
396 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0382  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.28 
 
 
460 aa  122  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4141  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.19 
 
 
460 aa  122  6e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.504346  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1159  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.86 
 
 
466 aa  122  6e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.126981 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0883  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.9 
 
 
491 aa  122  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1212  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33 
 
 
453 aa  121  7e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3593  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.5 
 
 
460 aa  121  9e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.38 
 
 
458 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000605389 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2907  type I secretion membrane fusion protein HlyD family  31.65 
 
 
396 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.891206  normal  0.048093 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0185  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.38 
 
 
458 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.116801 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2838  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.65 
 
 
396 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  33.98 
 
 
468 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0184  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.38 
 
 
458 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.326203 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2889  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.65 
 
 
396 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0810996 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5063  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.43 
 
 
458 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1509  secretion system protein D  31.43 
 
 
378 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1460  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  33.01 
 
 
453 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1419  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.28 
 
 
446 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1976  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.83 
 
 
448 aa  119  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0434  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  32.46 
 
 
460 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0311  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.16 
 
 
460 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.95 
 
 
465 aa  118  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.95 
 
 
465 aa  118  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0004  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.38 
 
 
442 aa  118  6e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.197437  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1474  secretion system protein D  30.95 
 
 
378 aa  118  7e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  35.62 
 
 
434 aa  118  9e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.53 
 
 
451 aa  118  9e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0366  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31 
 
 
460 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1802  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.17 
 
 
452 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.520041 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2557  secretion protein HlyD  29.69 
 
 
498 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0136  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.88 
 
 
455 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3122  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.66 
 
 
399 aa  117  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0565  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  29.6 
 
 
447 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2759  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  29.81 
 
 
421 aa  116  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246245  normal  0.864922 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5105  secretion protein HlyD family protein  32.31 
 
 
498 aa  116  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2823  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.25 
 
 
443 aa  115  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.51941 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0842  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.3 
 
 
394 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0803  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.3 
 
 
394 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0827  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.3 
 
 
394 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.72853  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3148  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.32 
 
 
416 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3201  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.94 
 
 
471 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.195077  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0761  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30 
 
 
389 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011649  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4383  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.88 
 
 
394 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.915143  normal  0.374406 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3811  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.07 
 
 
451 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739118 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0528  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  34.95 
 
 
390 aa  113  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.178429 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0991  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.44 
 
 
389 aa  113  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6372  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.17 
 
 
474 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17068  normal  0.732434 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6075  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.17 
 
 
474 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0374496  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1882  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.05 
 
 
430 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3047  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.43 
 
 
477 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.666099  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4600  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.67 
 
 
410 aa  111  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1101  secretion protein, HlyD family  32.95 
 
 
463 aa  110  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  36.91 
 
 
508 aa  111  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.16 
 
 
472 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3320  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.93 
 
 
389 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0636  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.99 
 
 
674 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2412  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.29 
 
 
399 aa  108  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.449428  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1598  hlyD family secretion protein  29.5 
 
 
389 aa  108  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0549137  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2016  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.61 
 
 
480 aa  107  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.13 
 
 
427 aa  107  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0862799 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1817  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.97 
 
 
455 aa  107  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000964329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>