More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3020 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3020  HlyD family secretion protein  100 
 
 		 179 aa  358  2e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.133267 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4164  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  93.85 
 
 		 469 aa  337  8e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.833076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1515  HlyD family secretion protein  94.89 
 
 		 227 aa  332  2e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.619726 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  46.63 
 
 		 457 aa  163  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3075  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  42.46 
 
 		 473 aa  161  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.775261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1969  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  47.24 
 
 		 468 aa  159  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.786777  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2368  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  42.53 
 
 		 447 aa  157  5e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  46.63 
 
 		 456 aa  155  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.295152  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1890  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  46.63 
 
 		 456 aa  155  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  41.81 
 
 		 447 aa  154  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540903  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5004  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  41.81 
 
 		 447 aa  154  9e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_003296  RS03671  hemolysin secretion-like transmembrane protein  40.68 
 
 		 447 aa  149  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4926  HlyD family secretion protein  45.25 
 
 		 472 aa  147  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2575  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.2 
 
 		 480 aa  147  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303774 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  40.85 
 
 		 467 aa  147  9e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1500  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  41.98 
 
 		 473 aa  141  4e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1567  hemolysin secretion protein D  41.36 
 
 		 473 aa  141  4e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.496852  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  37.81 
 
 		 511 aa  137  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3819  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.82 
 
 		 514 aa  132  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1021  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  39.23 
 
 		 444 aa  131  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6771  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  39.44 
 
 		 475 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0983  secretion protein HlyD family protein  40.69 
 
 		 439 aa  121  5e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.213399  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5422  HlyD family secretion protein  38.71 
 
 		 473 aa  120  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970488  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  35.62 
 
 		 434 aa  118  3.9999999999999996e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0020  leukotoxin secretion protein D  37.04 
 
 		 479 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6669  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  41.21 
 
 		 466 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00836718  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3697  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.83 
 
 		 481 aa  114  7.999999999999999e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.108936 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1509  secretion system protein D  32.97 
 
 		 378 aa  113  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1474  secretion system protein D  32.97 
 
 		 378 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1460  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  35.9 
 
 		 453 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3063  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33.15 
 
 		 453 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1802  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.9 
 
 		 452 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.520041 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  35.11 
 
 		 451 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4319  HlyD family secretion protein  32.95 
 
 		 484 aa  112  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1101  secretion protein, HlyD family  33.33 
 
 		 463 aa  112  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3260  HlyD family secretion protein  33.96 
 
 		 460 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1419  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.46 
 
 		 446 aa  111  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0528  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  35 
 
 		 390 aa  111  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.178429 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0382  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.39 
 
 		 460 aa  111  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3644  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.39 
 
 		 460 aa  111  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0380  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.95 
 
 		 460 aa  111  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1212  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.58 
 
 		 453 aa  110  7.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  36.2 
 
 		 465 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  36.2 
 
 		 465 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3593  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.95 
 
 		 460 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6495  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.51 
 
 		 479 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3021  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  34.44 
 
 		 396 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0405011 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2907  type I secretion membrane fusion protein HlyD family  34.44 
 
 		 396 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.891206  normal  0.048093 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2838  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  34.44 
 
 		 396 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2908  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  34.44 
 
 		 396 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2889  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  34.44 
 
 		 396 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0810996 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0883  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.83 
 
 		 491 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0382  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.82 
 
 		 460 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  34.57 
 
 		 468 aa  107  6e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0761  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.9 
 
 		 389 aa  107  7.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0004  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.34 
 
 		 442 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.197437  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3122  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.33 
 
 		 399 aa  107  9.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.89 
 
 		 458 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000605389 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0565  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.52 
 
 		 447 aa  107  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3907  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.43 
 
 		 460 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0184  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.89 
 
 		 458 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326203 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4100  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.43 
 
 		 460 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0185  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.89 
 
 		 458 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.116801 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3984  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.43 
 
 		 460 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.43 
 
 		 460 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0434  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  31.82 
 
 		 460 aa  107  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5063  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.81 
 
 		 458 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5105  secretion protein HlyD family protein  34.52 
 
 		 498 aa  106  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1976  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.9 
 
 		 448 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4141  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.82 
 
 		 460 aa  105  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.504346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4383  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.71 
 
 		 394 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.915143  normal  0.374406 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0311  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.39 
 
 		 460 aa  105  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2823  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.33 
 
 		 443 aa  105  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.51941 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0803  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.56 
 
 		 394 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0827  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.56 
 
 		 394 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.72853  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0842  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.56 
 
 		 394 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0366  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.58 
 
 		 460 aa  104  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2557  secretion protein HlyD  32.14 
 
 		 498 aa  104  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.28 
 
 		 472 aa  103  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3811  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.69 
 
 		 451 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739118 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0475  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.68 
 
 		 460 aa  103  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.205035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0136  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.21 
 
 		 455 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3148  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  32.75 
 
 		 416 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1759  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.71 
 
 		 518 aa  102  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0119826 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0636  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.9 
 
 		 674 aa  102  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3047  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32.42 
 
 		 477 aa  101  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.666099  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  35.57 
 
 		 508 aa  100  8e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1159  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  31.9 
 
 		 466 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.126981 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1882  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.95 
 
 		 430 aa  99.4  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4148  HlyD family secretion protein  29.38 
 
 		 441 aa  99  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1598  hlyD family secretion protein  30.92 
 
 		 389 aa  99.4  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0549137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3201  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  32.53 
 
 		 471 aa  99  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.195077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1292  HlyD family secretion protein  30.22 
 
 		 461 aa  98.6  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.969928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0162  HlyD family secretion protein  31.25 
 
 		 481 aa  97.4  9e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2544  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  32.76 
 
 		 437 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.110449  normal  0.225812 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2301  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.07 
 
 		 468 aa  97.1  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0585  membrane spanning export protein  34.87 
 
 		 391 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.836061  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6372  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.75 
 
 		 474 aa  97.1  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17068  normal  0.732434 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6075  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.75 
 
 		 474 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0374496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0511  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.87 
 
 		 441 aa  96.7  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>